New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5852239 = | 70 (1.290) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 5.9% | coding (55/1089 nt) | PP_5129 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5852274 = | 60 (1.150) | coding (20/1089 nt) | PP_5129 | hypothetical protein |
TCACGCACTTCAGTAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGTTGTAG > NC_002947/5852094‑5852386 | tCACGCACTTCAGTAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAAc > 1:231211/1‑149 (MQ=255) tgtcccagttgctgcccttctgggaattgtctgctacaacgaagctttgaaggggcgtgtcgacaaggaggttcagcaacgtcgattgaatctccctgtgtatgctcgtcctgggtggtacttctaatgatccactttatgcaaggTaa < 6:266319‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGCACTTCAGTAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGCGTTTGCAGCCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAACC‑GCTCCTTGAACATCACCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTTTTAACTGTGTTAAc > 1:244366/1‑148 (MQ=255) cAGTAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGACCATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCg > 2:157796/1‑149 (MQ=255) tgcccttctgggaattatctgctacaacgaagctttgaaggggcgtgtcgacaaggaggttcagcaacgtcgattgaatctccctgtgtatgctcgtcctgggtggtacttctaatgatccactttatgcaaggTAACCAGCGCTTCgg < 7:292628‑M1/15‑1 (MQ=255) tAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGcc < 7:157201/149‑1 (MQ=255) caaacaTCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑g < 5:202158/149‑1 (MQ=255) aaacaTCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑gg > 7:255109/1‑149 (MQ=255) aaacaTCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑gg > 5:216107/1‑149 (MQ=255) aaacaTCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAA‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACACATACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑gg > 3:212175/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCcag > 6:318572/1‑149 (MQ=255) ccGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCcagcag < 5:318572/149‑1 (MQ=255) ccGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCAGCCTT‑GGCCTCcagcag > 8:32478/1‑149 (MQ=255) cGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAgg < 1:131953/149‑1 (MQ=255) ggTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCcagcag < 4:248923/147‑1 (MQ=255) ggTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCcagcag > 3:248923/1‑147 (MQ=255) cTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCt < 7:78938/149‑1 (MQ=255) tACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCtt > 6:71429/1‑149 (MQ=255) aCCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTg > 2:84265/1‑149 (MQ=255) ccTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTg > 1:253429/1‑148 (MQ=255) ccTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGc < 2:244366/149‑1 (MQ=255) caacgaagctttgaaggggcgtgtcgacaaggaggttcagcaacgtcgattgaatctccctgtgtatgctcgtcctgggtggtacttctaatgatccactttatgcaaggTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCtt > 8:292628‑M1/111‑149 (MQ=255) tttCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATa > 3:122121/1‑148 (MQ=255) ttCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAACGGCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCAT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATa > 1:75985/1‑148 (MQ=255) ttCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATa > 2:146398/1‑147 (MQ=255) gC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTg < 2:231211/149‑1 (MQ=255) gcaggcagCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATc < 6:216107/148‑1 (MQ=255) aggcagCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCAt < 8:156292/148‑1 (MQ=255) aggcagCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTACGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCag > 3:78051/1‑147 (MQ=255) cagcagcaTACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCTGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGa < 7:32478/149‑1 (MQ=255) cagcaTACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGt < 8:255109/149‑1 (MQ=255) gcaTACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTac > 3:310403/1‑149 (MQ=255) aTACTGGCGATGGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTacca < 6:161518/149‑1 (MQ=255) tcGATAGTTCTCGACAAAAC‑TCTCCTTGAACATCAGAGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGACTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTg < 8:213120/125‑1 (MQ=255) gCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCGTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATAACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGCTTACCTTGCATAAAGTg > 7:213120/1‑126 (MQ=255) gCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGt > 8:29452/1‑125 (MQ=255) gCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGt < 7:29452/125‑1 (MQ=255) gATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGAc < 2:253429/149‑1 (MQ=255) gcaacgtcgattgaatctccctgtgtatgctcgtcctgggtggtacttctaatgatccacttatgcaaggTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTAcc < 1:296209‑M1/37‑1 (MQ=255) gcaacgtcgattgaatctccctgtgtatgctcgtcctgggtggtacttctaatgatccacttatgcaaggTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTAcc > 2:296209‑M1/71‑107 (MQ=255) gACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATa < 5:71429/146‑1 (MQ=255) gACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATa < 1:84265/146‑1 (MQ=255) aaaaC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGTCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACTAGCATACACAgg < 4:78051/149‑1 (MQ=255) aaaaC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGAGCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAgg > 4:74204/1‑149 (MQ=255) aaC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAgg > 4:259098/1‑147 (MQ=255) c‑GCTCGTTGAACATCTGCGCGATGCCTTTCCCCATCATCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACGAGCGGTTCGGCGTT‑GGCCTGCAGCAGGTTACCTTGAATTAATTGGATCATTAGAAGTAGCACCGAGGACGAGCATACACAGGgaga < 4:122121/149‑1 (MQ=255) cTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACAACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCa > 5:12835/1‑148 (MQ=255) ttGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAg < 6:99843/129‑1 (MQ=255) ttGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAg > 5:99843/1‑129 (MQ=255) cAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGtt > 5:239113/1‑78 (MQ=255) cAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGtt < 6:239113/78‑1 (MQ=255) aGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATcaaatcgg > 1:48157/1‑141 (MQ=255) aGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTg < 4:310403/148‑1 (MQ=255) ccTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCAT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAAcctcc < 2:75985/149‑1 (MQ=255) cTTTCCCCATCACCCCTTCGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCATCAGGTTACCTTGCATAATGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAAcctcc < 4:212175/148‑1 (MQ=255) cTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGATGCTGAAcctcct > 2:300572/1‑149 (MQ=255) tttCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGt > 4:327086/1‑135 (MQ=255) tttCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGt < 3:327086/135‑1 (MQ=255) cccATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGa > 4:72616/1‑104 (MQ=255) cccATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGa < 3:72616/104‑1 (MQ=255) ccATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCAtt > 1:119462/1‑83 (MQ=255) ccATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCAtt < 2:119462/83‑1 (MQ=255) aCCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACg < 1:157796/148‑1 (MQ=255) cccTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAAc < 6:205610/131‑1 (MQ=255) cccTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAAc > 5:205610/1‑131 (MQ=255) ccTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTATAAGTACAACCCAGGACGAGCATACACAGGGCGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGAAACTcccc > 2:158421/1‑149 (MQ=255) ccTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGcccc > 3:88539/1‑149 (MQ=255) ccTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTA‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCTTTAGAAGTACCCCCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAAGCTCCTTGACGCCACGcccc > 2:163592/1‑149 (MQ=255) ttAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTTGGGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGc > 1:200784/1‑149 (MQ=255) ttAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAggg < 7:148381/98‑1 (MQ=255) ttAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAggg > 8:148381/1‑98 (MQ=255) taCTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTc < 5:301443/148‑1 (MQ=255) aCTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTc < 3:259098/148‑1 (MQ=255) aCTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCg > 4:6285/1‑149 (MQ=255) aCTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCg > 2:228404/1‑149 (MQ=255) aCTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCg < 1:228404/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCATTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTc > 6:301443/1‑147 (MQ=255) tgtgTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGtt > 6:43211/1‑149 (MQ=255) gtgtTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGTTg > 6:42219/1‑149 (MQ=255) tgtTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGtt < 1:146398/147‑1 (MQ=255) ttAATCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACCCCCCTTCAAAGCTTCGTTg > 7:283683/1‑146 (MQ=255) ttAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGTTGTAg < 3:6285/149‑1 (MQ=255) | TCACGCACTTCAGTAACAAACATCTTCCCGGTAACTACCTCTTTCGC‑TTTGCAGGCAGCAGCATACTGGCGATAGTTCTCGACAAAAC‑GCTCCTTGAACATCAGCGCGATGCCTTTCCCCATCACCCCTACGGTGTTAACTGTGTTAACCAGCGCTTCGGCCTT‑GGCCTCCAGCAGGTTACCTTGCATAAAGTGGATCATTAGAAGTACCACCCAGGACGAGCATACACAGGGAGATTCAATCGACGTTGCTGAACCTCCTTGTCGACACGCCCCTTCAAAGCTTCGTTGTAG > NC_002947/5852094‑5852386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |