New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 102602 = | 68 (1.260) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 5.3% | coding (1422/2052 nt) | prlC | oligopeptidase A |
? | NC_002947 | 102640 = | 76 (1.450) | coding (1460/2052 nt) | prlC | oligopeptidase A |
CTGCAAAGCCCGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGACCTGCTGGA > NC_002947/102492‑102784 | gtagtgaccagaaatcagtgccaggccttccggctcccagcaccagttttccatgaactggctgggcagctcgaccgcatcccaggccacgccgttgatgccggacacgcCGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCgg > 6:156834‑M1/111‑149 (MQ=255) cgatctcagaaatcagtgccaggccttccggctcccagcaccagttttccatgaactggctgggcagctcgaccgcatcccaggccacgccgttgatgccggacacgcCGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGc > 5:53595‑M1/109‑148 (MQ=255) cAAAGCCCGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCgt > 2:107869/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCggacac < 1:147805/149‑5 (MQ=255) aaGCCCGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTGACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCTCCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCgtgt < 8:316572/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCgg < 8:27247/149‑1 (MQ=255) agaaatcagtgccaggccttccggctcccagcaccagttttccatgaactggctgggcagctcgaccgcatcccaggccacgccgttgatgccggacacgcCGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCAGGc < 6:53595‑M1/40‑1 (MQ=255) aaatcagtgccaggccttccggctcccagcaccagttttccatgaactggctgggcagctcgaccgcatcccaggccacgccgttgatgccggtcacg‑‑GCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCa > 4:261354‑M1/99‑149 (MQ=255) gCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCaa > 1:148888/1‑149 (MQ=255) cAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACg > 4:217973/1‑149 (MQ=255) cAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACg > 4:213684/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGt < 6:338881/149‑1 (MQ=255) tgCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTg < 5:179102/144‑1 (MQ=255) tgCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTg > 6:179102/1‑144 (MQ=255) tgCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTg < 2:148888/149‑1 (MQ=255) aaCTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGa > 6:271832/1‑149 (MQ=255) cTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTg < 8:173777/144‑1 (MQ=255) cTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTg > 7:173777/1‑144 (MQ=255) 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> 7:98782/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTc > 2:85715/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTc > 7:168409/1‑149 (MQ=255) cccGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTc > 2:298607/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACAACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAg > 5:310985/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGc > 5:90634/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTTCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATg < 2:5201/136‑1 (MQ=255) gcgcCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATg > 1:5201/1‑136 (MQ=255) gcCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑Ccca < 8:168409/149‑1 (MQ=255) ccGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑Cccagcc < 8:176238/149‑1 (MQ=255) gCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑Cccagccag > 2:205584/1‑149 (MQ=255) 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aCCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGc < 7:95152/148‑1 (MQ=255) aCCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGc < 3:112619/148‑1 (MQ=255) ccGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAAATGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCACGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGcccc > 8:121041/1‑149 (MQ=255) gCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAg < 7:143232/149‑1 (MQ=255) aTTGATCATGCCGGCGTGTCCGGCATCTACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTGGAGCTG‑CCCAGGCATTTGATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGa < 3:67823/149‑1 (MQ=255) aTTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGGGGCCGGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGa < 6:235738/149‑1 (MQ=255) aGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGACctg < 1:317439/149‑1 (MQ=255) cATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGGCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGGCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGACctgct > 5:207452/1‑149 (MQ=255) ccgGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGACCTGCTGGa > 3:323169‑M2/4‑148 (MQ=255) | CTGCAAAGCCCGGTGGCCAACCTGGTGTGCAACTTCACCCCGGCCGCGCCCCGCAAGCCCGCGCTGCTGACCCACGATGAAGTCACCACCCTGTTCCACGAATTCGGTCACGGCCTGCACCACATGCTGACCCGCATTGAGCATGCCGGCGTGTCCGGCATCAACGGCGTGGCCTGGGATGCGGTCGAGCTG‑CCCAGCCAGTTCATGGAAAACTGGTGCTGGGAGCCGGAAGGCCTGGCACTGATTTCTGGTCACTACGAAACCGGCGCCGCCCTGCCCCAGGACCTGCTGGA > NC_002947/102492‑102784 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |