New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3590864 = | 41 (0.760) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 10.2% | coding (60/1080 nt) | PP_3169 | membrane protein |
? | NC_002947 | 3590926 = | 32 (0.630) | coding (122/1080 nt) | PP_3169 | membrane protein |
GAAACGACTCTTTCAGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAGGCT > NC_002947/3590778‑3591073 | ggccaggccggtgagcacgaacaacgagtgggagaagccgcgatgataagtcatctgcgacaccgggtcggcatagcgaatgatcaCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGAtgt > 2:307209‑M1/87‑149 (MQ=255) gcgaggccggtgagcacgaacaacgagtgggagtagccgcgatgataagtcatctgcgacaccgggtcggcatagcgaatgatcaCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGAtgt > 7:211736‑M1/86‑148 (MQ=255) ctctTTCAGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCAtt < 3:6420/149‑1 (MQ=255) tttCAGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTc < 3:187793/147‑1 (MQ=255) aGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTAt < 4:135573/148‑1 (MQ=255) aGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATg > 4:149770/1‑149 (MQ=255) tCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGAt > 6:156722/1‑149 (MQ=255) aTCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCg < 4:155414/135‑1 (MQ=255) aTCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCg > 3:155414/1‑135 (MQ=255) gTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCgg < 7:232464/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGTTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGa < 5:73170/129‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGTTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGa > 6:73170/1‑129 (MQ=255) gcgcggcgcTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTtctc < 3:107115/148‑1 (MQ=255) ggagcTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACTCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACA‑TATCAACGCGGCTTCTCCCAc > 4:208146/4‑148 (MQ=255) cAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCgttgtt > 3:144371/1‑149 (MQ=255) atgggACCGTGCTCGGGGGCATCCTGGGCCGACGCTCGCTGCTGTTTGGTGCATCAGTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGTCTTCTCCCACTCGTTGTTc < 3:208146/147‑1 (MQ=255) cGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCa > 2:268577/1‑149 (MQ=255) gggCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCggc < 3:149770/147‑1 (MQ=255) ggCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCggcctg > 2:267715/1‑149 (MQ=255) acatccaggtccggcagcgtgcccagtgctgcaccatacagcagcgagcgtcggccctggatgTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCggcctggcc > 2:307209‑M2/64‑149 (MQ=255) acatccaggtccggcagcgtgcccagtgctgcaccatacagcagcgagcgtcggccctggatgTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTACTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCggcctcgc > 7:211736‑M2/64‑148 (MQ=255) ccaggtccggcagcgtgcccagtgctgcaccatacagcagcgagcgtcggccctggatgTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGc > 1:177715‑M2/60‑149 (MQ=255) GGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGtt < 4:74975‑M1/149‑1 (MQ=255) gCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGc < 3:94883/126‑1 (MQ=255) gCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCCGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGc > 4:94883/1‑126 (MQ=255) ccGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTCTATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTg < 1:267715/149‑1 (MQ=255) gctcgctGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCctgg < 1:268577/149‑1 (MQ=255) cccagtgctgcaccatacagcagcgagcgtcggccctggatgTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTc < 2:177715‑M2/107‑1 (MQ=255) ctgTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCaa > 5:37521/1‑149 (MQ=255) tATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCTGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAg < 4:144371/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGgc > 1:249521/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAAc > 7:196442/1‑143 (MQ=255) gTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAAc < 8:196442/143‑1 (MQ=255) gTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGgcgc > 3:291554/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGgcgc > 3:286772/1‑149 (MQ=255) ggCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGc > 5:306243/1‑147 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 4:291554/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 4:286772/149‑1 (MQ=255) tGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGta > 1:224173/1‑148 (MQ=255) gatgTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAg < 1:307209‑M2/145‑1 (MQ=255) tgATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCGGGCAAGGTATACCCCTTGccgggcca < 6:37521/148‑7 (MQ=255) | GAAACGACTCTTTCAGGAATCCCCACCTTGGACTCCATCACCCAAGCCGTACTTGGCGCGGCGCTGCAAGGGACCGTGCTCGGGCGCATCCAGGGCCGACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACT‑TATCATCGCGGCTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAGGCT > NC_002947/3590778‑3591073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |