New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5538192 | 54 (1.000) | 4 (0.080) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (270/588 nt) | PP_4871 | lysine decarboxylase family protein |
? | NC_002947 | = 5538223 | 54 (1.050) | coding (301/588 nt) | PP_4871 | lysine decarboxylase family protein |
GCGGCCGGTGGCGAAGTGGTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCGGGTTCCTCGACC > NC_002947/5538091‑5538370 | gcggcCGGTGGCGAAGTGGTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCAttgcctt > 4:213835/1‑149 (MQ=255) gTGGCGAAGTGGTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGt < 8:206149/149‑1 (MQ=255) gTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTg > 3:251537/1‑139 (MQ=255) gTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTAc > 3:14368/1‑149 (MQ=255) gTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTAc > 8:254991/1‑149 (MQ=255) cGGGATCATCCCGCAGAGTCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGc > 8:270865/1‑149 (MQ=255) ggATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTg < 7:254991/149‑1 (MQ=255) ggATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTg < 3:213835/149‑1 (MQ=255) tcatcCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGt > 4:103029/1‑131 (MQ=255) tcatcCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGt < 3:103029/131‑1 (MQ=255) atcCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGTTGGGTACGCTggagg > 2:174298/1‑148 (MQ=255) atcCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTggagg > 3:92106/1‑148 (MQ=255) ccGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGTTGGGTACGCTGGAGGAACt < 1:174298/149‑1 (MQ=255) ccGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACt > 1:87888/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGt > 1:338570/1‑149 (MQ=255) agagCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTc < 5:242971/149‑1 (MQ=255) cgggACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTgg > 2:102287/3‑121 (MQ=255) cgggACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTgg < 1:102287/119‑1 (MQ=255) tgGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGat > 8:172960‑M2/1‑90 (MQ=255) tgGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGat < 7:172960‑M2/92‑3 (MQ=255) tgGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTgg < 4:14368/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGTTGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGt < 4:183349/117‑1 (MQ=255) gCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGt > 3:183349/1‑117 (MQ=255) gCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTg > 1:7439/1‑149 (MQ=255) cTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTgg < 5:60214/149‑1 (MQ=255) tGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTggg > 3:280617/1‑149 (MQ=255) aaGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTggggg < 7:270865/149‑1 (MQ=255) aaGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTgggg < 2:87888/148‑1 (MQ=255) tCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAg > 4:26221/1‑149 (MQ=255) gcaaaaaGGGCATGAACCGCCTTGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCAGCATGGCCGAGATTAGAGATGCATTAATTGCATTGCCGGGTGGTCTGTGTACTATgga > 2:53877/6‑115 (MQ=255) gCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTgga < 1:53877/115‑1 (MQ=255) gCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTg < 4:280617/149‑1 (MQ=255) aaGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTa > 8:188034/1‑149 (MQ=255) gACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGcc > 7:235516/1‑148 (MQ=255) aCCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCaa > 6:188792/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGaa < 1:149391/112‑1 (MQ=255) ccGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGaa > 2:149391/1‑112 (MQ=255) ccGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGc > 5:218185/1‑149 (MQ=255) cGCATGGAAGTGGTGGATGCCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGcc > 6:279826/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGtt > 3:127238/1‑103 (MQ=255) tGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGtt < 4:127238/103‑1 (MQ=255) gAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTgggg > 2:216967/1‑119 (MQ=255) gAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTgggg < 1:216967/119‑1 (MQ=255) aaGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCggg < 2:338570/149‑1 (MQ=255) tggtggATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGAACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTa > 8:17103/1‑149 (MQ=255) gtggATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTAc < 2:7439/148‑1 (MQ=255) gATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGa > 2:3165/1‑149 (MQ=255) aTGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGAt < 8:235516/149‑1 (MQ=255) catgcatgCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGatgcatgccatccaccacttccaggcgggtcaggcccttgtggccgacttcagcgtccagcaggctctgcgggatgatcccgaccacttcgccaccggccgccatggccgc < 2:318472‑M2/149‑112 (MQ=255) catgcatgCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGatgcatgccatccaccacttccaggcgggtcaggcccttgtggccgacttcagcgtccagcaggctctgcgggatgatcccgaccacttcgccaccggccgccatggcc > 8:243019‑M2/1‑38 (MQ=255) catgcatgCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGatgcatgccatccaccacttccaggcgggtcaggcccttgtggccgacttcagcgtccagcaggctctgcgggatgatcccgaccacttcgccaccggccgccatggcc < 7:243019‑M2/147‑110 (MQ=255) atgcatgcGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGatgcatgccatccaccacttccaggcgggtcaggcccttgtggccgacttcagcgtccagcaggctctgcgggatgatcccgaccacttcgccaccggccgccctggccgcg < 8:224272‑M2/149‑113 (MQ=255) gcAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTAc < 5:188792/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGa > 8:231310/1‑149 (MQ=255) gCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGAc > 2:103393/1‑147 (MQ=255) cccGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAg > 6:87408/1‑149 (MQ=255) cccGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTAGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAg < 5:87408/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTg > 4:27069/1‑149 (MQ=255) ccGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGGGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCggg < 5:279826/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCGGGTTcc < 6:218185/149‑1 (MQ=255) cGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTATCCTCGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCGGGTTCCTCGAc < 1:103393/149‑1 (MQ=255) cGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCGGGTTCCTCGAcc < 7:188034/149‑1 (MQ=255) | GCGGCCGGTGGCGAAGTGGTCGGGATCATCCCGCAGAGCCTGCTGGACGCTGAAGTCGGCCACAAGGGCCTGACCCGCCTGGAAGTGGTGGATGGCATGCATGCGCGCAAGGCCCGCATGGCCGAGCTGAGCGATGCATTCATTGCCTTGCCGGGTGGGCTGGGTACGCTGGAGGAACTGTTCGAAGTGTGGACCTGGGGGCAGCTGGGCTAT‑CACGCCAAGCCGCTCGGGCTACTGGATGTGAACGGTTTCTACGACAAGCTGGGCGGGTTCCTCGACC > NC_002947/5538091‑5538370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |