New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2873269 = | 51 (0.940) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 7.3% | coding (49/474 nt) | cigR | membrane protein |
? | NC_002947 | 2873374 = | 52 (0.980) | coding (154/474 nt) | cigR | membrane protein |
CCTTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGG > NC_002947/2873127‑2873405 | cctTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttgg > 8:137359/1‑149 (MQ=255) tCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCctc < 6:260675/148‑1 (MQ=255) tCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGGGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTTTAGTGTGGTGCAACCTCTCTCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCATTCATGACAGCCTTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCctc < 8:248498/148‑1 (MQ=255) aTCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCg < 3:41447/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCg > 6:158040/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTg > 3:330250/1‑149 (MQ=255) tgcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCggg > 4:73917/1‑149 (MQ=255) ggctccagtagctgcggtggccaccgaggatgcccagtacatcgccacggtcgatggacgggccgccgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattGCCTTGGCCTCTTGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGt < 6:200967‑M1/36‑1 (MQ=255) cAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttgg < 8:241483/119‑1 (MQ=255) cAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGt > 2:197746/1‑148 (MQ=255) gTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATg < 5:158040/149‑1 (MQ=255) tGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGc < 3:10746/130‑1 (MQ=255) tGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGc > 4:10746/1‑130 (MQ=255) tGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATgg < 7:137359/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCTATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCAGGTAATGGCaaa < 2:31777/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAg < 3:244920/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGc > 3:120018/1‑148 (MQ=255) gcACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGcc < 4:330250/149‑1 (MQ=255) gcACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGACAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCACAGGCCAGGGc > 4:8737/1‑148 (MQ=255) aCCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCaa < 3:73917/149‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttggc > 7:230250/1‑89 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttggc < 8:230250/89‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCa > 4:191229/1‑149 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCa > 1:27737/1‑149 (MQ=255) tgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACg < 1:197746/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAg < 7:243005/139‑1 (MQ=255) ggCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAg > 8:243005/1‑139 (MQ=255) ctcGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAg < 3:191229/149‑1 (MQ=255) gatggacgggccgccgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCa < 7:158602‑M1/89‑1 (MQ=255) gCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGcc > 2:202456/1‑147 (MQ=255) gCTCAAATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGcc > 6:99302/1‑147 (MQ=255) tCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACgg < 6:93057/123‑1 (MQ=255) acaTGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCccagggc > 1:163695/1‑149 (MQ=255) acaTGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCccagg < 1:202456/147‑1 (MQ=255) gCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAgg < 6:213123/109‑1 (MQ=255) gCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAgg > 5:213123/1‑109 (MQ=255) cAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGt < 5:307078/79‑1 (MQ=255) cAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGt > 6:307078/1‑79 (MQ=255) cAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTCCTCGCCGAACAGGGTAATGGCGAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCcagggccagggc > 5:88717/1‑148 (MQ=255) aGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCaa > 3:195085/1‑149 (MQ=255) cattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCg > 8:158602‑M1/38‑148 (MQ=255) ccAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCggg > 1:93614/1‑149 (MQ=255) ccAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCggg < 4:120018/149‑1 (MQ=255) ccAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCCGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCAACGGCCAGGGCAATTCggg > 3:71412/1‑149 (MQ=255) attgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCgg > 5:200967‑M1/37‑148 (MQ=255) tCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGggcggc < 3:8737/149‑1 (MQ=255) aTGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGCCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCca > 7:242050/1‑149 (MQ=255) tGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATgg > 1:193691/1‑70 (MQ=255) tGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATgg < 2:193691/70‑1 (MQ=255) ccGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAg > 8:36570/1‑146 (MQ=255) ccGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCag < 7:36570/149‑1 (MQ=255) gTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCagag > 6:130258/1‑149 (MQ=255) aCCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCcgg > 3:218527/1‑149 (MQ=255) cTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCcggcg > 6:298276/1‑149 (MQ=255) tCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCcggcgg > 6:19147/1‑149 (MQ=255) | CCTTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGG > NC_002947/2873127‑2873405 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |