New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2791195 = | 58 (1.070) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.9% | coding (353/1212 nt) | sstT | serine/threonine transporter SstT |
? | NC_002947 | 2791237 = | 42 (0.830) | coding (311/1212 nt) | sstT | serine/threonine transporter SstT |
GCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGAC > NC_002947/2791089‑2791367 | atcacggccaggaaacccacattcgcccgatcctctggctgtacctgctgggcacctttgccgcagcagtggtggccgtgtttgccagcatgctgtttccgtcgcaCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGt > 8:165327‑M1/107‑149 (MQ=255) ggCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACg > 8:75680/1‑149 (MQ=255) cccATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACgg > 6:49971/1‑148 (MQ=255) ccATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGa > 5:5032/1‑148 (MQ=255) cATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCGGGTGCGACGGaaa < 8:59026/149‑1 (MQ=255) aTGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAAc < 6:5032/149‑1 (MQ=255) tGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGTGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACa < 4:43640/149‑1 (MQ=255) tGTCAGCAAGCCTATGAAGTTTGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTAACGAGTTCAGCAACAGGTGCTGCAGCACTTCGGCGATGCAGCCTGGCTCGCTCATCGTGGCCTCGCTGTTGCTTATCGCCAGGTGCGACTGAAACa < 2:291878/149‑1 (MQ=255) aGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCAt < 7:75680/149‑1 (MQ=255) aCGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCt > 2:267955/1‑149 (MQ=255) cGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTg < 7:143108/149‑1 (MQ=255) ccGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGc < 4:100545/149‑1 (MQ=255) gATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCa > 5:98962/1‑148 (MQ=255) gTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACgg > 3:177371/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGcc < 5:177272/148‑1 (MQ=255) aGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCGAACACGGCCACCACtgc‑tg‑‑c < 5:177314/149‑1 (MQ=255) ttGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCaaa < 1:42388/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGt > 7:72821/1‑149 (MQ=255) cGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGc > 8:112037/1‑141 (MQ=255) cGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGc < 7:112037/141‑1 (MQ=255) gggtGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCGCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGcc‑‑c < 2:16991/146‑1 (MQ=255) tCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑cagca < 8:72821/148‑1 (MQ=255) tCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑cagca < 5:49971/148‑1 (MQ=255) tACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑cagca < 3:205443/146‑1 (MQ=255) tACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑cagca > 4:205443/1‑146 (MQ=255) cgcgTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTa > 1:141709/1‑147 (MQ=255) aGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCaga < 6:98962/148‑1 (MQ=255) cAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCaaa < 8:309311/123‑1 (MQ=255) cAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCaaa > 7:309311/1‑123 (MQ=255) aGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGACTGGCGCGCTCCGCGTGGCCTAGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTTCGACGGAAACCGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCgg > 5:156671/1‑149 (MQ=255) ggTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCggg > 7:285717/1‑149 (MQ=255) ggTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCggg > 7:154599/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGc > 4:5543/1‑82 (MQ=255) gTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGc < 3:5543/82‑1 (MQ=255) gTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGc < 8:285717/149‑1 (MQ=255) gcaCTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTgg < 8:154599/149‑1 (MQ=255) acctggcgctaagcaccagcgaggccacgctgagcgcgccaggTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTgat > 8:165327‑M2/44‑148 (MQ=255) ctggcgctaagcaccagcgaggccacgctgagcgcgccaggTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTgg < 1:292906‑M2/99‑1 (MQ=255) ctggcgctaagcaccagcgaggccacgctgagcgcgccaggTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTgg > 2:292906‑M2/42‑140 (MQ=255) CTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGa < 6:337000‑M1/149‑1 (MQ=255) agcaccAGCGAGGCCACGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACAGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGtt > 5:277886/6‑149 (MQ=255) aGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTTGTAGGGCAAAGGTGCCGGCAGCAGTTACAGCCAGAGGATCGGGCGATTGTGGGTTTCGTGGCCTTGACGATGTTTg > 1:107330/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCa > 3:331705/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCa > 6:284890/1‑149 (MQ=255) tgttGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTg < 3:143637/128‑1 (MQ=255) tGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTg > 4:143637/1‑131 (MQ=255) ggTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGAc > 5:329075/1‑147 (MQ=255) ccaggTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGc > 5:273112‑M2/6‑130 (MQ=255) ccaggTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGc < 6:273112‑M2/125‑1 (MQ=255) | GCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGC‑TG‑‑CGGCAAAGGTGCC‑‑CAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGAC > NC_002947/2791089‑2791367 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |