New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 744921 = | NA (NA) | 42 (0.660) | 37/254 | NT | 87.5% | intergenic (‑586/+45) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
? | NC_002947 | 748230 = | 6 (0.090) | coding (283/819 nt) | PP_5449 | hypothetical protein |
TACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745068‑744921 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG > NC_002947/748230‑748373 gACGTGGCGCAGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACC > 4:96381/2‑149 CTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAA > 3:95007/1‑149 CGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAA < 5:198631/149‑1 CTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACC > 5:177111/1‑121 CTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACC < 6:177111/121‑1 CCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGC < 2:260773/148‑1 CGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTT < 5:34918/149‑1 CTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGA < 2:81971/149‑1 CTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTT > 6:92144/1‑147 TCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAG > 6:32234/1‑149 ATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGG > 4:290995/1‑149 GGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGG < 5:92144/149‑1 GGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCG > 5:145732/1‑148 AGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTTGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGA < 6:36449/137‑1 ACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTT > 4:105011/1‑149 CGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGCCTTGTCT < 6:145732/149‑1 CTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACTGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTTGTATGTGGGGTTCATGTATCGGTTACCGAATTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTA < 3:306058/149‑1 TGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGC > 3:63475/1‑127 TGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGC < 4:63475/127‑1 CTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑G < 5:208191/148‑1 GCCATGGAACTGTTCGCAAGAGATGCCACGGTAACTTTGGATTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGATTGGACTCCCTCAACTGTAAGTTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATC > 4:368609/1‑149 CCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GAT < 5:32234/147‑1 CCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTC < 2:281770/96‑1 CCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTC > 1:281770/1‑96 ATGGAACTGTTCGCCAGTGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGAT < 2:406999/124‑1 CTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATAGATCGGAAggag > 7:96328/1‑145 CTGTTAGCCAGAGATGCCACTGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTA < 8:96328/135‑1 GCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTAT > 3:376163/1‑148 TTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAG > 3:223455/1‑149 GGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAG > 4:244808/1‑68 GGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAG < 3:244808/68‑1 TTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTTTGACGTAGATCTGCTACTAAAGttac > 6:245765/1‑143 TTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAAC > 6:174489/1‑147 CACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCC > 3:368946/1‑149 CACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCC < 3:105011/149‑1 CACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGC < 5:174489/148‑1 agCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGTAGTTTGGACTGCCTCATCTGTAAGGTGCTGGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTAC < 1:259602/132‑1 acaTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGTATCTGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTTTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATTGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTAC < 1:253742/131‑1 ACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCC < 3:290995/149‑1 CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCa > 6:117802/1‑112 CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCC > 6:123662/1‑113 GTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAG < 3:407543/149‑1 TGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAA < 4:95007/149‑1 GATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATG > 1:187269/1‑149 ATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCATCTGTAATGTGCTCTGTTTGAGGGCTGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATG < 3:368609/148‑1 GTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG > 4:141877/1‑149 TACGTGGCTGCGCCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745068‑744921 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG > NC_002947/748230‑748373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |