| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 549643 | 58 (1.070) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.5% | coding (318/1194 nt) | tufB | elongation factor Tu‑B |
| ? | NC_002947 | = 549666 | 49 (0.960) | coding (341/1194 nt) | tufB | elongation factor Tu‑B | |||||
CGCTCACGTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTCCAC > NC_002947/549520‑549804 | cGCTCACGTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCg < 2:157630‑M2/148‑2 (MQ=255) aCGTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCgcaaacc < 8:54520‑M2/149‑8 (MQ=255) aCGTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCgcaaacc < 4:148288‑M2/149‑8 (MQ=255) gTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCg > 5:247997/1‑149 (MQ=34) cttgTACAACTCCAACATTCGTCCCTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGGAACGCTGACTACGTGAATAACATGTGCACCGGTGTCTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGt < 1:103052/146‑1 (MQ=11) cGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGt > 2:60135/1‑148 (MQ=34) gAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTg < 6:247997/148‑1 (MQ=34) gAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGa < 1:60135/149‑1 (MQ=34) gAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTC‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGa > 5:107211/1‑149 (MQ=21) tACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGca > 5:315697/1‑149 (MQ=34) aaCTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGAGATCATGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACAt > 2:52155/1‑149 (MQ=21) cTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAATCCCGTGAGCACATcc > 2:133888/1‑149 (MQ=21) tCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCct > 1:105518/1‑149 (MQ=34) aaCATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCctgct < 3:294383/149‑1 (MQ=35) aaCATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCctgct < 2:189329/149‑1 (MQ=35) gTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCg > 8:220592/1‑148 (MQ=34) cTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTTGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACGCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAgg < 3:59706/149‑1 (MQ=21) cGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCTCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTa < 5:352030/148‑1 (MQ=17) aCGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGt > 8:292887/1‑148 (MQ=34) gTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTcc > 4:152509/1‑149 (MQ=34) gTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGAGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTcc < 7:220592/149‑1 (MQ=21) gACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTa > 6:323501/1‑149 (MQ=34) cccAGGTCACGCGGACTACCTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATc < 6:107211/148‑1 (MQ=21) ccAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGt < 1:52155/149‑1 (MQ=34) cAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTg < 5:323501/149‑1 (MQ=34) aGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTgg < 7:292887/149‑1 (MQ=34) aCGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTc < 3:148288/149‑1 (MQ=34) cGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTcc > 3:339179/1‑149 (MQ=34) gCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCt < 1:157630/149‑1 (MQ=34) aCTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAAc < 3:134075/149‑1 (MQ=34) gTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGc < 3:152509/149‑1 (MQ=34) tGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGcc > 5:148695/1‑149 (MQ=35) tGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGcc < 7:30863/149‑1 (MQ=35) aagaaCATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGa < 7:54520/149‑1 (MQ=37) gaaCATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCa < 4:160373/105‑1 (MQ=35) gaaCATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCa > 3:160373/1‑105 (MQ=35) cATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGACGCCGATGGTCCGATGCAGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTgg > 3:290567/1‑149 (MQ=255) aTGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTgg > 8:144990/1‑148 (MQ=37) gATCAGCTGTG‑CTGCCGAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCgcaaacc > 8:121539‑M2/1‑66 (MQ=255) gATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCgcaaacc < 7:121539‑M2/73‑8 (MQ=255) aTCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAg < 6:315697/148‑1 (MQ=37) aCCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAgacga < 7:144990/149‑1 (MQ=37) ccAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAgctgc < 2:105518/149‑1 (MQ=37) cAGATGGACGGCGCGATCCTGGTCTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAgctgct > 8:318970/1‑149 (MQ=37) gATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTc < 6:45653/80‑1 (MQ=39) gATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTc > 5:45653/1‑80 (MQ=39) cGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTgg < 6:148695/149‑1 (MQ=39) cGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTACCGTACATCGTGGTCTTACTGAACAAGGCCGAACTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGAAACTgg > 8:289954/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATg > 5:121085/1‑148 (MQ=39) ccTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATg > 5:126585/1‑148 (MQ=39) cTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCacaaaccaggatcgcgccgtccatctgggcagcaccggtgatcatgttcttcacgtagtcagcgtgacctgggcagtcaac > 8:99459‑M2/1‑32 (MQ=255) cTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCacaaaccaggatcgcgccgtccatctgggcagcaccggtgatcatgttcttcacgtagtcagcgtgacctgggcagtcaac < 7:99459‑M2/113‑82 (MQ=255) tGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCgcaaaccaggatcgcgccgtccatctgggaagcaccggtgatcatgttcttcacgtagtcagcgtgacctgggcagtcaacgtgagcgtagtgacgaatgttcgagttgtactcgacg < 8:51228‑M2/149‑119 (MQ=255) tGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATgg > 2:293799/1‑147 (MQ=39) gTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGaa < 4:339179/147‑1 (MQ=39) gTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGaa < 1:293799/147‑1 (MQ=39) tGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTc < 7:105823/148‑1 (MQ=39) cTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGCCGAGATGGAAGTTcgc < 7:318970/148‑1 (MQ=255) tCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGCCCTGGTAGACGCCGCTGAGCTGCTGGAACTGGTGGAGATTGAAGTTcgcgc > 8:147300/1‑148 (MQ=255) gATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTTAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGAcc < 8:7338/142‑1 (MQ=255) gATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTc > 5:159623/1‑149 (MQ=39) gATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGACTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGAAGGAAGTTCGCGACctagatcg > 7:7338/1‑143 (MQ=255) ggTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTCCa < 4:290567/148‑1 (MQ=39) cGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTCCAc > 7:313854/1‑139 (MQ=39) cGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTCCAc < 8:313854/139‑1 (MQ=39) | CGCTCACGTCGAGTACAACTCGAACATTCGTCACTACGCTCACGTTGACTGCCCAGGTCACGCTGACTACGTGAAGAACATGATCACCGGTG‑CTGCCCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTTTGCTCGGCCGCCGATGGTCCGATGCCGCAAACCCGTGAGCACATCCTGCTGTCCCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCGTGGTCTTCCTGAACAAGGCCGACCTGGTAGACGACGCTGAGCTGCTGGAACTGGTCGAGATGGAAGTTCGCGACCTGCTGTCCAC > NC_002947/549520‑549804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |