New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4957290 = | 69 (1.080) | 6 (0.100) | 4/246 | NT | 8.6% | coding (228/792 nt) | fliH | flagellar assembly protein FliH |
? | NC_002947 | 4957335 = | 61 (0.980) | coding (183/792 nt) | fliH | flagellar assembly protein FliH |
CTCGATCTGCGTGTCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGC > NC_002947/4957143‑4957438 | cgtgcccgcgacctcgagggcgtggatgtgtggacgctgccaagcttcgacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgg > 8:167391‑M1/148‑148 (MQ=255) gATCTGCGTGTCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGaa < 2:251521/147‑1 (MQ=255) aTCTGCGTGTCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGcc > 6:189083/1‑149 (MQ=255) aTCTGCGTGTCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGcc > 5:413015/1‑149 (MQ=255) gtgtCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGtt < 6:9968/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGt < 3:187419/148‑1 (MQ=255) cTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGcct < 5:212104/149‑1 (MQ=255) cTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGcct > 6:212104/1‑149 (MQ=255) gtggatgtgtggacgctgccaagcttcgacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGcctcct < 3:216105‑M1/23‑1 (MQ=255) ggCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGcctc < 5:226987/147‑1 (MQ=255) ggCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACATTGAGGTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCATCGTTGTAAGcatccg > 8:255614/1‑148 (MQ=255) aaTCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGAc < 4:388916/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGAc > 8:18482/1‑149 (MQ=255) ggCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGAt < 2:44799/149‑1 (MQ=255) tCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGcctc < 4:32398/137‑1 (MQ=255) tCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGcctc > 3:32398/1‑137 (MQ=255) cATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGt < 7:242909/128‑1 (MQ=255) cATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGt > 8:242909/1‑128 (MQ=255) cATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCtt > 5:334353/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 4:333575/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 3:391374/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 5:361484/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc > 8:153904/1‑149 (MQ=255) aGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAg < 2:148056/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAg < 3:119108/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGc > 8:312751/1‑148 (MQ=255) ggCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGctct < 7:255614/148‑1 (MQ=255) gCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTc < 4:372504/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTaa < 8:290326/116‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTaa > 7:290326/1‑116 (MQ=255) tCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAgg < 1:332161/149‑1 (MQ=255) cgacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCa > 1:226323‑M1/101‑147 (MQ=255) cgacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCa > 4:216105‑M1/101‑147 (MQ=255) gacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAggg > 6:86961‑M1/100‑149 (MQ=255) gCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTAGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGt > 7:134025/1‑148 (MQ=255) ccGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTc > 1:156299/1‑148 (MQ=255) gCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGt < 6:120863/108‑1 (MQ=255) gCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGt > 5:120863/1‑108 (MQ=255) tCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATg < 4:349920/123‑1 (MQ=255) tCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATg > 3:349920/1‑123 (MQ=255) accggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCa > 7:36632‑M1/92‑138 (MQ=255) accggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCa < 8:36632‑M1/47‑1 (MQ=255) tCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGActtc > 1:30805/1‑149 (MQ=255) ttttCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc > 1:358389/1‑109 (MQ=255) ttttCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 2:358389/109‑1 (MQ=255) gggCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcc > 3:305294/1‑149 (MQ=255) gggCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcc > 5:423598/1‑149 (MQ=255) ccTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcg < 6:413015/149‑1 (MQ=255) ctTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcgact > 2:47717/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcgactt > 5:254247/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcgact < 6:334353/146‑1 (MQ=255) gCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 8:161129/92‑1 (MQ=255) cctcctGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcgacttcctcg < 2:156299/149‑1 (MQ=255) ctcctGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCActtcctcgacttcctcga < 7:153904/149‑1 (MQ=255) ctGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGa < 7:312751/149‑1 (MQ=255) gCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCACCGCCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCt > 4:63928/1‑149 (MQ=255) gAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTg > 6:178717/1‑106 (MQ=255) gAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTg < 5:178717/106‑1 (MQ=255) gCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctcaggc < 7:18482/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctcaggctca < 4:305294/148‑1 (MQ=255) cTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCaggctcaggctc < 5:189083/149‑1 (MQ=255) gtgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc < 5:321156/63‑1 (MQ=255) gtgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTc > 6:321156/1‑63 (MQ=255) tgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCActtcctcgacttcctcga < 6:132546/121‑1 (MQ=255) tgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCActtcctcgacttcctcga > 5:132546/1‑121 (MQ=255) tgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCgg > 2:401908/1‑149 (MQ=255) gAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGtt > 3:379571/1‑149 (MQ=255) aaGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTc < 4:243078/149‑1 (MQ=255) aaGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTc < 1:47717/149‑1 (MQ=255) aaGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTc > 3:243078/1‑149 (MQ=255) aGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCg > 2:369828/1‑149 (MQ=255) gCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGATGCCATCGTTGTAAGCCTCCTGACGGAGGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCTACTTCCTCTATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCgt < 8:197416/149‑2 (MQ=255) cccTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCggg < 2:107028/149‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCg > 5:10779/1‑149 (MQ=255) tCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCacttcctcga > 6:97215/1‑97 (MQ=255) tCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTc > 2:277192/1‑149 (MQ=255) ccGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTCCgg < 1:369828/149‑1 (MQ=255) GAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGc < 7:384787‑M1/149‑1 (MQ=255) GAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGc < 2:263943‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTCGATCTGCGTGTCCTGCTCGGCAATCGGCTCCATCAGGTTGGCCATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGGTTCCGGGTCGAAGC > NC_002947/4957143‑4957438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |