New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5156701 | 38 (0.700) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 10.8% | coding (223/813 nt) | PP_4540 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | = 5156768 | 30 (0.590) | coding (290/813 nt) | PP_4540 | alpha/beta family hydrolase |
ATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGGCGCGCATCCTCAGTGTC > NC_002947/5156629‑5156913 | aTGGACATCCGCGGCCACGTTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGATCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCAATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 2:22795/1‑149 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 5:26369/1‑149 (MQ=255) aTGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCtt > 3:157060/1‑149 (MQ=255) gACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCa < 6:26369/149‑1 (MQ=255) gcgGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGcc > 1:34143/1‑149 (MQ=255) ggCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggc > 6:176459‑M2/1‑128 (MQ=255) ggTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGacca < 8:182779/149‑1 (MQ=255) tCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGaccacc < 5:319750/149‑1 (MQ=255) gCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTAGCACACAGGCCCGGTGCAAATCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATCGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACAACCCt > 7:103717/1‑149 (MQ=255) cTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCAGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCt > 5:130834/1‑148 (MQ=255) cGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAAt < 6:352069/149‑1 (MQ=255) ccAGATCGCCACCTTCAGTGCCGTCCTGCTGGCCCTGCTCGATCACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTGGGATTTTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCTTc < 1:22795/148‑1 (MQ=255) tCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatccggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtc < 5:189387‑M2/149‑71 (MQ=255) tGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatctggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtccat < 2:293153‑M2/148‑74 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatccggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtccatga > 6:189387‑M2/1‑73 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGt < 2:34143/148‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCaa > 8:190755/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCa > 4:282134/1‑149 (MQ=255) ccTACTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCaa > 4:22011/1‑120 (MQ=255) ccTACTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCaa < 3:22011/120‑1 (MQ=255) tGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCg > 2:323237/1‑148 (MQ=255) cGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGc > 8:252431/1‑145 (MQ=255) cGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGc < 7:252431/145‑1 (MQ=255) gAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGa > 2:12696/1‑149 (MQ=255) gAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGAGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGa > 6:229697/1‑149 (MQ=255) acTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTgg < 4:157060/149‑1 (MQ=255) acTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTgg < 6:130834/149‑1 (MQ=255) ttGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGc > 3:77624/1‑149 (MQ=255) cccGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTCACTGGGCGTGGTGGCTc > 8:163380/1‑148 (MQ=255) cGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATggtcggcactgaaggtggcgatctggtaaccgtcagcgggtttgtcggagcgaccgtggccgcggatgtccatgagtatcacccggtagtggcggctgaacagcggcacctgcaa > 1:293153‑M2/1‑34 (MQ=255) cACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGTCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCTAGCGCt < 8:103717/148‑1 (MQ=255) ttCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAgc > 7:46035/1‑142 (MQ=255) ttCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAgc < 8:46035/142‑1 (MQ=255) tcgGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTg > 1:298076/1‑149 (MQ=255) gCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGgcg > 8:4356/1‑149 (MQ=255) cTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTAAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGgcgc > 8:298380/1‑149 (MQ=255) gggCTGCATTGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACGTCCGTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGTCTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGcc < 5:249684/134‑1 (MQ=255) gggCCGCATGGACGGCTACCACATTGCCCTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGACAACAGCGCCCCTGAGGACAAGCGACGCACACGCACTGACAGTGCCTGCAGGCTCAAGCGCTGGAGcc > 6:249684/1‑134 (MQ=255) ggcggcATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGGCGCGCATCCTCa < 7:190755/148‑1 (MQ=255) gcATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGGCGCGCATCCTCAGTGTc < 2:298076/149‑1 (MQ=255) | ATGGACATCCGCGGCCACGGTCGCTCCGACAAACCCGCTGACGGTTACCAGATCGCCACCTTCAGTGCCGACCTGCTGGCCCTGCTCGAACACTTGCACACAGGCCCGGTGCACTTCGTCGGCTTGTCCATGGGCGGCATGGTCGGCTTCCAGTTTGCCGTCGACCACCCTCAATGGTTGCGCAGCCTGTGCATCGTCAACAGCGCCCCTGAGGTCAAGCGCCGCACCCGCAGTGACTGGGCGTGGTGGCTCAAGCGCTGGAGCCTGGCGCGCATCCTCAGTGTC > NC_002947/5156629‑5156913 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |