| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4780451 = | 71 (1.310) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 5.9% | coding (6863/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4780484 = | 59 (1.130) | coding (6830/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
GCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACGGCGTCG > NC_002947/4780338‑4780630 | gCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtg < 5:294903/149‑1 (MQ=255) atgTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtggt < 8:71860/147‑1 (MQ=255) acaggtcgaggccacgggcgtgaccatcctcgaatgcgtaccggcgatgatccaggccatgctggaactgccagcccggcaattgccacgcctgcgttacctgctcaccacCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtggt > 7:153578‑M1/112‑149 (MQ=255) aGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtggt < 4:233716/149‑1 (MQ=255) aGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtggt < 6:206232/149‑1 (MQ=255) aGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtggt < 6:279317/149‑1 (MQ=255) cACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAg > 8:320078/1‑147 (MQ=255) cACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGc < 4:166358/148‑1 (MQ=255) ggAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACACGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAgg > 8:25605/1‑148 (MQ=255) aggccacgggcgtgaccatcctcgaatgcgtaccggcgatgatccaggccatgctggaactgccagcccggcaattgccacgcctgcgttacctgctcaccacCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGt > 8:268604‑M1/104‑149 (MQ=255) aGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTaa > 3:137932/1‑149 (MQ=255) cacgggcgtgaccatcctcgaatgcgtaccggcgatgatccaggccatgctggaactgccagcccggcaattgccacgcctgcgttacctgctcaccacCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtg < 7:46391‑M1/36‑1 (MQ=255) cacgggcgtgaccatcctcgaatgcgtaccggcgatgatccaggccatgctggaactgccagcccggcaattgccacgcctgcgttacctgctcaccacCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCggtg > 8:46391‑M1/100‑135 (MQ=255) gCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCa < 1:340087/148‑1 (MQ=255) gTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGc > 6:335672/1‑149 (MQ=255) gTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGc > 6:299621/1‑149 (MQ=255) atcaCGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAgg < 7:78747/136‑1 (MQ=255) atcaCGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAgg > 8:78747/1‑136 (MQ=255) tcaCGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTgg < 8:73977/149‑1 (MQ=255) cacgcacgCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTgg > 1:173294/1‑148 (MQ=255) acgcacgcGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGc > 3:56933/1‑148 (MQ=255) acgcacgcGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGc > 2:226856/1‑148 (MQ=255) cgcacgcGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCaa > 4:143617/1‑149 (MQ=255) acgcGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTg > 4:143633/1‑149 (MQ=255) gcgGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGcc > 6:17775/1‑149 (MQ=255) ggTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCgg > 6:227210/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCggg > 8:287602/1‑149 (MQ=255) tACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGc < 5:126500/149‑1 (MQ=255) aGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTgg < 7:320078/149‑1 (MQ=255) gcgcCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTgg > 5:212235/1‑148 (MQ=255) gcCACGTCGTCGGAACACTCAGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAg > 7:218131/1‑149 (MQ=255) gtcgGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCa > 5:39632/1‑149 (MQ=255) gAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGc < 7:115008/149‑1 (MQ=255) gAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCATGCTGGAACTGCCAGcccggc < 4:304548/149‑6 (MQ=255) acTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTg > 4:150131/1‑148 (MQ=255) tCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGa > 5:217779/1‑148 (MQ=255) cgccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGTCCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCTGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGTCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGGGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGat < 7:206331/147‑1 (MQ=255) cgccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCAGGTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGATCCAGCATGGCCTGGat > 1:103668/1‑148 (MQ=255) cgccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGatca > 4:268323/1‑149 (MQ=255) cgccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGatca < 5:335672/149‑1 (MQ=255) cgccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGa < 6:217779/146‑1 (MQ=255) ccgGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACACGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGatca‑tc < 7:25605/149‑1 (MQ=255) gggCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGc < 5:227210/149‑1 (MQ=255) 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ccGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGc > 1:220560/1‑96 (MQ=255) ccGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGc < 2:220560/96‑1 (MQ=255) gTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGACGGGCTGGCAGTTCCAGAATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATcc > 2:52126/1‑149 (MQ=255) aCATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTTACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCTTTGGAGGATGGTCACGCGCTTGGCCTCGAGCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTgc < 4:56933/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCg > 2:232974/1‑82 (MQ=255) aTGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCg < 1:232974/82‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCa > 2:249601/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCa > 7:221917/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACg < 5:105851/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACgg > 3:87471/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACgg > 3:42495/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACGGc > 7:220075/1‑149 (MQ=255) cgGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACGGCGTCg < 8:221917‑M2/147‑1 (MQ=255) cgGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACGGCGTCg > 4:239198‑M2/3‑149 (MQ=255) | GCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTCGACCTGTGGGTAGCGCTCGCGCCAGCGGCGGGCCA‑GTGCCGGTGACATGGCTTCGCCGGTGGTGAGCAGGTAACGCAGGCGTGGCAATTGCCGGGCTGGCAGTTCCAGCATGGCCTGGATCA‑TCGCCGGTACGCATTCGAGGATGGTCACGCCCGTGGCCTCGACCTGTTGCAGCAGCGCCTGCGGATCCTGCGCCACGGCGTCG > NC_002947/4780338‑4780630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |