New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 714073 | 58 (1.070) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 6.1% | coding (87/948 nt) | ispH | 4‑hydroxy‑3‑methylbut‑2‑enyl diphosphate reductase |
? | NC_002947 | = 714124 | 69 (1.360) | coding (138/948 nt) | ispH | 4‑hydroxy‑3‑methylbut‑2‑enyl diphosphate reductase |
GAGCCGAGCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGAAAGTGTTCGATGC > NC_002947/713978‑714267 | gAGCCGAGCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCgtggtg < 7:274881/147‑1 (MQ=255) gCCGAGCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGgaag > 3:309326‑M2/1‑145 (MQ=255) cGAGCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGgaagac > 6:144036‑M2/1‑143 (MQ=255) gCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTg > 3:223634/1‑149 (MQ=255) cATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGc < 2:187372/149‑1 (MQ=255) tGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGAGCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGt < 5:308213/149‑1 (MQ=255) gCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGCAAGACTTGCGt > 4:140511/1‑148 (MQ=255) cAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTaa > 1:24700/1‑149 (MQ=255) aaaTCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAAc > 3:144925/1‑149 (MQ=255) aaaTCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGCAAGACTTGCGTAAc < 3:140511/149‑1 (MQ=255) tCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACcgc > 4:541/1‑149 (MQ=255) aaCTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCgcggc < 4:223634/149‑1 (MQ=255) aaCTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCCTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGAGCCACGAACTGGTGCACTACAAGTTCGTGGTTGAAGACTTGCGTAACCgcggc > 8:227662/1‑149 (MQ=255) cTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGgcgc > 4:83878/1‑149 (MQ=255) gCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCAt > 6:35728/1‑149 (MQ=255) aaCCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGga > 8:59113‑M2/1‑120 (MQ=255) aaCCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGga < 7:59113‑M2/122‑3 (MQ=255) aaCCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCtt > 4:17/1‑149 (MQ=255) aCCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCttt < 4:197335/149‑1 (MQ=255) aCCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCttt < 5:160165/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGt < 4:333714/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCACGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGt > 1:275126/1‑149 (MQ=255) cgcCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTgg < 2:99753/146‑1 (MQ=255) ggTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCACGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGc < 2:275126/149‑1 (MQ=255) tCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAATGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCg > 1:59352/1‑149 (MQ=255) aCCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGAc > 2:279562/1‑149 (MQ=255) ggCGATCGAGATCCTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATg < 7:227662/149‑1 (MQ=255) gCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGa > 8:24960/1‑146 (MQ=255) gCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGa < 7:24960/146‑1 (MQ=255) tCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATgtcatc < 4:144925/149‑1 (MQ=255) gcaTCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAAGCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATgtcatcgtc < 1:227010/147‑1 (MQ=255) cGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCt > 1:214448/1‑149 (MQ=255) tCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCtt > 2:283059/1‑148 (MQ=255) aaCCGCGCGCTGGACTTATTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa < 6:9722/148‑1 (MQ=255) aaCCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa < 3:541/148‑1 (MQ=255) aaCCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAg > 2:161765/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGAt > 8:300266/1‑130 (MQ=255) ccGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGAt < 7:300266/130‑1 (MQ=255) cgcgcTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGcc > 3:34428/1‑148 (MQ=255) gcgcTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa < 1:35076/142‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa > 2:35076/1‑142 (MQ=255) cTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGgaagacttccagcgcgcggttgacgatctcgatcgcccggtcgaccccggcgcagaagccgcgagggttggcgagtttgatttgca < 1:55270‑M2/149‑87 (MQ=255) cTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACgg < 2:214448/149‑1 (MQ=255) tGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGgaagacttccagcgcgcggttgacgatctcgatcgcccggtcgaccccggcgcagaagccgcgagggttggcgagtttgatttgcat < 6:259752‑M2/149‑88 (MQ=255) tGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGgt > 4:18556/1‑149 (MQ=255) gAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGgtgt > 7:100163/1‑149 (MQ=255) gAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGgtgt > 1:332379/1‑149 (MQ=255) tCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTcc < 2:332379/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCtt < 1:35803/128‑1 (MQ=255) ttCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCtt > 2:35803/1‑128 (MQ=255) ttCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTcc > 6:177133/1‑147 (MQ=255) cGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCa < 3:184083/147‑1 (MQ=255) cccGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGgtg < 5:78809/137‑1 (MQ=255) cccGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGgtg > 6:78809/1‑137 (MQ=255) ccgccgATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAaga > 4:168375/1‑86 (MQ=255) ccgccgATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAaga < 3:168375/86‑1 (MQ=255) ccgccgATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGt < 3:17/149‑1 (MQ=255) ccgccgATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGt > 5:39917/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGgaagacttccagcgcgcggttgacgatctcgatcgcccggtcgaccccggcgcagaagccgcgagggttggcgagtttgatttgcatgctcggctccaggcttacagggc > 2:55270‑M2/1‑37 (MQ=255) tgtgCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAgg < 3:83878/146‑1 (MQ=255) tgtgCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAg < 4:34428/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCACGAAATGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCa < 2:59352/144‑1 (MQ=255) tgCGCCACGAAGTGGTGCATAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAgct > 3:296041/1‑149 (MQ=255) gcgcCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa < 1:296072/110‑1 (MQ=255) gcgcCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCa > 2:296072/1‑110 (MQ=255) gcgcCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAgctg > 1:116090/1‑149 (MQ=255) cgcCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAgctgc > 2:204652/1‑149 (MQ=255) ccACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGctgctg > 7:69277/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCg > 7:158254/1‑149 (MQ=255) gtggtgCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTgg < 5:177133/149‑1 (MQ=255) gtggtgCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTgg < 2:116090/149‑1 (MQ=255) gtgCACAACAAGTTCGTGGTGgaagacttccagcgcgcggttgacgatctcgatcgcccggtcgaccccggcgcagaagccgcgagggttggcgagtttgatttgcatgctcggctccaggcttacagggccttcacctcgaggatctc > 5:259752‑M2/1‑21 (MQ=255) cacaACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGa > 1:150296/1‑148 (MQ=255) aaaacaaGTTCGTGGTGCACTACTTGCGAACCCGCGGCGCCTTCTTTGTCGACCAGCTGTACCAGGTGCCGTACTATTCTTTCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGaaa < 1:279562/147‑1 (MQ=255) aacaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTc < 5:85434/107‑1 (MQ=255) aacaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGt < 2:187668/138‑1 (MQ=255) aacaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGt > 1:187668/1‑138 (MQ=255) aacaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGATGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTc > 6:85434/1‑107 (MQ=255) acaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAg > 7:1890/1‑126 (MQ=255) acaaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAg < 8:1890/126‑1 (MQ=255) aaGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGAAAGTGtt < 5:35728/149‑1 (MQ=255) gtggtgGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGAAAGTGTTCGATGc < 2:24700/149‑1 (MQ=255) | GAGCCGAGCATGCAAATCAAACTCGCCAACCCTCGCGGCTTCTGCGCCGGGGTCGACCGGGCGATCGAGATCGTCAACCGCGCGCTGGAAGTCTTCGGCCCGCCGATCTATGTGCGCCACGAAGTGGTGCACAACAAGTTCGTGGTGGAAGACTTGCGTAACCGCGGCGCCATCTTTGTCGAAGAGCTGGACCAGGTGCCGGACGATGTCATCGTCATCTTCAGTGCCCACGGTGTTTCCCAGGCCGTGCGGCAGGAAGCTGCTGGCCGTGGCCTGAAAGTGTTCGATGC > NC_002947/713978‑714267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |