New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1811611 | 48 (0.750) | 5 (0.080) | 5/244 | NT | 9.2% | coding (807/897 nt) | PP_1615 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1811657 | 53 (0.860) | coding (761/897 nt) | PP_1615 | LysR family transcriptional regulator |
ACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGG > NC_002947/1811466‑1811758 | aCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGa > 7:124567/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCa > 6:194151/1‑148 (MQ=255) ttACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCtggaggcgcaccaaccgccg > 5:141645‑M1/1‑128 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGt < 6:326203/148‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTAt > 2:52946/1‑149 (MQ=255) aaGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTcggc > 4:58544/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCT‑‑‑CTGCtggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatggg < 7:225303‑M1/148‑37 (MQ=255) ccAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCCGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTgg < 7:298493/149‑1 (MQ=255) cAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCtggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggc > 2:243‑M1/1‑112 (MQ=255) cAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCtggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggc < 6:141645‑M1/149‑38 (MQ=255) cAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGt < 4:400484/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTgcgc > 5:103688/1‑149 (MQ=255) cagcagCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCt > 2:118842/1‑149 (MQ=255) cagcagCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCt > 3:113389/1‑149 (MQ=255) gcagcaCATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTcc > 7:125970/1‑149 (MQ=255) gCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgc > 6:103688‑M2/1‑147 (MQ=255) caTCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagc > 4:113389‑M2/1‑144 (MQ=255) caTCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagc > 3:50035‑M2/1‑144 (MQ=255) aTCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagc < 5:166079‑M2/148‑6 (MQ=255) tCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGa < 2:102461/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCtggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcaga < 1:243‑M1/148‑55 (MQ=255) cGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGacac > 7:249549/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTcggcg < 6:267309/123‑1 (MQ=255) gTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTcggcg > 5:267309/1‑123 (MQ=255) gAATCGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCTCCGTACGTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTgc < 2:307208/124‑1 (MQ=255) gAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagc > 4:309880‑M2/1‑131 (MQ=255) gAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagc < 3:309880‑M2/136‑6 (MQ=255) gAAACGATACTCCGGCAACACCGCCAACCCCTCCTTCAGCTAATCCACCAACAGACGTACCTTCCGCGACACGTGCCTCTTCAGCCGATACAGCGCCCATACCGCCGTAATCGGCGCTTGGTgc > 1:307208/1‑124 (MQ=255) cGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACt < 6:166079/149‑1 (MQ=255) gATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTg < 3:181737/149‑1 (MQ=255) cTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGac > 6:172524/1‑130 (MQ=255) cTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGac < 5:172524/130‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg > 8:362257/1‑149 (MQ=255) tCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg > 6:328999/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg < 1:115342/147‑1 (MQ=255) gCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGgtgt < 3:333949/149‑1 (MQ=255) gCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGgtgt > 4:333949/1‑149 (MQ=255) aCCCCCCCCACCCCTCCTTCAGCTAACCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTCCGGATACCGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTcc < 8:116711/149‑1 (MQ=255) cccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAg < 5:328999/149‑1 (MQ=255) aaCCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgta < 7:362257/149‑1 (MQ=255) aaCCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgta < 8:124567/149‑1 (MQ=255) aCCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgtag < 8:249549/149‑1 (MQ=255) cctcctTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTaa < 3:58544/149‑1 (MQ=255) ctcctTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTaa > 4:210781/1‑148 (MQ=255) ctTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATcc < 8:125970/148‑1 (MQ=255) ggTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAAc > 4:306084/1‑149 (MQ=255) tAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGAGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTg > 4:28407/1‑149 (MQ=255) tCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGca > 3:102426/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTg < 4:102426/148‑1 (MQ=255) ccTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGAGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTg < 3:28407/148‑1 (MQ=255) cGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAGTCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAg < 6:208839/147‑1 (MQ=255) gCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAcc < 8:340391/132‑1 (MQ=255) gCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAcc > 7:340391/1‑132 (MQ=255) gTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATc > 2:316892/1‑147 (MQ=255) ccTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCa > 5:387284/1‑149 (MQ=255) ccTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCa < 3:306084/149‑1 (MQ=255) ccTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCa > 4:74675/1‑149 (MQ=255) ctctGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCAc > 7:280542/1‑149 (MQ=255) tctGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttcggctgacgg < 1:243‑M2/148‑95 (MQ=255) tgctgcGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAcc > 3:313829/1‑118 (MQ=255) tgctgcGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAcc < 4:313829/118‑1 (MQ=255) gctgctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttcggctgacgggatg > 4:113389‑M1/1‑5 (MQ=255) gctgctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttcggctgacgggatg > 3:50035‑M1/1‑5 (MQ=255) gctgctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttcggctgacgggat < 5:166079‑M1/148‑144 (MQ=255) gctgctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttc > 4:309880‑M1/1‑5 (MQ=255) gctgctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttc < 3:309880‑M1/136‑132 (MQ=255) ctgcGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTg > 4:322210/1‑126 (MQ=255) tgcGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGGTCAGGAGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTCCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTg > 4:246582/1‑149 (MQ=255) gctggaggcgcaccaaccgccgaatacggcggtatgggcgctgtatccgcagcagaggcacctgtcgccgaaggtacggcggctggtggattacctgaaggaggggttggcggggttgccggagtatcgtttcggctgacgggatgtgc > 6:103688‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCCCATACCGCCGTATTCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGG > NC_002947/1811466‑1811758 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |