New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3395975 = | 52 (0.810) | 6 (0.100) | 4/244 | NT | 11.1% | coding (137/456 nt) | PP_3000 | MaoC domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 3396024 = | 46 (0.750) | coding (186/456 nt) | PP_3000 | MaoC domain‑containing protein |
AGGTGCAGGCATGAGCGTGATTGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTGGGACTTCGTGCTGCCGAT > NC_002947/3395829‑3396122 | aGGTGCAGGCATGAGCGTGATTGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAgg < 1:235936/149‑1 (MQ=255) gCAGGCATGAGCGTGATTGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTa > 8:389631/1‑149 (MQ=255) gCATGAGCGTGATTGAAAAGTACTGGGACGGATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTacgc > 1:244752/1‑149 (MQ=255) aTTGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACgccagcca > 8:326968/1‑149 (MQ=255) ttGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCAGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACGGTGACCCGAGAACGCATCCTGGCCTACGACGACCTCACCGCGGACCCCACCCCGGTGCATGTCGATGATGGGTACGCCAACGCCCGCCAc > 8:289617/1‑149 (MQ=255) aaaaGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACttt < 7:326968/149‑1 (MQ=255) aaaaGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACttt > 6:285262/1‑149 (MQ=255) aaaaGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACttt > 3:69000/1‑149 (MQ=255) tACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTg > 5:102869/1‑149 (MQ=255) ggAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACtt > 8:299594/1‑138 (MQ=255) ggAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACtt < 7:299594/138‑1 (MQ=255) ggAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTgg > 6:153440/1‑149 (MQ=255) ggAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCAAAGTGGCTggcgtt < 6:276363/149‑6 (MQ=255) tGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGccc > 8:159065/1‑149 (MQ=255) gcgAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGc < 4:118361/149‑1 (MQ=255) gcgAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGc < 1:227935/149‑1 (MQ=255) aGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGt > 4:223361/1‑149 (MQ=255) ggCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGTCCACACCCCGGTGCATGTCGATGa < 7:259310/98‑1 (MQ=255) ggCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGa > 8:259310/1‑98 (MQ=255) ggcagcacgaagtcccaggtccagcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTc > 5:142276‑M1/97‑149 (MQ=255) gATGAGTGCATCAGCCCGAACTACACCGTGACCCGCTAACGCATCCTGGCCTACGCCGACATCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACTCCAACGCCAGCAACTTTGCCTGCATGCTCGCCCACGGCATGATccg > 8:199032/1‑147 (MQ=255) aTGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCggg < 3:256650/149‑1 (MQ=255) aTGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCggg < 3:45133/149‑1 (MQ=255) gAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGc < 7:389631/148‑1 (MQ=255) gAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCt > 6:185785/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATc < 5:153440/149‑1 (MQ=255) ccaggtccagcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCgg < 3:45947‑M1/55‑1 (MQ=255) ccaggtccagcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCgg > 4:45947‑M1/83‑137 (MQ=255) caggtccagcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTc < 1:188117‑M1/53‑1 (MQ=255) caggtccagcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTc > 2:188117‑M1/82‑134 (MQ=255) tctcggcccagcgacatgcccggcaggaagcggtactcgcactgggtcttcaggccgtcggcgatcgacagcccgaacAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTc > 3:223977‑M1/79‑131 (MQ=255) cGACCTACAGCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCCCCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGCTGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGAc < 7:199032/149‑1 (MQ=255) cGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGAc < 5:285262/149‑1 (MQ=255) acacCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCt > 8:96639/1‑148 (MQ=255) acacCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCt > 4:74527/1‑148 (MQ=255) cGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGa > 4:177760/1‑149 (MQ=255) cGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGa > 7:135570/1‑149 (MQ=255) cccGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAg < 2:244752/149‑1 (MQ=255) gAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGa < 5:76171/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGa > 5:172654/1‑133 (MQ=255) aTCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGa < 6:172654/133‑1 (MQ=255) aTCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCg > 3:12626/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGa < 1:211597/119‑1 (MQ=255) cTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGa > 2:211597/1‑119 (MQ=255) tGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGAccc < 7:273230/132‑1 (MQ=255) tGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGAccc > 8:273230/1‑132 (MQ=255) gCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCAGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCt > 3:360663/1‑149 (MQ=255) ccTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTg < 7:96639/149‑1 (MQ=255) ccGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGc < 3:198002/149‑1 (MQ=255) ccGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGc < 4:138510/149‑1 (MQ=255) cTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTACGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTc > 3:353021/1‑149 (MQ=255) cGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCgctgg > 2:56679/1‑149 (MQ=255) cGACCACACGCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCgctgggct > 6:363328/1‑149 (MQ=255) gACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCgctgggctg < 4:69000/149‑1 (MQ=255) cacaCCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGAc > 7:304151/1‑149 (MQ=255) acCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGc > 2:269051/1‑66 (MQ=255) acCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGc < 1:269051/66‑1 (MQ=255) ccccGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTgg < 3:177760/149‑1 (MQ=255) cccGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTgg > 2:313428/1‑148 (MQ=255) cccGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTgg > 7:149743/1‑148 (MQ=255) tGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTGGGACTTCGtgc > 2:364008/1‑149 (MQ=255) gATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTGGGACTTCGtgctgc < 8:135570/148‑1 (MQ=255) AGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTGGGACTTCGTGCTGCCGAt > 1:364008‑M1/1‑148 (MQ=255) | AGGTGCAGGCATGAGCGTGATTGAAAAGTACTGGGAC‑GATGCCCGCGAAGGCGATGAGTGCATCAGCCCGACCTACACCGTGACCCGCGAACGCATCCTGGCCTACGCCGACCTCACCGGCGACCACACCCCGGTGCATGTCGATGAGGCCTACGCCAACGCCAGCCACTTTGGCTGCCTGGTCGCCCACGGCCTGTTCGGGCTGTCGATCGCCGACGGCCTGAAGACCCAGTGCGAGTACCGCTTCCTGCCGGGCATGTCGCTGGGCTGGACCTGGGACTTCGTGCTGCCGAT > NC_002947/3395829‑3396122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |