New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1151173 = | 53 (0.980) | 5 (0.100) | 5/248 | NT | 10.9% | intergenic (‑162/‑103) | gapA/edd | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase/phosphogluconate dehydratase |
? | NC_002947 | 1151229 = | 31 (0.600) | intergenic (‑218/‑47) | gapA/edd | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase/phosphogluconate dehydratase |
GGAATTACAAGATTATTCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTCGCGGCGCGGCCAGTGAAGGC > NC_002947/1151081‑1151377 | ggAATTACAAGATTATTCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAggg > 4:310552/1‑149 (MQ=255) cgttcgaccagccgctgggtgacctcaaggatgcgcggatgcatgtactggactccaggctaattgtaagggcggtttaccgagcatttccCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAgggg > 4:295079‑M1/92‑149 (MQ=255) cgaccagccgctgggtgacctcaaggatgcgcggatgcatgtactggactccaggctaattgtaagggcggtttaccgagcatttccCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGaaa > 7:156889‑M1/88‑148 (MQ=255) gaccagccgctgggtgacctcaaggatgcgcggatgcatgtactggactccaggctaattgtaagggcggtttaccgagcatttccCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑t > 8:244164‑M1/87‑148 (MQ=255) aaGATTATTCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAggg > 6:193900/1‑141 (MQ=255) aaGATTATTCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAggg < 5:193900/141‑1 (MQ=255) ttattCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCgg > 3:37444/1‑148 (MQ=255) gCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGccc < 5:288855/148‑1 (MQ=255) aTAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTAc > 5:148480/1‑148 (MQ=255) tAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACa > 2:295570/1‑148 (MQ=255) cAAGCCTTTTTAGGGGCAGTATTTTGGTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCt < 7:121627/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTg > 5:298999/1‑149 (MQ=255) aGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTg > 4:75990/1‑148 (MQ=255) gCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCtt < 8:36399/135‑1 (MQ=255) gCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCtt > 7:36399/1‑135 (MQ=255) gCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGa < 7:281406/149‑1 (MQ=255) ttttAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTc > 6:348474/1‑148 (MQ=255) tttAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTc < 2:190280/147‑1 (MQ=255) tttAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAAACATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAATTGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTc < 1:231107/148‑1 (MQ=255) ttAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCTGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCa < 3:310552/148‑1 (MQ=255) gTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTAc < 5:348474/149‑1 (MQ=255) tttGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCcgc < 1:295570/149‑1 (MQ=255) aaCGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCa > 6:25333/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCa > 7:163775/1‑149 (MQ=255) gAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCAccc < 4:37444/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCgg > 6:215205/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTgg < 6:148480/149‑1 (MQ=255) gtgtCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGt < 6:298999/149‑1 (MQ=255) atttcccctccaaacgattgcggcctaggctcatggttaggagcccgctgcatcggtggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTc > 8:244164‑M2/63‑148 (MQ=255) tttcccctccaaacgattgcggcctaggctcatggttaggagcccgctgcatcggtggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCg > 7:156889‑M2/62‑148 (MQ=255) gTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAAc < 5:25333/149‑1 (MQ=255) cccctccaaacgattgcggcctaggctcatggttaggagcccgctgcatcggtggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACg > 4:295079‑M2/59‑149 (MQ=255) ACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACaa > 1:339935‑M1/1‑79 (MQ=255) ACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACaa < 2:339935‑M1/79‑1 (MQ=255) gattgcggcctaggctcatggttaggagcccgctgcatcggtggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCa < 3:295079‑M2/102‑1 (MQ=255) aTGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCa > 6:70954/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCAcc < 8:163775/148‑1 (MQ=255) cTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTAGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCt < 5:351670/148‑1 (MQ=255) aaCCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTAcc > 2:252336/1‑149 (MQ=255) gcATGAGCCTCGGCCGCACTCGTTTGGCGGGGAAA‑TGCTCGGTAACCCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTg < 4:14542/148‑1 (MQ=255) aTGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCttc > 3:14542/1‑146 (MQ=255) cGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTcgcgg > 3:239679/1‑149 (MQ=255) gCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTcgcggc > 6:95831/1‑149 (MQ=255) catcggtggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTcgcggcgc < 8:156889‑M2/136‑1 (MQ=255) tttGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTCgcggcgcggc > 6:288268/1‑147 (MQ=255) ggaggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTCGCGGCGCGGCCAGt < 1:252336‑M2/143‑1 (MQ=255) aggGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCATCGGCTGTTCGAACGCAGCCTCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGAt < 1:137292‑M2/127‑1 (MQ=255) ggAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTCGCGGCGCGGCCAGTGAAGGc > 1:153789/1‑149 (MQ=255) | GGAATTACAAGATTATTCACTGGCTGATAGAAAACAAGCCTTTTTAGTGGCAGTATTTTGTTTAAATATACAACGAGTGGTTGGGTGTCGTGCCTCCACCGATGCAGCGGGCTCCTAACCATGAGCCTAGGCCGCAATCGTTTGGAGGGGAAA‑TGCTCGGTAAACCGCCCTTACAATTAGCCTGGAGTCCAGTACATGCATCCGCGCATCCTTGAGGTCACCCAGCGGCTGGTCGAACGCAGCCGCGCCACCCGCGAACGCTACCTGCAACTGATTCGCGGCGCGGCCAGTGAAGGC > NC_002947/1151081‑1151377 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |