New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1441693 | NA (NA) | 18 (0.290) | 14/272 | 4.8 | 28.6% | intergenic (+37/+395) | PP_1260/ghrB | transposase/2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase |
? | NC_002947 | = 2051324 | 46 (0.730) | coding (355/591 nt) | PP_1826 | isochorismatase family hydrolase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGAAACGGCCACCAACAGTG > NC_002947/2051176‑2051463 | aCGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTc > 2:92267/1‑149 (MQ=255) cGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTcc < 7:82168/149‑1 (MQ=255) cGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTg > 1:13795/1‑148 (MQ=255) cGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTg > 1:7882/1‑148 (MQ=255) tCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTctcatc > 2:322058/1‑143 (MQ=255) ccAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGAGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATTAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGc < 5:274457/149‑1 (MQ=255) ccGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGATACAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCtt < 1:92267/149‑1 (MQ=255) cGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTg > 7:346406/1‑148 (MQ=255) aCGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAAc > 6:62891/1‑149 (MQ=255) cgcgTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACg > 7:112160/1‑149 (MQ=255) gTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCtt > 8:43958/1‑141 (MQ=255) gTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCtt < 7:43958/141‑1 (MQ=255) ctACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTgg < 8:346406/147‑1 (MQ=255) tACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTg < 6:315404/145‑1 (MQ=255) tACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTg > 5:315404/1‑145 (MQ=255) cAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATgc > 2:307308/1‑149 (MQ=255) aCCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTc > 7:259459/1‑148 (MQ=255) gATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATg < 3:174347/149‑1 (MQ=255) aTAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTc > 7:21615/1‑144 (MQ=255) aTAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTc < 8:21615/144‑1 (MQ=255) aTAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGa < 2:7882/149‑1 (MQ=255) aTAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGa < 2:13795/149‑1 (MQ=255) ccATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCa > 3:126130/1‑123 (MQ=255) ccATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCa < 4:126130/123‑1 (MQ=255) ccATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGAt > 3:249186/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCt > 1:345290/1‑149 (MQ=255) cTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGa > 1:180321/1‑137 (MQ=255) cTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGa < 2:180321/137‑1 (MQ=255) cTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCtt < 5:62891/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCtt < 4:249186/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTTCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGc < 8:259459/149‑1 (MQ=255) gcgAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGAtt < 7:232207/133‑1 (MQ=255) gcgAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGGGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGAtt > 8:232207/1‑133 (MQ=255) ggtgCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCg < 2:345290/149‑1 (MQ=255) tacgtatcTGGTATTGCTGATTAAACCCAAGTCGAT‑TAGGTCCATGGGGCCCAGCTTCTGGAATGTTTTGGTCATCTTTGTTGTCTTTTACGCATTTGGGATTGGGTTTTCGGTGACGTTTTTAACTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGa < 8:156948/141‑1 (MQ=255) gCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACt > 4:231320/1‑149 (MQ=255) gAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTTAACGCATTGGGCATGCGCATTTCGATTACGATTTCACCTTCCCGCGGGACCAGCCCCGGaaataacgg > 7:156948/1‑139 (MQ=255) tCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGc < 1:166334/119‑1 (MQ=255) tCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGc > 2:166334/1‑119 (MQ=255) tGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGcccc > 1:357807/1‑149 (MQ=255) aCCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTggg > 8:136573/1‑149 (MQ=255) acaGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGt > 2:12953/1‑149 (MQ=255) acaGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGt > 2:18728/1‑149 (MQ=255) caGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTc < 7:136573/149‑1 (MQ=255) aCGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGa > 6:319891/1‑148 (MQ=255) ggTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGAAACGGCCACCAACa < 8:112160/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGAAACGGCCACCAACa < 3:231320/149‑1 (MQ=255) gggtgatcTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGAAACGGCCACCAACAGTg > 5:311472/8‑149 (MQ=255) | ACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCGTCTTCTACCAGGGTGCACCGATAACCATAGTCCTTGGCGCGGCGAACGGTGGTGCTGACGCTGGAATGGCTCATGAAACCACAGACGAT‑CAGGTCCAGGTGGCCCAGCTCCTGCAATGTTTCGTGCAGCTTGGTGTTCTTGAACGCATTGGGCATGCGCTTTTCGATGACGATTTCACCTTCCAGCGGCTCCAGCCCCGGAATGAACTGGCCAGCCGGCCCCTGGGGGTCGAAACGGCCACCAACAGTG > NC_002947/2051176‑2051463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |