New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5156701 | 38 (0.700) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 10.8% | coding (223/813 nt) | PP_4540 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | = 5156768 | 30 (0.590) | coding (290/813 nt) | PP_4540 | alpha/beta family hydrolase |
CAGGACTGGGAGTTGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAA > NC_002947/5156575‑5156846 | cAGGACTGGGAGTTGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACtt < 1:152838/149‑1 (MQ=255) cTGGGAGTTGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGcaca < 1:56808/149‑1 (MQ=255) ggAGTTGCAGGTGCCGCTATTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAg > 6:19510/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCTGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAgg < 7:213556/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCatgccgcccatggacaagccgacgaagtgcaccg > 1:293153‑M1/1‑115 (MQ=255) ttGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGccc < 5:71567/149‑1 (MQ=255) gCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCgg > 7:65252/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCACTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGt > 8:140955/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCa < 4:9770/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTATTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCAc < 5:19510/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCAc < 8:184658/145‑1 (MQ=255) gCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCAc > 7:184658/1‑145 (MQ=255) aGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCtt < 1:126347/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCtt > 7:182779/1‑149 (MQ=255) ccgccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACtt > 8:84607/1‑117 (MQ=255) ccgccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACtt < 7:84607/117‑1 (MQ=255) ccgccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGt > 8:110335/1‑132 (MQ=255) ccgccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGt < 7:110335/132‑1 (MQ=255) ccgccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGt > 5:352069/1‑149 (MQ=255) gccACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTcc < 8:65252/149‑1 (MQ=255) cACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGCTCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCAt < 5:180066/149‑1 (MQ=255) gggTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGggcggc < 3:1625/149‑1 (MQ=255) ggTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCa > 1:207915/1‑149 (MQ=255) tACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTgg < 1:256580/84‑1 (MQ=255) tACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTgg > 2:256580/1‑84 (MQ=255) tCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCGGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCatgccgcccatggacaagccgacgaagtgcaccgggcctgtgtgcaagtgttcgagcagggccagcaggtcgg > 6:189387‑M1/1‑75 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGTTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGATCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCAATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 2:22795/1‑149 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCatgccgcccatggacaagccgacgaagtgcaccgggcctgtgtgcaagtgttcgagcagggccagcaggtcggca < 2:293153‑M1/148‑76 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 5:26369/1‑149 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 3:157060/1‑149 (MQ=255) gACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCGGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCatgccgcccatggacaagccgacgaagtgcaccgggcctgtgtgcaagtgttcgagcagggccagcaggtcggcactga < 5:189387‑M1/149‑80 (MQ=255) gACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCa < 6:26369/149‑1 (MQ=255) gcgGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGcc > 1:34143/1‑149 (MQ=255) ggCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggc > 6:176459‑M2/1‑128 (MQ=255) cACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGc < 6:171576/65‑1 (MQ=255) cACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGc > 5:171576/1‑65 (MQ=255) ggTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGacca < 8:182779/149‑1 (MQ=255) tCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGaccacc < 5:319750/149‑1 (MQ=255) gCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTAGCACACAGGCCCGGTGCAAATCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATCGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACAACCCt > 7:103717/1‑149 (MQ=255) cTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCAGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCt > 5:130834/1‑148 (MQ=255) cGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAAt < 6:352069/149‑1 (MQ=255) ccAGATCGCCACCTTCAGTGCCGTCCTGCTGGCCCTGCTCGATCACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTGGGATTTTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCTTc < 1:22795/148‑1 (MQ=255) tCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatccggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtc < 5:189387‑M2/149‑71 (MQ=255) tGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatctggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtccat < 2:293153‑M2/148‑74 (MQ=255) gCCGACCatgccgcccatggacaagccgacgaagtgcaccgggcctgtgtgcaagtgttcgagcagggccagcaggtcggcactgaaggtggcgatctggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggcc > 6:176459‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatccggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtccatga > 6:189387‑M2/1‑73 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGt < 2:34143/148‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCaa > 8:190755/1‑149 (MQ=255) | CAGGACTGGGAGTTGCAGGTGCCGCTGTTCAGCCGCCACTACCGGGTGATACTCATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAA > NC_002947/5156575‑5156846 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |