| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5334843 = | 73 (1.150) | 17 (0.290) | 16/258 | 4.0 | 20.4% | coding (1273/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 5334835 | 65 (1.100) | coding (1265/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GCCGTGCACTGATCGTCGCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGC > NC_002947/5334691‑5334983 | gccgTGCACTGATCGTCGCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgcc > 3:48019/1‑148 (MQ=255) cACTGATCGTCGCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgccaaccgc > 5:242355/1‑148 (MQ=255) aCTGATCGTAGCCATCATCAAAGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGTGCATCGTCGCCTTCGTAGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgcaaaccgac > 7:264645/1‑146 (MQ=255) aTCGTCGCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGccaaccgccaaccg > 3:364791/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgccaaccgccgcggtt > 8:82269/1‑143 (MQ=255) gtcgCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgccaaccgccgcggttt < 7:82269/148‑8 (MQ=255) tcgCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACcgccgc > 3:37197/1‑149 (MQ=255) ccATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTTCCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCTCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgccaaccgccaac < 3:315634/140‑1 (MQ=255) atcatcACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGttt < 1:186881/149‑1 (MQ=255) tcatcaCCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTc < 2:328420/149‑1 (MQ=255) catcaCCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCa > 6:385572/1‑149 (MQ=255) tcaCCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATc > 5:247242/1‑149 (MQ=255) tcaCCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATc < 2:193944/149‑1 (MQ=255) tcaCCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTACTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATc > 5:196954/1‑149 (MQ=255) cgGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCATTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGgc < 4:37197/149‑1 (MQ=255) gCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCg < 1:129625/149‑1 (MQ=255) ttCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCgg > 3:92808/1‑149 (MQ=255) tACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCg > 6:253491/1‑138 (MQ=255) tACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCg < 5:253491/138‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCAccc > 6:369915/1‑149 (MQ=255) ccTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgtgt < 3:171859/148‑1 (MQ=255) aGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTg < 5:165491/147‑1 (MQ=255) aGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTg < 4:92808/147‑1 (MQ=255) aGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgt < 5:385572/149‑1 (MQ=255) aGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGAt < 8:13788/148‑1 (MQ=255) gCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgt < 8:255606/148‑1 (MQ=255) ccAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgtgt < 6:196954/149‑1 (MQ=255) ccAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgtgt > 8:52520/1‑149 (MQ=255) ccAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGgtgt > 3:309940/1‑149 (MQ=255) ccaccaGAGCCTGGCCAACCTGGGAATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGa > 5:89827/1‑149 (MQ=255) caccaGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGAc > 4:223262/1‑149 (MQ=255) accaGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGAc > 3:322792/1‑148 (MQ=255) tGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCAtgctgctg > 1:54054/1‑149 (MQ=255) gCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCAtgctgctgc < 4:309940/148‑1 (MQ=255) gCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCAtgctgctgc < 4:48019/148‑1 (MQ=255) cAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGc > 6:99203/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCaa > 6:85905/1‑149 (MQ=255) ggCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCTGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTtctc < 8:12900/147‑1 (MQ=255) ggCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCgg < 4:364791/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCaa > 7:96238/1‑149 (MQ=255) tcgCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTg > 2:333730/1‑149 (MQ=255) tcgCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTg < 6:247242/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGtt < 6:135239/76‑1 (MQ=255) gCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGtt > 5:135239/1‑76 (MQ=255) ccTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTG‑‑‑‑‑‑‑GCCAACCGCCGCGGCTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCt < 4:315840/149‑1 (MQ=255) cTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAgg > 1:53215/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCa < 1:308309/146‑1 (MQ=255) ttCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCa > 2:308309/1‑146 (MQ=255) ttCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAggg > 3:325182/1‑149 (MQ=255) cgtcgCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTtctc > 4:272692/1‑133 (MQ=255) cgtcgCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTtctc < 3:272692/133‑1 (MQ=255) cgtcgCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAggg < 8:96238/147‑1 (MQ=255) ccACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGTGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAggg < 1:277861/142‑1 (MQ=255) ccACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAggg > 2:277861/1‑142 (MQ=255) ccACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGGCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTAc < 6:242355/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTGTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATcc < 6:89827/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATcc > 6:126076/1‑149 (MQ=255) ttGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgc > 6:120686/1‑40 (MQ=255) ttGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGgc < 5:120686/40‑1 (MQ=255) aggtCCTTCCAGTAGTGCTGTAGGTAGTCTACTGTCCAACAGCCAACCGCCGCTGTTTCATGGCCTTGCTGCTGGCCGTCACCCTGTTGTGGATGGTGACCATGCTGATGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCtctg < 8:264645/146‑1 (MQ=255) ttCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTtct < 8:177338/116‑1 (MQ=255) ttCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTtct > 7:177338/1‑116 (MQ=255) ttCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCgctgct > 7:181849/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGTGTTTCTACATCCCGCTGCTGGa > 6:134646/1‑148 (MQ=255) gCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCAccc > 5:19007/1‑77 (MQ=255) gCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCAccc < 6:19007/77‑1 (MQ=255) aGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCt < 3:223262/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACa < 2:292300/123‑1 (MQ=255) tGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACa > 1:292300/1‑123 (MQ=255) ctctACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGcagcagc < 4:322792/148‑7 (MQ=255) ctctACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGgacga < 4:325182/149‑1 (MQ=255) ctctACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGgacga < 5:369915/149‑1 (MQ=255) tctACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGgacga < 1:125591/148‑1 (MQ=255) tACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGgacga > 2:125591/1‑146 (MQ=255) tACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGacac > 3:9756/1‑149 (MQ=255) cTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGacac < 4:9756/147‑1 (MQ=255) tGGCCAACCGTCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGctgctg < 1:312221/120‑1 (MQ=255) tGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGctgctg > 2:312221/1‑120 (MQ=255) ggCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGc > 7:28902/1‑149 (MQ=255) | GCCGTGCACTGATCGTCGCCATCATCACCGCCGGCTTCATGTTCTACCTGAGCCAGAACTACCACCAGAGCCTGGCCAACCTGGGCATCGTCGCCTTCGTCGCCACCTTGCAGTTCCTGCCCGGAGTGCTGTCGGTACTCTACTGGCCAACCGCCAACCGCCGCGGTTTCATCGCCGGGCTGCTGGCCGGCACCCTGGTGTGGATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGC > NC_002947/5334691‑5334983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |