New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3474861 | 64 (1.180) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.1% | coding (1852/2517 nt) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
? | NC_002947 | = 3474897 | 51 (0.990) | coding (1816/2517 nt) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
GCATGAACAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAGGTTCGTCTTC > NC_002947/3474750‑3475029 | gCATGAACAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAc < 8:164159‑M2/149‑2 (MQ=255) cATGAACAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAca > 8:44232‑M2/1‑147 (MQ=255) gAACAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGACCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAcaggc < 8:309235‑M2/149‑6 (MQ=255) aCAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCt > 3:155018/1‑149 (MQ=255) agcagcTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCtgt < 4:155018/149‑1 (MQ=255) gcagcTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCtgtg > 3:192414/1‑149 (MQ=255) aagcTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCtgtg > 6:117783/2‑148 (MQ=255) gcTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAg < 4:192414/149‑1 (MQ=255) gCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGc > 5:7208/1‑147 (MQ=255) gCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGCAGGttgac > 4:9775/1‑144 (MQ=255) cGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTg < 5:264820/149‑1 (MQ=255) gAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTgg < 7:309235/149‑1 (MQ=255) ccTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAgcgc > 7:60154/1‑149 (MQ=255) ctctCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGcgcg < 3:157918/149‑1 (MQ=255) ctctCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGcgcg < 4:56421/149‑1 (MQ=255) ctctCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGcgcg < 4:61063/149‑1 (MQ=255) tcCCTCGCAGTTTGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTACCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAACCAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTg < 7:46691/140‑1 (MQ=255) tcCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTg > 8:46691/1‑139 (MQ=255) tcCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTAGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCgcggcg > 1:189474/1‑149 (MQ=255) cGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGGGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCgg > 3:205664/1‑149 (MQ=255) cAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGcc < 8:53777/149‑1 (MQ=255) gcgcACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCgg > 4:328287/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTg < 4:137052/149‑1 (MQ=255) cGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTg < 6:7208/149‑1 (MQ=255) cccTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGt > 7:28768/1‑148 (MQ=255) cTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCaa < 2:189474/149‑1 (MQ=255) ggCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAAc < 8:28768/147‑1 (MQ=255) cAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGc > 4:30331/1‑149 (MQ=255) gAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATc < 7:265143/124‑1 (MQ=255) gAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATc > 8:265143/1‑124 (MQ=255) gAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGcc > 7:22307/1‑149 (MQ=255) aGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGc < 5:116966/149‑1 (MQ=255) aGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGc < 8:60154/149‑1 (MQ=255) ggAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCt > 1:143641/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTTCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTTGCCAGGTTGGAGCGCGTCG‑‑TGAGGCCGATCGG‑‑CTTCTGTTCAACCTGCACCAGCCGCttta < 5:117783/149‑3 (MQ=255) aaaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGa < 3:30331/149‑1 (MQ=255) aaaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGGGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGa < 4:205664/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑c > 5:203721/1‑120 (MQ=255) aaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑c < 6:203721/120‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGAt > 6:275978/1‑149 (MQ=255) cccGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGAtgctgc < 8:22307/149‑1 (MQ=255) cGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGc > 7:218488/1‑102 (MQ=255) cGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGc < 8:218488/102‑1 (MQ=255) gCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAg < 7:164159/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGccc < 3:41605/149‑1 (MQ=255) gAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGGCGCTTGATGCTGCCAAGCCCgg > 3:208183/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAcaggccaaggcacagggcttcgacgccgggcgcttttccttcaacgttgccaagggccggtgcgccaactgcgagggagagggtttcgtcagcgtcgagctgc < 3:263205‑M2/149‑104 (MQ=255) cTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGc > 8:124975/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAcaggccaaggcacagggcttcgacgccgggcgcttttccttcaacgttgccaagggccggtgcgccaactgcgagggagagggtttcgtcagcgtcgagctgctg < 8:3102‑M2/149‑106 (MQ=255) ggCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGcc < 5:275978/147‑1 (MQ=255) cTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAAcaggccaaggcacagggcttcgacgccgggcgcttttccttcaacgttgccaagggccggtgcgccaactgcgagggagagggtttcgtcagcgtcgagctgctgttcat < 5:54981‑M2/149‑111 (MQ=255) cTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTgg > 3:99280/1‑149 (MQ=255) tCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACg < 2:129942/135‑1 (MQ=255) tCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACg > 1:129942/1‑135 (MQ=255) ggTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGGCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTc < 4:208183/148‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGt < 4:99280/147‑1 (MQ=255) gCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGtt < 2:143641/148‑1 (MQ=255) gcgAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAgg < 3:328287/149‑1 (MQ=255) aaGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCGCCTGCGGCCGATCGGTCCCTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAg < 1:107729/149‑1 (MQ=255) gcgcACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑c < 4:144327/64‑1 (MQ=255) gcgcACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑c > 3:144327/1‑64 (MQ=255) aa‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAGGTTCGTCTTc < 6:190188/134‑1 (MQ=255) aa‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAGGTTCGTCTTc > 5:190188/1‑134 (MQ=255) a‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAg > 4:108676/1‑88 (MQ=255) a‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAg < 3:108676/88‑1 (MQ=255) | GCATGAACAGCAGCTCGACGCTGACGAAACCCTCTCCCTCGCAGTTGGCGCACCGGCCCTTGGCAACGTTGAAGGAAAAGCGCCCGGCGTCGAAGCCCTGTGCCTTGGCCTGCTCGGTAGCCGCGAAGCATTTGCGCACGTGGTCGAA‑CAGGCCTGTGTAGGTGGCCAGGTTGGAGCGCGGCG‑‑TGCGGCCGATCGG‑‑CTTCTGGTCAACCTGCACCAGCCGCTTGATGCTGCCAAGCCCGGCGCTTACGTGGCCGCTGCTGGTCTGTTCAGGTTCGTCTTC > NC_002947/3474750‑3475029 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |