New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4046537 | 66 (1.220) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 5.9% | coding (183/906 nt) | PP_3567 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4046580 | 66 (1.300) | coding (140/906 nt) | PP_3567 | LysR family transcriptional regulator |
GCGATGACCCGCCGGCCGAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATCGACAGTG > NC_002947/4046397‑4046684 | gCGATGACCCGCCGGCCGAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGt > 7:70193/1‑149 (MQ=255) cGATGACCCGCCGGCCGAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTc < 8:70193/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCGGCCGAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGc < 4:291304/148‑1 (MQ=255) gccggccgAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGAcc > 6:101602/1‑149 (MQ=255) ggccgAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAccttgctcaaccgctcgacgc > 1:217955‑M1/1‑128 (MQ=255) gccgAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGgc < 2:191370/149‑1 (MQ=255) cgAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGgcgc > 2:63697/1‑149 (MQ=255) cgAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGgcgc > 1:230039/1‑149 (MQ=255) gAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGACCGCTGGAAGTAACAGGCGCCAGCATCGGTCAGGCTGACATGGcgcg > 4:193338/1‑149 (MQ=255) tCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGAcc < 3:221650/138‑1 (MQ=255) tCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGAcc > 4:221650/1‑138 (MQ=255) ccACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTAAAAGGTGCTTCAAAAAAGCCCCGTGCCCGCTGGAAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCg > 1:107155/1‑149 (MQ=255) cACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGc > 2:119460/1‑149 (MQ=255) aGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAg < 2:230039/149‑1 (MQ=255) gTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAccttgctcaaccgctcgacgcgccaggtcagcctgaccgaggctggcgccc < 2:217955‑M1/149‑52 (MQ=255) tACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGtggcgcc < 5:63908‑M2/147‑8 (MQ=255) acCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAccttgctcaaccgctcgacgcgccaggtcagcctgaccgaggctggcgcc < 5:118567‑M1/144‑51 (MQ=255) acCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAccttgctcaaccgctcgacgcgccaggtcagcctgaccgaggctggcgcc > 6:118567‑M1/1‑94 (MQ=255) acCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCg < 6:283168/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 2:156611/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 7:174895/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 4:179816/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 4:136677/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 3:250284/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGAc > 1:172831/1‑149 (MQ=255) tcctcGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAg > 8:73878/1‑149 (MQ=255) cctcGCCGCGTTCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAgg < 2:107155/149‑1 (MQ=255) tcGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAggg > 8:184554/1‑148 (MQ=255) gccgcGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCAt > 8:189708/1‑149 (MQ=255) gccgcGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCAt > 3:88080/1‑149 (MQ=255) gccgcGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCAt < 5:101602/149‑1 (MQ=255) cgcgATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATc > 3:268239/1‑148 (MQ=255) cgcaATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATc > 4:243506/1‑148 (MQ=255) cgATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGAc < 1:119460/149‑1 (MQ=255) cgATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGAc < 1:156611/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGgc > 2:304765/1‑95 (MQ=255) aTCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGgc < 1:304765/95‑1 (MQ=255) ggCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGa < 3:179816/148‑1 (MQ=255) gCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCAGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACg > 1:257995/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACgt < 7:73878/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACgtgt < 4:250284/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACgtgt > 1:200271/1‑149 (MQ=255) ggCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCAcc > 3:36183/1‑148 (MQ=255) gCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTTGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACcga > 1:304279/1‑149 (MQ=255) cATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCTGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACcgac > 7:123276/1‑149 (MQ=255) cATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACcgac < 3:193338/149‑1 (MQ=255) cATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACcgac < 7:16243/149‑1 (MQ=255) cGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATg < 4:36183/149‑1 (MQ=255) gCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAgg > 4:293783/1‑120 (MQ=255) gCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAgg < 3:293783/120‑1 (MQ=255) cTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCg < 2:200271/149‑1 (MQ=255) gTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGAc < 4:258045/118‑1 (MQ=255) gTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGAc > 3:258045/1‑118 (MQ=255) gTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGccc > 8:269944/1‑148 (MQ=255) ttCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGcc > 3:251896/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTgc > 6:193694/1‑149 (MQ=255) ccccGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCTGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCgg < 8:123276/148‑1 (MQ=255) ccccGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCgg < 8:174895/148‑1 (MQ=255) ccccGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCgg < 3:243506/148‑1 (MQ=255) ccGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGACTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGgcag > 2:192455/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGaaaa < 4:268239/149‑1 (MQ=255) gtagtaACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCtt > 8:103901/1‑149 (MQ=255) tagtaACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAACAGCCTTg > 8:290177/1‑149 (MQ=255) tagtaACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTg < 7:103901/149‑1 (MQ=255) tagtaACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTg < 7:184554/149‑1 (MQ=255) agtaACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCTGCAGAAAAGGCTTg < 2:172831/148‑1 (MQ=255) taACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGc > 6:16433/1‑120 (MQ=255) taACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGc < 5:16433/120‑1 (MQ=255) aCGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCAt < 2:257995/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATc < 7:269944/149‑1 (MQ=255) gggCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGtggcgcccgttactaccagcgggcacggggcatttttgaagcactggacgaggcggatgccagcatcgccgatcgcggcgaggagcctgtgggtgtac < 2:217955‑M2/149‑99 (MQ=255) ggCGCCAccttgctcaaccgctcgacgcgccaggtcagcctgaccgaggctggcgcccgttactaccagcgggcacggggcatttttgaagcactggacgaggcggatgccagcatcgccgatcgcggcgaggagcctgtgggtgta < 5:63908‑M1/147‑141 (MQ=255) ggCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGtggcgcccgttactaccagcgggcacggggcatttttgaagcactggacgaggcggatgccagcatcgccgatcgcggcgaggagcctgtgggt > 6:118567‑M2/1‑50 (MQ=255) ggCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGtggcgcccgttactaccagcgggcacggggcatttttgaagcactggacgaggcggatgccagcatcgccgatcgcggcgaggagcctgtgggt < 5:118567‑M2/144‑95 (MQ=255) ggCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATCGa < 2:304279/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATCGACAGTg > 1:335625/1‑149 (MQ=255) cAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATCGACAGTg < 5:14015/149‑1 (MQ=255) | GCGATGACCCGCCGGCCGAACTCCACTGGCAGGCTCAGGCGCAGTACACCCACAGGCTCCTCGCCGCGATCGGCGATGCTGGCATCCGCCTCGTCCA‑‑GTGCTTCAAAAATGCCCCGTGCCCGCTGGTAGTAACGGGCGCCAGCCTCGGTCAGGCTGACCTGGCGCGTCGAGCGGTTGAGCAAGGTGGCGCCCAGCGACGCTTCCAGGGCATCGACCAGACGTGTCACCGACGATGTCGCCAGCCCTAGCCTGCGCGCGGCAGCAGAAAAGCCTTGGGCATCGACAGTG > NC_002947/4046397‑4046684 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |