| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 885134 | 56 (0.880) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.2% | coding (1045/2718 nt) | PP_0767 | LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 885159 | 56 (0.930) | coding (1070/2718 nt) | PP_0767 | LuxR family transcriptional regulator | |||||
CTGCGCTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTC > NC_002947/884992‑885281 | cTGCGCTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTgcg > 4:38597/1‑147 (MQ=255)cTGCGCTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTgcg > 3:188715/1‑147 (MQ=255) tGCGCTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAg > 5:191637/1‑149 (MQ=255) cgcTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAgcc > 4:336307/1‑149 (MQ=255) cGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCa < 2:35733/148‑1 (MQ=255) tgcgatgcgTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAAt > 7:280273/1‑149 (MQ=255) gATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgc > 5:155439‑M2/1‑147 (MQ=255) gATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgc > 8:280273‑M2/1‑147 (MQ=255) gATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgc > 2:93766‑M2/1‑147 (MQ=255) gATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCg < 5:39098‑M2/148‑2 (MQ=255) tGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgcag > 6:388501‑M2/1‑145 (MQ=255) gTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCAATGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgcaggtc < 2:326149‑M2/149‑8 (MQ=255) ccgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGgcga > 8:52162/1‑131 (MQ=255) ccgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGgcga < 7:52162/131‑1 (MQ=255) cgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcgga < 4:33028‑M1/147‑36 (MQ=255) cgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcgga > 3:33028‑M1/1‑112 (MQ=255) cgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGct > 7:207550/1‑147 (MQ=255) cgccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGct < 8:207550/147‑1 (MQ=255) gccACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaa < 6:4047‑M1/149‑39 (MQ=255) aCGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCAt > 7:109129/1‑149 (MQ=255) aCGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCAt < 3:336307/149‑1 (MQ=255) gACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCCCAGGTCGCTCTGCAttt > 2:313795/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCgg < 4:153910/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCgg < 5:102724/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCgg < 3:38597/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCgg < 6:39098/149‑1 (MQ=255) cgccgTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAgccgc < 4:199005/109‑1 (MQ=255) cgccgTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAgccgc > 3:199005/1‑109 (MQ=255) cTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTg < 4:237513/149‑1 (MQ=255) cTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGCTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTg < 4:117871/149‑1 (MQ=255) tGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAAt > 2:97868/1‑114 (MQ=255) tGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAAt < 1:97868/114‑1 (MQ=255) gAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCTTTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATAGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTggg > 6:293103/1‑148 (MQ=255) cTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgc < 5:399886‑M2/113‑3 (MQ=255) cTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgc > 6:399886‑M2/1‑111 (MQ=255) gcgcATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGa < 6:232573/149‑1 (MQ=255) gcATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGgc < 8:81952/90‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAg < 8:90445/137‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAg > 7:90445/1‑137 (MQ=255) tCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACctgc > 2:187861/1‑149 (MQ=255) gtTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGAc > 6:374720/1‑148 (MQ=255) ttGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCg > 3:120263/1‑149 (MQ=255) tGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAg > 8:211732/1‑149 (MQ=255) gAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCttt < 1:187861/149‑1 (MQ=255) aGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGaa > 7:251028/1‑110 (MQ=255) aGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGaa < 8:251028/110‑1 (MQ=255) gCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGc < 4:188715/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGc < 6:191637/149‑1 (MQ=255) ctGGCCACTGGTTCCGCTACCCCCATTTGTTCTCCGACCTGCGGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCATGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGt < 5:293103/148‑1 (MQ=255) aTGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGt > 7:25987/1‑149 (MQ=255) ccACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCg > 4:209356/1‑149 (MQ=255) ccACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCg > 5:227443/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGc < 7:228426/149‑1 (MQ=255) tGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCa > 3:271075/1‑149 (MQ=255) gCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGAt < 7:211732/149‑1 (MQ=255) cTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACct < 6:283638/102‑1 (MQ=255) cTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACct > 5:283638/1‑102 (MQ=255) tATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGc < 5:346353/138‑1 (MQ=255) tATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGc > 6:346353/1‑138 (MQ=255) tCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGtt < 8:109129/148‑1 (MQ=255) tCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTCCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGt < 1:326149/147‑1 (MQ=255) aCCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCaa > 8:167317/1‑92 (MQ=255) aCCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCaa < 7:167317/92‑1 (MQ=255) aCCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTgcc < 4:120263/149‑1 (MQ=255) ccATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTgccg > 7:175215/1‑149 (MQ=255) aTTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTgccgcc > 3:209224/1‑149 (MQ=255) ttCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggc < 6:4047‑M2/149‑112 (MQ=255) ctcCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTgg > 6:327860/1‑149 (MQ=255) tcCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcg < 4:33028‑M2/147‑113 (MQ=255) tcCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCgcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcg > 3:33028‑M2/1‑35 (MQ=255) tcCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGt > 3:172098/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTg < 8:175215/148‑1 (MQ=255) gACCTGCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccattggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccac < 2:326149‑M1/149‑143 (MQ=255) cTGCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccacgca > 6:388501‑M1/1‑4 (MQ=255) gctgcGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCg > 4:2262/1‑113 (MQ=255) gctgcGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCg < 3:2262/113‑1 (MQ=255) gCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccacgcatc > 5:155439‑M1/1‑2 (MQ=255) gCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccacgcatc > 8:280273‑M1/1‑2 (MQ=255) gCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccacgcatc > 2:93766‑M1/1‑2 (MQ=255) gCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaag > 6:399886‑M1/1‑2 (MQ=255) gCgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaag < 5:399886‑M1/113‑112 (MQ=255) cgattcgctcgcctggcggctgcgcagcaggtcggagaacaaatggtgatagcggaaccagtggccatgctcgtccagcggcacaaggaacacctgatgcgcctgcaggaagctcaggacggcggcgctgtcgtggcggccacgcatc < 5:39098‑M1/148‑148 (MQ=255) | CTGCGCTCCGCTTTGCGATGCGATGCGTGGCCGCCACGACAGCGCCGCCGTCCTGAGCTTCCTGCAGGCGCATCAGGTGTTCCTTGTGCCGCTGGACGAGCATGGCCACTGGTTCCGCTATCACCATTTGTTCTCCGACCTGCTGCGCAGCCGCCAGGCGAGCGAATCGCAGGTCGCTCTGCATTTGCGGGCCTGCCGCTGGTTTGAAGCTCAAGACCTGCTGGACGAGGCGGTGGAGCAGGCTTTGCGTGCCGGCCACCTCGATGTTGCCGCCGACCTGGTGCAAAGTC > NC_002947/884992‑885281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |