New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1878847 | 51 (0.940) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 7.4% | coding (969/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
? | NC_002947 | = 1878915 | 50 (0.950) | coding (1037/1221 nt) | PP_1684 | transporter |
TTCCTGTGGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGCCGGTGCGCGAAC > NC_002947/1878773‑1879064 | ttCCTGTGGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcg < 7:46050‑M2/145‑3 (MQ=255) ttCCTGTGGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcg > 8:46050‑M2/1‑143 (MQ=255) ttCCTGTGGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGtgtt > 8:52736/1‑149 (MQ=255) tgGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGtgttcctgt < 4:91701/148‑1 (MQ=255) tgGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCAGCGGTATCGtgttcctgtt < 7:202032/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCAt < 7:174595/149‑1 (MQ=255) gTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGtt < 2:228920/149‑1 (MQ=255) cGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTTGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGTACCGTGGCCACCGTGTTCGTGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGgc < 2:151225/148‑1 (MQ=255) cGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTACCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGgcg > 2:255570/1‑149 (MQ=255) gTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTg < 1:174591/149‑1 (MQ=255) cTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTgggg > 3:187265/1‑149 (MQ=255) ttACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGgc > 8:204294/1‑136 (MQ=255) ttACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGgc < 7:204294/136‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGtgttc > 3:897/1‑116 (MQ=255) aCCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGtgttc < 4:897/116‑1 (MQ=255) tGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGggctgg > 2:12918/1‑149 (MQ=255) ttCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACAGTGTTCGGTGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGggctggc < 2:87923/148‑1 (MQ=255) cGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCgtgt < 7:194439/107‑1 (MQ=255) cGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCgtgt > 8:194439/1‑107 (MQ=255) tATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCtgggtg < 7:52736/149‑1 (MQ=255) ccATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTgggtggggtg < 7:311059/149‑1 (MQ=255) ccATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTgggtggggtg > 8:311059/1‑149 (MQ=255) gtgCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGggtggt > 1:1500/1‑147 (MQ=255) gtgCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGggtggt < 2:1500/147‑1 (MQ=255) tgCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTTTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGgtgt < 3:281894/148‑1 (MQ=255) ccTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTgggg < 7:174870/124‑1 (MQ=255) ccTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTggggtggggt > 4:281894/1‑146 (MQ=255) tgtgGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGggctggct < 6:340131/127‑1 (MQ=255) tgtgGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGggctggct > 5:340131/1‑127 (MQ=255) tgtgGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGc > 5:282502/1‑149 (MQ=255) ttGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCACCCTGTCCATGCTCGGCGGTCTCGTGTTCCGGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGGGGTGTATGACCGCACCgg < 6:113690/149‑1 (MQ=255) ttGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGCGTGGGCAACCTGTACAAGCTCGGCGGTAAATTGTTCATGTTCCATAAGTAGGGCGCGTTCATGGGGGGCTGGAGGGGTGGGGTGTTGGAGGACAGCACCgg > 4:119399/1‑149 (MQ=255) ccACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcgtggacaaccacagtaggcacatggcaataccgaacaggtaagcactgaactcgctcaccggcgcccacaggaa < 7:29414‑M2/148‑76 (MQ=255) ccACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGc < 6:282502/149‑1 (MQ=255) cACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGc > 5:171384/1‑148 (MQ=255) cACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCt < 4:187265/149‑1 (MQ=255) ggTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcgtggacaaccacagtaggcacatggcaataccgaacaggtaagcactgaactcg > 5:139821‑M2/1‑69 (MQ=255) ggTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcgtggacaaccacagtaggcacatggcaataccgaacaggtaagcactgaactcg < 6:139821‑M2/124‑56 (MQ=255) cGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACGGGTAGCTACGACCTg > 6:113056/1‑149 (MQ=255) aCCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCt < 6:171384/148‑1 (MQ=255) ccAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATcgtggacaaccacagtaggcacatggcaataccgaacaggtaagcactgaactcgctcaccggcgcccacaggaacagcacgatcaccacc > 8:29414‑M2/1‑58 (MQ=255) ctctGGGACCGTGGCCAGCGTGTTCGGGGTGGGCAACGTGTGCATGCTCGGCTGTATCGTGTTCCTGTTCCAACAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTTGCTGGGGGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTgg < 5:112072/140‑1 (MQ=255) cAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGAACTgg > 6:112072/1‑143 (MQ=255) aaTGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGGTGGGCGCGGTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTgg > 6:290693/1‑147 (MQ=255) gACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGAttt < 1:12918/149‑1 (MQ=255) gTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGAc > 1:128532/1‑129 (MQ=255) gTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGAc < 2:128532/129‑1 (MQ=255) ggCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGGAGATttccttcc > 2:16720/1‑149 (MQ=255) aCCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTCTCCATGCTCGGCGGAATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGAGCGATCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGTGGTGGTGTATCACCGCCCCGGTAGCTACGCCAGGGTCTGCCAGATTGCCATCCTGc > 8:316938/1‑148 (MQ=255) ttCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGAGCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCtt > 7:184787/1‑149 (MQ=255) cGGGGGGCTCAACCTGTCCTTGCTGGGGGGTTGAGTTTTCCTGTTCCATCATTTTGGCGATTTCCTGGTGGTCTGTCGGGGGGGGGGGGTTTATTACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTg < 3:119399/148‑1 (MQ=255) gcgcAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCg > 8:26445/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGc > 2:195362/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGccc > 2:38823/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGccc > 1:40878/1‑149 (MQ=255) tCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGcc > 3:310176/1‑144 (MQ=255) tCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGcc < 4:310176/144‑1 (MQ=255) cATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCGGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACGGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACt < 5:113056/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGc > 3:16034/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTACCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGc > 6:295202/1‑149 (MQ=255) cggcggTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGCCgg > 8:231243/1‑149 (MQ=255) tCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCT‑GGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGCCGGTGCGCGAAc > 7:45204/1‑149 (MQ=255) | TTCCTGTGGGCGCCGGTGAGCGAGTTCAGTGCTTACCTGTTCGGTATTGCCATGTGCCTACTGTGGTTGTCCACGGTACCGCTGACCAATGGGACCGTGGCCACCGTGTTCGGGGTGCGCAACCTGTCCATGCTCGGCGGTATCGTGTTCCTGTTCCATCAGTTGGGCGCGTTCCTGGGGGGCTGGCTGGGTGGGGTGGTGTATGACCGCACCGGTAGCTACGACCTGGTCTGGCAGATTTCCATCCTGCTCAGCTTGCTGGCCGCTGCCCTTAACTGGCCGGTGCGCGAAC > NC_002947/1878773‑1879064 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |