New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2308477 | 46 (0.850) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.2% | coding (593/957 nt) | PP_2031 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2308521 | 48 (0.940) | coding (549/957 nt) | PP_2031 | hypothetical protein |
GCAGCAACAGCAGGTCGCAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGGCCGCCGATGCGGTCGTTGTGG > NC_002947/2308373‑2308668 | gcagcaACAGCAGGTCGCAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCg > 2:59371/1‑149 (MQ=255) agcagGTCGCAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCggg > 3:171457/1‑149 (MQ=255) cGCAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCt > 8:207491/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTc < 4:139504/149‑1 (MQ=255) tGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGgt < 1:59371/149‑1 (MQ=255) cGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGtgtg > 2:314297/1‑149 (MQ=255) gTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGtgtg > 3:193719/1‑148 (MQ=255) tGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTgg > 4:254040/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGt > 8:45221/1‑140 (MQ=255) ccAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGt < 7:45221/140‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCt > 2:153825/1‑149 (MQ=255) cTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTg < 3:32576/149‑1 (MQ=255) ttCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGTTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGc < 8:87672/147‑1 (MQ=255) tCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGgccccg < 4:178252‑M2/108‑7 (MQ=255) tCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGgccccg > 3:178252‑M2/1‑102 (MQ=255) ccACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAg > 1:340558/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGtt > 5:44902/1‑147 (MQ=255) gcgagcgTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTgc < 7:207491/149‑1 (MQ=255) cATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCtt > 1:234234/1‑149 (MQ=255) gCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTgcagc > 8:272837/1‑139 (MQ=255) gCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTgcagc < 7:272837/139‑1 (MQ=255) gCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTttgc < 6:44902/148‑1 (MQ=255) aGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCa < 3:324908/96‑1 (MQ=255) aGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCa > 4:324908/1‑96 (MQ=255) aTCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTtgcttgct > 7:104545/1‑149 (MQ=255) aTCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTtgcttgct < 4:171457/149‑1 (MQ=255) tCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTttgc < 6:1459/143‑1 (MQ=255) tCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTttgc > 5:1459/1‑143 (MQ=255) aCGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGAc < 6:12079/96‑1 (MQ=255) aCGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGAc > 5:12079/1‑96 (MQ=255) cAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCt > 1:95708/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCtt < 4:193719/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGgccccggcagcctggccatcgtgatctgcgatgaacgctcgctcagcgcccaggtggaacagcacctggccatgctctcacggcattgcgacctgct < 4:160384‑M2/149‑98 (MQ=255) ccGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGgccccggcagcctggccatcgtgatctgcgatgaacgctcgctcagcgcccaggtggaacagcacctggccatgctctcacgg < 7:129693‑M2/134‑84 (MQ=255) ccGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGgccccggcagcctggccatcgtgatctgcgatgaacgctcgctcagcgcccaggtggaacagcacctggccatgctctcacgg > 8:129693‑M2/1‑51 (MQ=255) gggCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCgtg > 4:316662/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCgtggt < 8:104545/149‑1 (MQ=255) gcagcaCTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGgtgt < 2:259465/149‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTc < 2:340558/149‑1 (MQ=255) agcaCTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTc > 5:287438/1‑149 (MQ=255) caCTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGt > 5:152781/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTc < 1:153825/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTc < 2:95708/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTc < 1:314297/148‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCg < 3:254040/148‑1 (MQ=255) cgGGCGCGGCGCAGTGCCAGGCCGCGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGATTGGGTGTGCAGGGCCTGGTGGACCGTTGCCGAGCGGGTGAGCAGTTGCCGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTGGATTTCGTGGTGTGCGGTGGCg > 1:296397/1‑147 (MQ=255) gggCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCgtg > 6:75189/1‑133 (MQ=255) gggCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCgtg < 5:75189/133‑1 (MQ=255) gcggcgcAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTg > 2:24657/1‑139 (MQ=255) gcggcgcAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTg < 1:24657/139‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGgc > 6:241535/1‑149 (MQ=255) aGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGgcc > 6:15261/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGgccgc < 3:316662/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGATGTCGCCGAACACCAGgccgc > 8:8665/1‑149 (MQ=255) aGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGGCCGCCGAt > 2:245367/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAG‑AGGCTTTGCTTGCTGCCTAGGGGCTTGATTTCGTGGTTTTAGTTGTCGCCGAACCCCCGGCCGCCGATTCGGTAGtttt > 7:277148/1‑147 (MQ=255) gTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGGCCGCCGATGCGGTCGTtgt > 7:15862/1‑149 (MQ=255) gcGGCCCCGGTGCTGGCGGCGGTGCTCAGTGACGGGGTGACCGTTGCCACGAGGGCGAGCAGTGGCCTCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCGTGCTTTCGGGGTGGGCGCTGGCGCAGCACACCAGGCCGCCGCTGCGGTCGTtgt < 2:296397/147‑1 (MQ=255) cGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGGCCGCCGATGCGGTCGTTGTgg < 2:234234/149‑1 (MQ=255) | GCAGCAACAGCAGGTCGCAATGCCGTGAGAGCATGGCCAGGTGCTGTTCCACCTGGGCGCTGAGCGAGCGTTCATCGCAGATCACGATGGCCAGGCTGCCGGGGCGCAGCACTTCGCGGGCGCGGCGCAGGGCCAGGCCGAGGCTGTCGGCCCCGGGTATGGCTTCGGTGTGCAGTGACTGGTTGACCTTTGCCAAGCGGTTGAGCAGTTGCAGCAGGCTTTGCTTGCTGCGTCGGGGCTTGATTTCGTGGTGTTCGTTGTCGCCGAACACCAGGCCGCCGATGCGGTCGTTGTGG > NC_002947/2308373‑2308668 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |