| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3914675 | 52 (0.810) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 5.4% | coding (112/702 nt) | PP_3454 | transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 3914699 | 55 (0.900) | coding (88/702 nt) | PP_3454 | transcriptional regulator | |||||
TCATGGCTATCGTCGCGGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGC > NC_002947/3914527‑3914823 | cagcgggtttacccgcgaagcgctcgccacaggcttacttcaacccagacgcccaagcacctatgccggacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAg > 2:281002‑M1/144‑149 (MQ=255)cagcgggtttacccgcgaagcgctcgccacaggcttacttcaacccagacgcccaagcacctatgccgaacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAg > 8:207077‑M1/144‑149 (MQ=255) ggCTATCGTCGCGGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGcaca > 7:324923/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCGGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGAt < 5:38775/148‑1 (MQ=255) tcgCGGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGcc > 1:347307/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGccc < 1:193279/149‑1 (MQ=255) gCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGc < 2:347307/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAGGAGGCCGGGCCGGGGCTGCGACTCCTCGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCCAGGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCCGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCg < 8:262350/149‑1 (MQ=255) gTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACAt < 3:200556/133‑1 (MQ=255) gTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACAt > 4:200556/1‑133 (MQ=255) tCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCGGGGCGAt > 3:208241/1‑148 (MQ=255) tCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCGGGGCGAt < 4:208241/148‑1 (MQ=255) cATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACct < 3:77886‑M2/149‑3 (MQ=255) aTGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTCTCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctg > 1:291857‑M2/1‑146 (MQ=255) tGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCATGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctgg > 6:379528‑M2/1‑145 (MQ=255) aGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctggac > 4:77886‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACa < 6:188531/149‑1 (MQ=255) aTTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgag < 3:71553‑M1/149‑34 (MQ=255) taggCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATgg < 8:324923/147‑1 (MQ=255) gCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCTCAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAg > 7:247979/1‑149 (MQ=255) ttcaacccagacgcccaagcacctatgccgaacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATg < 5:85817‑M1/39‑1 (MQ=255) ttcaacccagacgcccaagcacctatgccgaacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATg > 6:85817‑M1/106‑144 (MQ=255) cAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGa > 4:32516/1‑118 (MQ=255) cAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGa < 3:32516/118‑1 (MQ=255) cccagacgcccaagcacctatgccgaacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACAt > 2:26811‑M1/101‑138 (MQ=255) cccagacgcccaagcacctatgccgaacattttcctggtcgaagacgacagcgccctgtccgagctgatcgccagctacctgcaacgcaacgacttccatGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACAt < 1:26811‑M1/38‑1 (MQ=255) cTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagt < 4:57125‑M1/133‑35 (MQ=255) cTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagt > 3:57125‑M1/1‑99 (MQ=255) agcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCg < 2:113223/147‑1 (MQ=255) agcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCg > 1:113223/1‑147 (MQ=255) gcCGGCACTGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATc < 7:359262/149‑1 (MQ=255) gcCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATc < 3:195850/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAg > 3:102058/1‑149 (MQ=255) cAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACatc > 8:160955/1‑146 (MQ=255) ccATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCt > 8:330324/1‑149 (MQ=255) cATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTg > 8:200423/1‑149 (MQ=255) aTCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgt > 2:106633/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCt < 7:330324/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtc < 6:243251/142‑1 (MQ=255) ccGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtc > 5:243251/1‑142 (MQ=255) ccGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTc > 7:172711/1‑148 (MQ=255) ggCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCCCGGACAGGGCGCTgtc < 4:144846/140‑1 (MQ=255) ggCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCCCGGACAGGGCGCTgtc > 3:144846/1‑140 (MQ=255) aTCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGa > 3:170300/1‑148 (MQ=255) tcgggTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGaa > 4:83725/4‑148 (MQ=255) cAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTg < 1:216857/101‑1 (MQ=255) cAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTg > 2:216857/1‑101 (MQ=255) aaGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTc < 8:172711/148‑1 (MQ=255) aaGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCg > 2:144806/1‑149 (MQ=255) aGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCgg < 1:106633/149‑1 (MQ=255) ggATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCgg > 2:187281/1‑148 (MQ=255) ggATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGc < 1:144806/149‑1 (MQ=255) gACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTcgttgcgtt < 1:206313/83‑1 (MQ=255) gACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTcgttgcgtt > 2:206313/1‑83 (MQ=255) ccAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGt > 2:83895/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtcg < 7:169643/113‑1 (MQ=255) cAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCACCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTgtcg > 8:169643/1‑113 (MQ=255) aGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTgg < 4:102058/148‑1 (MQ=255) aGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTgg < 7:200423/148‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCgg < 4:180112/132‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCgg > 3:180112/1‑132 (MQ=255) tGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTgg > 2:248107/1‑149 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTTTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGtt < 1:83895/149‑1 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGaaaa > 3:9464/1‑118 (MQ=255) cGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGaaaa < 4:9464/118‑1 (MQ=255) cGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGaa < 1:187281/149‑1 (MQ=255) gTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGt < 8:247979/149‑1 (MQ=255) aCTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggag > 3:57125‑M2/1‑34 (MQ=255) aCTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggag < 4:57125‑M2/133‑100 (MQ=255) cTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggagtcgcagaccctgccaat < 3:71553‑M2/149‑117 (MQ=255) tCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGc > 7:27909/1‑149 (MQ=255) gTCCAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggagtcgcagaccctgccaatcct > 4:77886‑M1/1‑6 (MQ=255) GTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCt < 4:82908‑M1/149‑1 (MQ=255) ccAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccatgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggagtcgcagaccctgccaatcctca > 6:379528‑M1/1‑4 (MQ=255) gaGCACATGTTCGCCCCGGGCGATCAAGTGGTCATGGAAGTGTTTTCGTTGCAGGTATCTGGAGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGAAGAGGTAATTGTTCGGCATAGGTGATTGGGc < 4:222385/125‑1 (MQ=255) cAGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagtaccgtcgagaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggagtcgcagaccctgccaatcctcat > 1:291857‑M1/1‑3 (MQ=255) CAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATTTTCGGCATAGGTGCTTGGGc < 3:222385‑M1/126‑1 (MQ=255) aGgtgatcgcccggggcgatcatgtgctggacgagtaccgtcggcaaaggcctgacctggtcatccttgacctgatgctgccgggcatcgatggcctgcagctgtgccggctgctgcgccaggagtcgcagaccctgccaatcctcatg < 3:77886‑M1/149‑148 (MQ=255) GCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTACGCCTGTGGc < 1:293751‑M1/149‑1 (MQ=255) | TCATGGCTATCGTCGCGGGCCGTCAGCATGAGGATTGGCAGGGTCTGCGACTCCTGGCGCAGCAGCCGGCACAGCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCAGCATCAGGTCAAGGATGACCAGGTCAGGCCTTTGCCGACGGTACTCGTCCAGCACATGATCGCCCCGGGCGATCACCTGGACATGGAAGTCGTTGCGTTGCAGGTAGCTGGCGATCAGCTCGGACAGGGCGCTGTCGTCTTCGACCAGGAAAATGTTCGGCATAGGTGCTTGGGCGTCTGGGTTGAAGTAAGCCTGTGGC > NC_002947/3914527‑3914823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |