New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3011368 = | 43 (0.800) | 4 (0.080) | 3/246 | NT | 9.3% | coding (429/1614 nt) | bcsG | endoglucanase |
? | NC_002947 | 3011486 = | 37 (0.720) | coding (547/1614 nt) | bcsG | endoglucanase |
GACTTCTCGTGGGACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAGCGCTTCTTCGCCAGTGAGCGC > NC_002947/3011222‑3011515 | gACTTCTCGTGGGACTATCTGCGCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGGTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCGGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCt > 7:52028/1‑149 (MQ=255) gtcccgcagccccacggcggacaggtcatcccaggccagcgagcagatgttgattaccagcaggtcgaacggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTgt < 3:71600‑M1/5‑1 (MQ=255) cccgcagccccacggcggacaggtcatcccaggccagcgagcagatgttgattaccagcaggtcgaacggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTgtc < 5:310343‑M1/6‑1 (MQ=255) ctcGTGGGACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTgtcgg > 1:23979/1‑149 (MQ=255) gTGGGACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTgtcg < 4:108755/145‑1 (MQ=255) gTGGGACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTgtcg > 3:108755/1‑145 (MQ=255) ggACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGACGGTcggcg < 2:128001/149‑1 (MQ=255) gACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATgg < 3:310387/135‑1 (MQ=255) aCTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCggcggc > 1:223779/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGcc < 8:92600/146‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTgt < 6:92885/127‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTgt > 5:92885/1‑127 (MQ=255) gtcatcccaggccagcgagcagatgttgattaccagcaggtcgaacggttgcacatcggcgctcacggcacggaacgccgtcaccccctcgcgctcactggcgatgaagcgctccagccag < 6:246840‑M1/1‑1 (MQ=255) gctgctGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTgg > 8:98691/1‑149 (MQ=255) atcccaggccagcgagcagatgttgattaccagcaggtcgaacggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCt > 8:323948‑M1/118‑120 (MQ=255) atcccaggccagcgagcagatgttgattaccagcaggtcgaacggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCt < 7:323948‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGcagg > 3:47361/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGcaggcc > 2:232341/1‑149 (MQ=255) catcaACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGGTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGcaggccaggc < 7:284994/147‑1 (MQ=255) atcaACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGcc < 2:223779/149‑1 (MQ=255) tcaACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGccc > 2:48535/1‑149 (MQ=255) agatgttgattaccagcaggtcgaacggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGc < 3:303098‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCg > 7:268178/1‑149 (MQ=255) gAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGt < 5:323575/147‑1 (MQ=255) gAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGt > 6:323575/1‑147 (MQ=255) gAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGt < 2:23979/147‑1 (MQ=255) gAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTgg > 6:86503/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCg < 1:232341/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTggcg < 1:37942/138‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTggcg > 2:37942/1‑138 (MQ=255) gcTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAg > 1:112845/1‑149 (MQ=255) gCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCg > 6:307580/1‑148 (MQ=255) cggttgctcatcggcactcacggcagggaacgccgtcacccgctcgcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAAc < 5:208741‑M1/74‑1 (MQ=255) gtggGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGc > 7:238781/1‑149 (MQ=255) gTTACCTGTACCTAAGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTCGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGCCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTCCCACt > 2:189957/1‑149 (MQ=255) ttACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTg < 8:52028/149‑1 (MQ=255) cTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTgcag > 3:94686/1‑148 (MQ=255) cTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTgcag > 6:22624/1‑148 (MQ=255) tACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCTCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCagcagc < 2:112845/149‑1 (MQ=255) cTAGGCCATTGGCTGCGCCTGATCACCCTGTGCCTGCTGGGGGTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGGTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGGCAGGCGccc < 4:119088/96‑1 (MQ=255) cTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGccc > 3:119088/1‑96 (MQ=255) cgcCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGa < 8:268178/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACa > 2:172176/1‑149 (MQ=255) tGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGc > 2:215232/1‑149 (MQ=255) tGAGCACCCAGAGCCTGCAGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTAGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCCGCCTGGCCGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGc > 4:17311/1‑149 (MQ=255) gcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAg > 4:303098‑M1/31‑147 (MQ=255) gcgctcactggcgaagaagcgctcaagccaGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAg > 6:208741‑M1/31‑147 (MQ=255) gCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTg < 8:238781/148‑1 (MQ=255) cACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTgg < 4:47361/148‑1 (MQ=255) cccTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCtt < 5:307580/149‑1 (MQ=255) cccTGAGCCTCCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCtt < 7:209959/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGa < 8:143193/149‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAg < 1:48535/147‑1 (MQ=255) gTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGa < 7:252517/108‑1 (MQ=255) gTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGa > 8:252517/1‑108 (MQ=255) gTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAGCGCTTCTTCGCCa < 7:98691/149‑1 (MQ=255) gCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTc < 2:234542/117‑1 (MQ=255) gCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAGCGCTTCTTCGCCAGt > 3:89077/1‑147 (MQ=255) GCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAGCGCTTCTTCGCCAGTGAgcgc > 5:86503‑M1/1‑148 (MQ=255) | GACTTCTCGTGGGACTATCTGCTCGAGCTGCTGGGCCGCTTCATCAACTGGAACCTGCTGGGGGCGCTGGCAATGTTGCTGGTGGGTTACCTGTACCTACGCCATTGGCTGCGCCTGAGCACCCTGAGCCTGCTGGGGTTGGCATGGCTGTCGGTCGGCGGCTTGCCGTCGCTGGTTGCAGGCCAGGCGCCCGGCGTGGCGGCGCGTACCGCAGCCGAACCCGCGCCTGCCACTGCAGCAGCCGACAATGCCACGCTCGACAGCTGGCTTGAGCGCTTCTTCGCCAGTGAGCGC > NC_002947/3011222‑3011515 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |