New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5737021 = | 69 (1.080) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.4% | coding (425/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
? | NC_002947 | 5737071 = | 72 (1.150) | coding (375/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
CCCAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGG > NC_002947/5736876‑5737165 | cccAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGc < 4:161992/149‑1 (MQ=255) cccAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGc < 6:232549/149‑1 (MQ=255) cccAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGc > 8:159847/1‑149 (MQ=255) cccAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGc > 2:102568/1‑149 (MQ=255) agccagGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGa > 8:389536/1‑149 (MQ=255) cagGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt < 3:94541/149‑1 (MQ=255) cagGGTCGCGGCCAGGGGCGGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTTCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt < 2:200834/149‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGc < 7:358434/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGGACCCACTTGCCTTGCAGGCTGCCGCCGTAGTGCGGGCGACCGGCTTCGCCGAAGGGTTCATAGGGGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCcg‑gcg < 5:40/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCa > 8:165293/1‑149 (MQ=255) gccgccCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCt < 7:165293/149‑1 (MQ=255) gccCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGc < 2:33443/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt < 4:309967/120‑1 (MQ=255) ccATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt > 3:309967/1‑120 (MQ=255) gccgccCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt > 2:339919/1‑116 (MQ=255) gccgccCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt < 1:339919/116‑1 (MQ=255) cccAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCcg‑gcg > 3:199552/1‑129 (MQ=255) cccAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCcg‑gcg < 4:199552/129‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGc > 8:375587/1‑148 (MQ=255) cAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATTCCCTGGCTGCCGa < 6:47973/107‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGa > 5:47973/1‑107 (MQ=255) aGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAg < 7:115301/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCGAGCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGc < 1:231348/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAg > 7:259956/1‑146 (MQ=255) cccacagcaacgcaccgcgcgtgctgattgccaactccaacctggtgccacactgggccaactgggaacacttcaacgaactggacgccaagggcCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAt > 3:340497‑M1/96‑135 (MQ=255) cccacagcaacgcaccgcgcgtgctgattgccaactccaacctggtgccacactgggccaactgggaacacttcaacgaactggacgccaagggcCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAt < 4:340497‑M1/40‑1 (MQ=255) cGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTg < 7:21538/149‑1 (MQ=255) aGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTc < 8:203324/149‑1 (MQ=255) tACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTc > 8:43624/1‑147 (MQ=255) cccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAg < 4:202324/148‑1 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt > 6:279636/1‑92 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGt < 5:279636/92‑1 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGtt > 5:13328/1‑149 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGATGGCGACCGGATTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCATGGCCGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCACATGCCG‑GCGGTCTAATGGCCAT‑CCATCGCACGGCCCTTGGCGTCAAGtt > 8:343857/1‑149 (MQ=255) aCTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGTTGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCg > 5:314804/1‑149 (MQ=255) ttGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGc < 6:378651/115‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGc > 5:378651/1‑115 (MQ=255) gCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTg < 6:37946/148‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 7:389536/149‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 7:159847/149‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 6:13328/149‑1 (MQ=255) cTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg > 8:313516/1‑149 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATc < 4:246882/106‑1 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATc > 3:246882/1‑106 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTgg > 1:80493/1‑109 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTgg < 2:80493/109‑1 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAgt > 1:218735/1‑149 (MQ=255) tCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 3:47834/145‑1 (MQ=255) tCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa > 4:47834/1‑145 (MQ=255) cAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGtt > 1:99206/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGtt < 8:40073/148‑1 (MQ=255) ggCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTcc > 6:172991/1‑149 (MQ=255) ccgccgTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAg < 5:172991/147‑1 (MQ=255) cgTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGcc < 4:201520/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGa < 1:211660/68‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGa > 2:211660/1‑68 (MQ=255) aCCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAt > 1:82755/1‑86 (MQ=255) aCCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAt < 2:82755/86‑1 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg > 5:258078/1‑119 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg < 6:258078/119‑1 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAgg > 2:105740/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGCACGATGCCCTGGCGGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCTGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGt < 6:314811/149‑1 (MQ=255) ttCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg > 6:415133/1‑148 (MQ=255) gacgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg > 7:115823/1‑145 (MQ=255) gacgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg < 8:115823/145‑1 (MQ=255) cgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg < 7:375587/149‑1 (MQ=255) tttCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGTTGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATc < 6:314804/149‑1 (MQ=255) aTAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCa > 7:251242/1‑149 (MQ=255) ttcaacgaactggacgccaagggcCTGCCGTTGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGc < 1:33667‑M1/47‑1 (MQ=255) ttcaacgaactggacgccaagggcCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGc > 2:33667‑M1/25‑71 (MQ=255) ccTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCAt < 8:191977/49‑1 (MQ=255) ccTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCAt > 7:191977/1‑49 (MQ=255) ccTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGt < 7:43624/149‑1 (MQ=255) tGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcgc > 3:349816/1‑144 (MQ=255) tGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcgc < 4:349816/144‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGc > 5:130899/1‑149 (MQ=255) cccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCtgt < 7:313516/148‑1 (MQ=255) ccTGTCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcg < 5:262710/133‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCATGACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCtgtg > 1:291835/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg > 4:260/1‑119 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg < 3:260/119‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGACAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGCCACCAGGTTGGAGTTTGAAATCAGCAcgcg > 6:262710/1‑133 (MQ=255) cTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGATCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGGTGGAGATGGCAATCACCACGCCCGGTGCGTAGCtgtgcg > 8:159153/1‑147 (MQ=255) | CCCAGCCAGGGTCGCGGCCAGTGGCTGGGCGCCGCCCATGCCGCCCAGGCCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGG > NC_002947/5736876‑5737165 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |