| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5248442 = | 84 (1.310) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 5.0% | coding (219/3303 nt) | PP_4623 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 5248487 = | 71 (1.160) | coding (174/3303 nt) | PP_4623 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GTGGTTTCAAACTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGAAAGACATGAACT > NC_002947/5248300‑5248587 | cctttatcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGc < 7:29511‑M1/2‑1 (MQ=255) ctttatcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGcc < 2:374718‑M1/3‑1 (MQ=255) tttCAAACTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTgcg > 5:77862/1‑149 (MQ=255) tatcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGCCCAg < 1:249195‑M1/6‑1 (MQ=255) tatcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGCCCAg < 8:222374‑M1/6‑1 (MQ=255) tatcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGCCCAg > 1:63960‑M1/143‑148 (MQ=255) atcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGCCCAg < 5:134670‑M1/6‑1 (MQ=255) atcatccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGCCCAg < 1:381814‑M1/6‑1 (MQ=255) tCAAACTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTCgcgc < 1:252374/148‑1 (MQ=255) aaaCTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAAc > 4:108663/1‑149 (MQ=255) tccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGccc < 3:198572‑M1/4‑1 (MQ=255) tccgttcactctgctgcttcggtaattttggagcacagttcatgtctttcgatttcaattttggcacccccaatctcggtgaggggtgcccagatccacgctctgtgaaagaacaggtgaaggccatgatggctcacGccc > 4:198572‑M1/138‑141 (MQ=255) aaCTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAAcc > 8:29648/1‑149 (MQ=255) cTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCg > 8:100511/1‑148 (MQ=255) ttAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTa < 7:100511/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTACTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTa < 6:7496/147‑1 (MQ=255) aTCTTGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTTCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGc < 3:384583/148‑1 (MQ=255) aTCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACATCCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGGAACCGTAGc < 6:354314/148‑1 (MQ=255) 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ccaccaCTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAAc > 3:289929/1‑126 (MQ=255) ccaccaCTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCt > 6:340411/1‑149 (MQ=255) accacTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTcc > 2:14777/1‑149 (MQ=255) acTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTgg < 5:423768/149‑1 (MQ=255) ggCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCa > 1:275777/1‑129 (MQ=255) ggCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCa < 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tAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCAcc > 3:18006/1‑149 (MQ=255) aaCGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTgg < 5:320306/142‑1 (MQ=255) aaCGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCAccc < 2:312568/148‑1 (MQ=255) aCGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCt > 2:249195/1‑149 (MQ=255) aCGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAAACGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCAAAGAGCGTGGATCTGGGCACCACt > 1:365428/1‑149 (MQ=255) cGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGc < 8:176851/130‑1 (MQ=255) cGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGc > 7:176851/1‑130 (MQ=255) cGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCt > 1:267752/1‑148 (MQ=255) gCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCa > 4:15962/1‑149 (MQ=255) ttCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACGGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTTGATCTGGGCAc < 6:379920/141‑1 (MQ=255) ttCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCAc > 5:379920/1‑141 (MQ=255) tCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAg > 6:373475/1‑65 (MQ=255) tCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTgg > 7:190318/1‑81 (MQ=255) tCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTgg < 8:190318/81‑1 (MQ=255) tCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGAtt < 2:354688/149‑1 (MQ=255) cGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTg > 7:222374/1‑149 (MQ=255) gTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTggg < 3:15962/149‑1 (MQ=255) gAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTggggg > 6:421339/1‑149 (MQ=255) gATGCGC‑‑‑CT‑CCTGTATCTGGCTGCCCTGTTGCGCAACGGTAGGCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGTGCGTGGa < 5:319407/110‑1 (MQ=255) gc‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATc > 8:348813/1‑149 (MQ=255) cT‑CCGGTATCAGGCTGCCCATTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCaaaa < 7:149355/139‑1 (MQ=255) cT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCAAAGAGCGTGGATATGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGACAAAATAGatcgta > 8:149355/1‑143 (MQ=255) t‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTT‑CAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGa > 1:211786/1‑147 (MQ=255) aTCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGAAAGACAt > 5:203999/1‑149 (MQ=255) tCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGAAAGACAt < 4:101692/148‑1 (MQ=255) aGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTg < 2:141201/91‑1 (MQ=255) aGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTg > 1:141201/1‑91 (MQ=255) gCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGAAAGACATGAACt > 2:381814/1‑149 (MQ=255) | GTGGTTTCAAACTTAATCTGGACTGTTGCTCCCACCACTGGCCAAGCACCGCCTGCCTTTGCGGCACAAGCGACTCGACAACCGCCAACGGTAAACGCTTCTGCTCGGTGAACTGTTGTCGATGCGC‑‑‑CT‑CCGGTATCAGGCTGCCCAGTTGCGCAACCGTAGCCATCAGTTGTTGCAGCTCCTGGGCGTGAGCCATCATGGCCTTCACCTGTTCTTTCACAGAGCGTGGATCTGGGCACCCCTCACCGAGATTGGGGGTGCCAAAATTGAAATCGAAAGACATGAACT > NC_002947/5248300‑5248587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |