New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4676734 = | 52 (0.960) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 7.8% | coding (1840/2250 nt) | ldcC | lysine decarboxylase |
? | NC_002947 | 4676781 = | 44 (0.850) | coding (1793/2250 nt) | ldcC | lysine decarboxylase |
AGCCGCTTCAGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCTGACTACC > NC_002947/4676637‑4676927 | aGCCGCTTCAGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCa > 4:217414/1‑147 (MQ=255) ccGCTTCAGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGt > 3:249742/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCAGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGt > 2:2798/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTg > 4:144926/1‑143 (MQ=255) aGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTg < 3:144926/143‑1 (MQ=255) ctTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACt > 8:135929/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTc > 2:255878/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTc < 7:135929/147‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTc < 4:287992/147‑1 (MQ=255) gCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCcag > 6:45769/1‑149 (MQ=255) ttccatgggcatcaccaagggcaagtggagcaccctgctcaccgagctgctggagttcaagcgccactatgaCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATa < 5:184706‑M1/52‑1 (MQ=255) ttccatgggcatcaccaagggcaagtggagcaccctgctcaccgagctgctggagttcaagcgccactatgaCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATa > 6:184706‑M1/73‑124 (MQ=255) aTTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGaa > 2:123702/1‑135 (MQ=255) gcgcGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAg > 7:88369/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCACTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCACACACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGt > 3:133489/1‑146 (MQ=255) gTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAggg > 8:297446/1‑149 (MQ=255) tGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCtt > 3:174157/1‑113 (MQ=255) tGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCtt < 4:174157/113‑1 (MQ=255) tGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACtt > 7:111953/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCt > 4:297423/1‑149 (MQ=255) gTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTgg > 2:2230/1‑149 (MQ=255) gTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTg < 5:45769/148‑1 (MQ=255) tCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTg > 2:68096/1‑147 (MQ=255) tCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTg < 1:68096/147‑1 (MQ=255) tCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCAt < 8:88369/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATg > 2:12626/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGGGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATg > 7:318894/1‑148 (MQ=255) aGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGaaaa < 1:2798/149‑1 (MQ=255) gCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACa < 1:255878/149‑1 (MQ=255) gCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACa < 8:111953/149‑1 (MQ=255) cATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTa > 3:88341/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTa < 8:318894/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTAc < 4:249742/149‑1 (MQ=255) cccTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCa < 7:297446/148‑1 (MQ=255) gcAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACAGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCAAAGTGGCTCTTGAAATCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCACTTGGTGATGCCCATGGAAAAAACTAACAGAAAGCAGTa > 6:77818/1‑148 (MQ=255) cAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTg > 2:74753/1‑112 (MQ=255) cAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTg < 1:74753/112‑1 (MQ=255) tatgacggcaacaccccactcagcagctgcctgcccagtgtgggggctgccgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGaa < 5:184706‑M2/72‑1 (MQ=255) tatgacggcaacaccccactcagcagctgcctgcccagtgtgggggctgccgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGaa > 6:184706‑M2/53‑124 (MQ=255) gTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCTCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCg > 6:23968/1‑149 (MQ=255) gTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCt < 8:152679/138‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCt > 7:152679/1‑138 (MQ=255) tCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGt > 7:92831/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGt < 3:297423/149‑1 (MQ=255) CGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGaa < 1:160907‑M1/133‑1 (MQ=255) CGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGaa > 2:160907‑M1/1‑133 (MQ=255) GCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGtttt < 7:277433‑M1/149‑1 (MQ=255) caacaccccactcagcagctgcctgcccagtgtgggggctgccgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGttttt > 5:168042‑M2/45‑149 (MQ=255) CAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTGATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGt < 1:243278‑M1/135‑1 (MQ=255) CAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGt > 2:243278‑M1/1‑135 (MQ=255) gCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTc < 4:88341/149‑1 (MQ=255) cccccACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTc > 5:189165/1‑148 (MQ=255) cccACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCTCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTccac < 5:23968/149‑1 (MQ=255) cactcagcagctgcctgcccagtgtgggggctgccgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTccaccac < 6:168042‑M2/113‑1 (MQ=255) ggcagCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTTATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGc < 4:190955/123‑1 (MQ=255) gggTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTg > 2:126154/1‑149 (MQ=255) ggTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAAGAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGc < 5:77818/149‑1 (MQ=255) gtgtTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCt < 8:277433/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCATCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCTGAc < 3:217414/149‑1 (MQ=255) ccgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGCAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCTGACTAc < 1:2230‑M2/146‑1 (MQ=255) cgTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAAGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCTGACTAcc > 2:274301‑M2/3‑149 (MQ=255) | AGCCGCTTCAGCTGCTTGGCCGTGGCATTGGCGCGGTAGCAGTCATGTAACTGGTCGCACAGGTCGCGCAGGCCCATGCCCTGGTAGCGCAAGGCGTCGGCAGCCCCCACACTGGGCAGGCAGCTGCTGAGTGGGGTGTTGCCGTCATAGTGGCGCTTGAACTCCAGCAGCTCGGTGAGCAGGGTGCTCCACTTGCCCTTGGTGATGCCCATGGAAAACAGTACCAGGAAGCTGTACAGGCCCGTTTTTTCCACCACCAGCCCGCGTTCCCAGAGAAACTTGCTGACTACC > NC_002947/4676637‑4676927 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |