New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4699973 | 55 (1.020) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.9% | coding (715/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | = 4700030 | 55 (1.070) | coding (658/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
CGGCTGGCATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCT > NC_002947/4699885‑4700178 | cgGCTGGCATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATggc > 1:154328‑M2/1‑146 (MQ=255) tGGCATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATg > 2:101830‑M2/1‑142 (MQ=255) tGGCATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATg < 1:101830‑M2/143‑2 (MQ=255) cATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTcg > 3:168236/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTcgc > 3:64667/1‑149 (MQ=255) cgcACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAg < 8:29222/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGCGGCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCg > 1:85977/1‑149 (MQ=255) cGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCGGGCTCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAg < 6:8247/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAggttggt < 4:64667/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTAACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCAGCGCTGAAGATAGCCGTGGGCAAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTg > 8:47512/1‑149 (MQ=255) gtcACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGaa > 3:107063/1‑148 (MQ=255) cGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATAc > 6:108311/1‑149 (MQ=255) aTGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATc > 5:274898/1‑149 (MQ=255) ccacctGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATg < 8:76682/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGaaaaa < 7:240105/137‑1 (MQ=255) ccaccaGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATg > 7:68453/1‑149 (MQ=255) caccaGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATgg > 4:88332/1‑149 (MQ=255) accaGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGgc > 6:246783/1‑149 (MQ=255) aGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGgccgc > 3:66117/1‑149 (MQ=255) gCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATAc > 3:43198/1‑134 (MQ=255) gCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATAc < 4:43198/134‑1 (MQ=255) cAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGccc < 2:85977/149‑1 (MQ=255) aaCCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATg > 4:201344/1‑141 (MQ=255) aaCCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATg < 3:201344/141‑1 (MQ=255) aaCCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCt > 6:69275/1‑149 (MQ=255) aaCCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCt > 7:254160/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCtt < 5:69275/149‑1 (MQ=255) cGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGc < 4:107063/149‑1 (MQ=255) cGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGc < 5:108311/149‑1 (MQ=255) ggCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGcc > 5:295958/1‑149 (MQ=255) gCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCt < 8:68453/149‑1 (MQ=255) ccGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTg > 1:74234/1‑149 (MQ=255) c‑gcAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTc < 3:88332/149‑1 (MQ=255) caaaGGCCGGCGCCGCCGGGCCGCGCTGTCGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGAGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCg < 7:308956/147‑1 (MQ=255) cAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCgg < 4:66117/149‑1 (MQ=255) aaGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGTGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCggg > 5:56788/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGc < 4:168236/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCa > 7:143940/1‑149 (MQ=255) gctcctcctGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTac < 8:254160/146‑1 (MQ=255) gcCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTacac > 8:246265/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATggccaggaggcgccggccttgcgcggccggttgctggtgggcatagacggtgacgaccaggccgaacgcctggtgcgccatgccagcc < 2:50058‑M2/149‑89 (MQ=255) ggCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACAcc > 3:79553/1‑143 (MQ=255) ggCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACAcc < 4:79553/143‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCt < 6:84743/148‑1 (MQ=255) ccGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGt < 4:137347/80‑1 (MQ=255) ccGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGt > 3:137347/1‑80 (MQ=255) gcgcTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCTGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCAc < 6:352634/149‑1 (MQ=255) gcTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGc < 6:295958/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGccc > 2:28960/1‑103 (MQ=255) ccGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGCTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGccc < 1:28960/103‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGagca < 2:74234/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCGGCATCGACCCGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATa < 4:4278/81‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCGGCATCGACCCGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATa > 3:4278/1‑81 (MQ=255) gCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGctc > 8:188047/1‑149 (MQ=255) gCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATgg > 5:348764/1‑82 (MQ=255) gCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATgg < 6:348764/82‑1 (MQ=255) gACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGt < 6:274898/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCGGCGGTCTGCATggccaggaggcgccggccttgcgcggccggttgctggtgggcatagacggtgacgaccaggccgaa < 7:119217‑M2/85‑67 (MQ=255) gAGCAGCGGCGGTCTGCATggccaggaggcgccggccttgcgcggccggttgctggtgggcatagacggtgacgaccaggccgaa > 8:119217‑M2/1‑19 (MQ=255) gcagcGGCGGTCTGCATggccaggaggcgccggccttgcgcggccggttgctggtgggcatagacggtgacgaccaggccgaacgcctggtgcgccatgccagccgcgtggcccagcgccgccacctgccctggagcctggtgcatgt > 1:50058‑M2/1‑17 (MQ=255) gcagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAg < 7:246265/149‑1 (MQ=255) gcggcgGTGTGCCTGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGGGGAAAATACGCCTAGATGGCCGCCCTTTGCTGCTCGGGCACGTACACCATGCCGTCACGCAGGCGGTCGAGCAGGGCTCGCGGAGGCAGGTCGCTCCGCAc > 6:268407/1‑149 (MQ=255) tCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTc > 7:55883/1‑148 (MQ=255) cTGCATGGCCAGCTCGCGAAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGATAAATACGCATCGATGGCCGCACTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCCGGTCGATCAGCACCAGCTCg > 6:276247/1‑148 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAAc < 5:268407/148‑1 (MQ=255) tGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCt < 8:143940/149‑1 (MQ=255) | CGGCTGGCATGGCGCACCAGGCGTTCGGCCTGGTCGTCACCGTCTATGCCCACCAGCAACCGGCCGC‑GCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCT > NC_002947/4699885‑4700178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |