New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1583197 | 68 (1.260) | 6 (0.120) | 6/248 | NT | 8.4% | coding (386/633 nt) | ttgR | HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
? | NC_002947 | = 1583211 | 66 (1.280) | coding (400/633 nt) | ttgR | HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
CCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCT > NC_002947/1583064‑1583357 | ccGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCTGTACATAACATTTGTGAAATAAGCCACAAGCGCCAGAGTGCgg > 1:115254/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGt > 4:335631‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATACGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGtgctgg > 1:195417‑M2/1‑142 (MQ=255) cTGCGTGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGAtt < 6:343567/149‑1 (MQ=255) cTGCATGCGCTAGCTGCTGTTGCAAGTGGTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCGCGATCCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCCTCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGAtt < 8:307134/149‑1 (MQ=255) cATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGc < 4:212254/148‑1 (MQ=255) gcAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAg > 8:274694/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAgg < 6:319673/149‑1 (MQ=255) gctgctGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCTACAAGGGCa > 7:233352/1‑149 (MQ=255) ctgTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGa < 2:340302/131‑1 (MQ=255) ctgTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGa > 1:340302/1‑131 (MQ=255) ttGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCACCGCACTCTGGCGCtgctggcgaatttcacacatgtcatcg > 3:208138‑M2/1‑121 (MQ=255) gCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCTTCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTg < 8:190391/148‑1 (MQ=255) gCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTg < 2:88165/148‑1 (MQ=255) aaGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGgcg > 1:67537/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGgcg > 3:128822/1‑149 (MQ=255) tttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGc > 4:313680/1‑149 (MQ=255) tAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGcc > 4:245463/1‑148 (MQ=255) tAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGcc > 3:236858/1‑148 (MQ=255) cGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATg < 7:274694/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATg < 3:188221/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGc > 3:291741/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAgg > 8:124581/1‑118 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAgg < 7:124581/118‑1 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTa > 4:200563/1‑147 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTa < 3:200563/147‑1 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACg > 5:83758/1‑149 (MQ=255) cTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCg > 5:33577/1‑149 (MQ=255) cTCGATGCCCGAACCCGTCGTACCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTAc > 5:64084/1‑145 (MQ=255) cTCGATGCCCGAACCCGTCGTACCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTAc < 6:64084/145‑1 (MQ=255) gATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCgggg > 7:306062/1‑149 (MQ=255) gATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCggg < 6:33577/148‑1 (MQ=255) cccGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCa < 4:130155/148‑1 (MQ=255) ccGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGt > 8:60312/1‑149 (MQ=255) cGAACCCGTCTTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATTCCGTACGCGGGGGGCAGtt < 2:115254/149‑1 (MQ=255) tacgcgtcgtTTCAATGACATCGTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACGGTTGACTTGTGTGAAATTCGCGAGCAGCGCCAGAGTGCGTTGCTGGATTGCCACTTGGGCATCTCCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGc < 8:90058/145‑1 (MQ=255) aaCCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGc < 1:117256/149‑1 (MQ=255) gtcgtATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTg > 2:40901/1‑147 (MQ=255) gtATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAg < 7:143437/149‑1 (MQ=255) tCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGTGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCt < 5:332010/148‑1 (MQ=255) tCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTg < 3:245463/149‑1 (MQ=255) aaTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTgg < 3:313680/148‑1 (MQ=255) aaTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑a > 8:156853/1‑149 (MQ=255) aaTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGCGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑a > 6:261122/1‑149 (MQ=255) aTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGcc < 4:230892/123‑1 (MQ=255) aTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGcc > 3:230892/1‑123 (MQ=255) aTGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGACGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑At > 2:103011/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGa < 4:291741/149‑1 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGATGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCgcggc > 1:197893/1‑149 (MQ=255) acaAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCgcggcg > 4:328064/1‑149 (MQ=255) acaAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCgcggcg > 5:146442/1‑149 (MQ=255) acaAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCgcggcg > 5:27051/1‑149 (MQ=255) aaGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGt < 7:156853/149‑1 (MQ=255) aGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTg < 1:336978/149‑1 (MQ=255) gTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTgg < 6:146442/149‑1 (MQ=255) cGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCa > 5:108551/1‑149 (MQ=255) aCCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCTACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTg < 8:233352/148‑1 (MQ=255) aCCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGc < 1:25230/149‑1 (MQ=255) aCCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGc > 8:59395/1‑149 (MQ=255) cGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGATCTGGCATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGcc < 1:40901/149‑1 (MQ=255) aTGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTAt < 2:67537/149‑1 (MQ=255) cATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTc > 2:286191/1‑148 (MQ=255) tgtgAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATg < 1:286191/148‑1 (MQ=255) tgtgAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATg < 2:197893/148‑1 (MQ=255) tgAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGc < 6:27051/148‑1 (MQ=255) gAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGtgctggcgaatttcacacatgtcatcggtgaactcgcacttgtgatgcaggatttcattgatacgacgggttcgggcatcgag < 3:2021‑M2/111‑84 (MQ=255) gAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGtgctggcgaatttcacacatgtcatcggtgaactcgcacttgtgatgcaggatttcattgatacgacgggttcgggcatcgag > 4:2021‑M2/1‑28 (MQ=255) aaaTTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGtgctggcgaatttcacacatgtcatcggtgaactcgcacttgtgatgcaggatttcattgatacgacgggttcgggcatcgagcaccagctcgttaaacacttgcaacagcagcttgcgca > 4:208138‑M2/1‑27 (MQ=255) ttCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGAt > 2:224458/1‑140 (MQ=255) ttCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGAt < 1:224458/140‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGCGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATc < 5:261122/149‑1 (MQ=255) cagcagCGCCAGAGTGCGGtgctggcgaatttcacacatgtcatcggtgaactcgcacttgtgatgcaggatttcattgatacgacgggttcgggcatcgagcaccagctcgttaaacacttgcaacagcagcttgcgcatgcagcc < 3:12438‑M2/147‑129 (MQ=255) cagcagCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGgcg > 6:236771/1‑149 (MQ=255) agcagcGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGgcgc < 8:306062/149‑1 (MQ=255) cagcGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTg < 4:236858/149‑1 (MQ=255) cagcGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTg > 1:323699/1‑149 (MQ=255) gcCAGAGTGCGGtgctggcgaatttcacacatgtcatcggtgaactcgcacttgtgatgcaggatttcattgatacgacgggttcgggcatcgagcaccagctcgttaaacacttgcaacagcagcttgcgcatgcagccaagcgggtc > 4:12438‑M2/1‑12 (MQ=255) gcCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTa > 7:132965/1‑149 (MQ=255) gcCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCACTGGCCTGATCGGGCGCTGGCTa > 3:65198/1‑149 (MQ=255) ccAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTAt > 2:82906/1‑149 (MQ=255) tGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGGTGGCCAATGCCGTAGGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgctgc < 1:139345/149‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGcc > 7:29608/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCAGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGcc > 4:202696/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGTCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCt < 4:128822/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGcc < 6:83758/148‑1 (MQ=255) | CCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTC‑ACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGG‑ATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCT > NC_002947/1583064‑1583357 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |