New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1617758 = | 54 (1.000) | 3 (0.070) | 3/222 | NT | 7.7% | intergenic (‑13/+160) | PP_1417/PP_1418 | tricarboxylate transport protein TctB/tricarboxylate transport protein TctC |
? | NC_002947 | 1617897 = | 26 (0.560) | intergenic (‑152/+21) | PP_1417/PP_1418 | tricarboxylate transport protein TctB/tricarboxylate transport protein TctC |
TCCTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCAGCTTGGCG > NC_002947/1617758‑1618044 | TCCTGTGGGAGCGGCCTTGCGGCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCTATGCGATCTGTACTAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGa > 5:349769‑M1/1‑149 (MQ=255) GGAGCGGCCTTGCGTCGCGATCGGGCGCGATGCTGCCGCTAAACCTCCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGAc > 5:324652‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCCTTGCTTCGCGATCGGGCGCTAAGCTGCCGCTAAACCTGCCTATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCt > 4:269883‑M1/1‑149 (MQ=255) CCTTGCGTCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTc > 4:214015‑M1/1‑138 (MQ=255) CCTTGCGTCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTc < 3:214015‑M1/138‑1 (MQ=255) CTTGCGTCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTAAGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAACGCCGCTACCACAGGAGTGGTGGTTAGTACGACAGgctaa < 4:206448‑M1/148‑3 (MQ=255) gggcgcgaagcggcccctggcacagccgatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcgcgacgcaaggccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGaa > 4:69471‑M2/111‑149 (MQ=255) gcgcgaagcggcccctggcacagccgatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcgcgacgcaaggccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAAtt > 4:84839‑M2/109‑149 (MQ=255) gcgAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTcc > 2:251953/1‑149 (MQ=255) atgCTGCCGCTAACCCTGCCGATGCTATCTGTACGACGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTg < 7:175322/147‑1 (MQ=255) aagcggcccctggcacagccgatacgatgcttcgtacagatcgcatcggcaggtttagcggcagcttcgcgcccgatcgcgacgcaaggccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTg < 3:69471‑M2/46‑1 (MQ=255) aaGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTg > 7:76872/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGc > 6:184972/1‑148 (MQ=255) cTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGATGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGcc < 5:325561/149‑1 (MQ=255) cTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGcc < 3:206448/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGCGATCTGACCGAAGCATCGTATGGGCTGGGCCTGGGCCCGCTGCGCGCCCGATCCCGACACACGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTa < 3:293433/149‑1 (MQ=255) gCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGAt > 7:300885/1‑116 (MQ=255) gCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGAt < 8:300885/116‑1 (MQ=255) gCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGt > 5:337363/1‑148 (MQ=255) ccGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCa < 5:184972/149‑1 (MQ=255) gATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGc > 8:232040/1‑149 (MQ=255) aTGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGc > 3:170590/1‑148 (MQ=255) gATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCt < 7:322153/122‑1 (MQ=255) gATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCt > 8:322153/1‑122 (MQ=255) tACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGcttc < 1:251953/148‑1 (MQ=255) ggCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAg < 8:76872/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTc > 6:37347/1‑149 (MQ=255) aGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGcc > 7:128685/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGt > 4:93903/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATgg > 1:64728/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAg < 6:203519/122‑1 (MQ=255) tCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAg > 5:203519/1‑122 (MQ=255) gcgcCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGaa < 3:93903/149‑1 (MQ=255) cccGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACgg < 6:337363/149‑1 (MQ=255) cccGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACgg < 4:170590/149‑1 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTcgcg > 4:293766/1‑149 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGACAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCAAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTagcg > 8:29359/1‑149 (MQ=255) gccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACg < 7:273017‑M2/116‑1 (MQ=255) gccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACg > 8:273017‑M2/16‑131 (MQ=255) gccgctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAAATCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCCGCCACTTGCTTATTAACATAGACGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGCGAACAGCTCGCGCGGGt > 4:251740‑M2/16‑149 (MQ=255) gctcccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGtctc > 4:159450‑M2/13‑149 (MQ=255) ccacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCa < 3:159450‑M2/140‑1 (MQ=255) cacaggaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCAGc < 3:84839‑M2/142‑1 (MQ=255) gaGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCAGCTTGGc > 1:170163‑M2/3‑149 (MQ=255) gtggtggtgAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCATATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCAGCTTGGCg > 5:201449/1‑148 (MQ=255) | TCCTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATCGGGCGCGAAGCTGCCGCTAAACCTGCCGATGCGATCTGTACGAAGCATCGTATCGGCTGTGCCAGGGGCCGCTTCGCGCCCGATCCCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGTGGTGGTGAGTCCGACAGGCTTACTGGATCAGGCCGAATTCCTTGGCCAGCGCCTTGTAGTCAGCCACTTGCTTCTTCACATAGCCGTCCAGCTCTTCGCCGGTCATGGCGAACGGGAACAGCTCGCGCTGGTCTCGCAGCTTGGCG > NC_002947/1617758‑1618044 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |