New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1485867 | 34 (0.630) | 5 (0.100) | 5/242 | NT | 12.0% | coding (756/1098 nt) | yhdY | amino acid ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 1485897 | 42 (0.830) | coding (786/1098 nt) | yhdY | amino acid ABC transporter permease |
GTCGGTGATGCTGCCGTTGTTCCTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGCCTGTTC > NC_002947/1485750‑1486044 | gtcgGTTATGCTGCCGTTGTGCATGCCAGAAGGCAGGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATGTGTGTGATCCTGATCCATTCGGGGTACATGGCCGAGGTGGTGCGCGGGGGCCTGCAGGCCATCCGCAAGGGCCAGTACGAAg < 2:199866/149‑1 (MQ=255) ggTGATGCTGCCGTTGTTCCTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccg < 7:255330‑M2/149‑5 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGTTCCTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgc < 2:40387‑M2/149‑9 (MQ=255) tgctgcCGTTGTTCCTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcg > 7:164553‑M2/1‑140 (MQ=255) ccTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCtt < 6:32912/148‑1 (MQ=255) aaGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTg > 6:245154/1‑148 (MQ=255) aaGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTg < 5:245154/148‑1 (MQ=255) aGCTTCGACAAGCGGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCCGTGGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGGGGGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGAt < 2:97149/149‑1 (MQ=255) gACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGc < 1:40387/148‑1 (MQ=255) cAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTgg < 6:309379/149‑1 (MQ=255) tgctgcGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATc > 6:190414/1‑149 (MQ=255) gctgcGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCt > 1:153404/1‑149 (MQ=255) gggCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCg < 4:252428/149‑1 (MQ=255) gatgatCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGc > 2:8142/1‑146 (MQ=255) gatgatCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGc < 1:8142/146‑1 (MQ=255) atgatCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGgc < 2:153404/149‑1 (MQ=255) gtgtGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAg > 4:259389/1‑149 (MQ=255) aTCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTtgt > 3:133138/1‑149 (MQ=255) aTCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTtg < 6:202727/148‑1 (MQ=255) aTCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTtg < 4:166081/148‑1 (MQ=255) aTCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCACAGGCGCTGAAGCTtgt < 5:190414/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGCTCCCCg > 5:184595/1‑149 (MQ=255) aGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGc < 3:259389/149‑1 (MQ=255) gCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGt > 3:196288/1‑149 (MQ=255) aCATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAac > 8:154936/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCt < 7:154936/148‑1 (MQ=255) ccGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCtt > 4:215488/1‑148 (MQ=255) cGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCa < 4:196288/149‑1 (MQ=255) gtgCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGccc < 4:133138/148‑1 (MQ=255) tgCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcgcaccacctcggcgatgtacgccgactggaaca > 5:352997‑M2/1‑41 (MQ=255) tgCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcgcaccacctcggcgatgtacgccgactggaaca < 6:352997‑M2/82‑42 (MQ=255) gcggcgGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcgcaccacctcggcgatgtacgccgactggaacaggatcacaccgatcatcgcccgcagcagcttgtcgaagctcatgccttctggcaggaacaacggcagca < 4:65117‑M2/148‑111 (MQ=255) cggcggCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcgcaccacctcggcgatgtacgccgactggaacaggatcacaccgatcatcgcccgcagcagcttgtcgaagctcatgccttctggcaggaacaacggcagcat < 6:37209‑M2/148‑112 (MQ=255) gcggcCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAg > 8:148389/1‑149 (MQ=255) gcggcCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAg < 8:27517/149‑1 (MQ=255) cggcCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAgccgccgcgcaccacctcggcgatgtacgccgactggaacaggatcacaccgatcatcgcccgcagcagcttgtcgaagctcatgccttctggcaggaacaacggcagcatcacc > 3:65117‑M2/1‑34 (MQ=255) acgCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGc < 8:255330/147‑1 (MQ=255) gCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCt > 2:157787/1‑149 (MQ=255) cccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGa < 1:157787/148‑1 (MQ=255) cccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGa > 1:172645/1‑148 (MQ=255) cccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGa < 3:215488/148‑1 (MQ=255) cccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGATGGTGATCTTGACGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGa > 8:142220/1‑148 (MQ=255) ccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGt < 7:148240/126‑1 (MQ=255) ccAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGt > 8:148240/1‑126 (MQ=255) cAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCtt < 2:9061/88‑1 (MQ=255) gCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTc < 7:202484/101‑1 (MQ=255) gCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTc > 8:202484/1‑101 (MQ=255) gCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGatcatcatc < 2:172645/149‑1 (MQ=255) ccAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGTGCTGGTGATCTTGCCGCAGCCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGAATCGTCAACAACTGCATTGCCCTGTTCTCGGACACCAGCCTGGTGatca > 8:266829/1‑143 (MQ=255) ccAGAACGCAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGatca < 7:266829/143‑1 (MQ=255) aGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGc < 7:148389/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGCCTGtt > 2:179008/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCCTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGCCTGtt > 2:13459/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGCCTGTTc > 2:72397/1‑149 (MQ=255) | GTCGGTGATGCTGCCGTTGTTCCTGCCAGAAGGCATGAGCTTCGACAAGCTGCTGCGGGCGATGATCGGTGTGATCCTGTTCCAGTCGGCGTACATCGCCGAGGTGGTGCGCGGCGGCCTGCAGGCCATCCCCAAGGGCCAGTACGAAGCCGCCGCGGCCATGGGCCTTGGCTACTGGCGCTCGATGGGGCTGGTGATCTTGCCGCAGGCGCTGAAGCTTGTGATCCCCGGCATCGTCAACACCTTCATTGCCCTGTTCAAGGACACCAGCCTGGTGATCATCATCGGCCTGTTC > NC_002947/1485750‑1486044 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |