New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5737021 = | 69 (1.080) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.4% | coding (425/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
? | NC_002947 | 5737071 = | 72 (1.150) | coding (375/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
CCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTTCGTC > NC_002947/5736925‑5737214 | ccAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCGAGCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGc < 1:231348/149‑1 (MQ=255) cGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTg < 7:21538/149‑1 (MQ=255) aGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTc < 8:203324/149‑1 (MQ=255) tACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTc > 8:43624/1‑147 (MQ=255) cccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAg < 4:202324/148‑1 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGtt > 5:13328/1‑149 (MQ=255) ccACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGATGGCGACCGGATTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCATGGCCGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCACATGCCG‑GCGGTCTAATGGCCAT‑CCATCGCACGGCCCTTGGCGTCAAGtt > 8:343857/1‑149 (MQ=255) aCTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGTTGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCg > 5:314804/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTg < 6:37946/148‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 7:389536/149‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 7:159847/149‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 6:13328/149‑1 (MQ=255) cTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg > 8:313516/1‑149 (MQ=255) tttCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAgt > 1:218735/1‑149 (MQ=255) tCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa > 4:47834/1‑145 (MQ=255) tCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 3:47834/145‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGtt > 1:99206/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGtt < 8:40073/148‑1 (MQ=255) ggCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTcc > 6:172991/1‑149 (MQ=255) ccgccgTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAg < 5:172991/147‑1 (MQ=255) cgTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGcc < 4:201520/149‑1 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg < 6:258078/119‑1 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAg > 5:258078/1‑119 (MQ=255) cGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAgg > 2:105740/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGCACGATGCCCTGGCGGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCTGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGt < 6:314811/149‑1 (MQ=255) ttCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg > 6:415133/1‑148 (MQ=255) gacgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg < 8:115823/145‑1 (MQ=255) gacgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTg > 7:115823/1‑145 (MQ=255) cgaAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg < 7:375587/149‑1 (MQ=255) tttCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGTTGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATc < 6:314804/149‑1 (MQ=255) aTAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCa > 7:251242/1‑149 (MQ=255) ccTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGt < 7:43624/149‑1 (MQ=255) tGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcgc < 4:349816/144‑1 (MQ=255) tGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcgc > 3:349816/1‑144 (MQ=255) gATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGc > 5:130899/1‑149 (MQ=255) cccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCtgt < 7:313516/148‑1 (MQ=255) ccTGTCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCAcgcg < 5:262710/133‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCATGACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCtgtg > 1:291835/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg > 4:260/1‑119 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTg < 3:260/119‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGACAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGCCACCAGGTTGGAGTTTGAAATCAGCAcgcg > 6:262710/1‑133 (MQ=255) cTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGATCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGGTGGAGATGGCAATCACCACGCCCGGTGCGTAGCtgtgcg > 8:159153/1‑147 (MQ=255) gcgatgtatggccagatgaccgccggcagctggatctacatcggcagGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa > 2:33667‑M2/48‑71 (MQ=255) gcgatgtatggccagatgaccgccggcagctggatctacaacggcagGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGaa < 1:33667‑M2/24‑1 (MQ=255) gTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAacacac > 1:360101/1‑149 (MQ=255) tAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAacacac < 6:130899/148‑1 (MQ=255) gATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCa > 2:53697/1‑81 (MQ=255) gATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCa < 1:53697/81‑1 (MQ=255) gATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACaccga > 5:107594/1‑149 (MQ=255) atggccagatgaccgccggcagctggatctacatcggcagGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTggg < 4:340497‑M2/95‑1 (MQ=255) atggccagatgaccgccggcagctggatctacatcggcagGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTggg > 3:340497‑M2/41‑135 (MQ=255) aTCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACaccgac < 2:291835/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAacacac < 1:230796/143‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAacacac > 2:230796/1‑143 (MQ=255) ccAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCACTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCAAGTTGTCCCAGTGTGGCAcc > 6:188750/1‑88 (MQ=255) aGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAgg > 8:106763/1‑89 (MQ=255) aGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAgg < 7:106763/89‑1 (MQ=255) aGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGc > 5:191075/1‑149 (MQ=255) gCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTcc < 1:139843/64‑1 (MQ=255) gCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTcc > 2:139843/1‑64 (MQ=255) ccG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTg < 2:99206/147‑1 (MQ=255) ccG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGcc < 2:3560/149‑1 (MQ=255) ccG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGATCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAg < 1:290074/90‑1 (MQ=255) ccG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGATCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGAGTGGCACCAGGTTGGAg > 2:290074/1‑90 (MQ=255) gcggTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGa > 3:255453/1‑149 (MQ=255) gCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCAAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACcagca < 8:251242/149‑1 (MQ=255) ccAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGc > 2:273690/1‑129 (MQ=255) ccAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGc < 1:273690/129‑1 (MQ=255) ccAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACcagcag < 7:343857/149‑1 (MQ=255) cAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAgg < 4:255453/149‑1 (MQ=255) aT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCt > 5:247559/1‑110 (MQ=255) aT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCt < 6:247559/110‑1 (MQ=255) aT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGCCCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAggg > 6:141224/1‑149 (MQ=255) aT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCAc < 8:220120/141‑1 (MQ=255) aT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCAc > 7:220120/1‑141 (MQ=255) aCATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTg < 4:210385/98‑1 (MQ=255) aCATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTg > 3:210385/1‑98 (MQ=255) aTCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTtc > 4:128611/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTtc < 6:107594/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTtcg > 5:199212/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTtcgtc > 8:230748/1‑149 (MQ=255) | CCAGCGGTGAGTACCCACTTGCCTTTCAGGCTGCCGCCGTAGTGCTGGCGACCGGCTTCGACGAAGGTTTCATAGGTGCCCTGGACGATGCCCTGGCTGCCGATGTAGATCCAGCTGCCG‑GCGGTCATCTGGCCAT‑ACATCGCCAGGCCCTTGGCGTCCAGTTCGTTGAAGTGTTCCCAGTTGGCCCAGTGTGGCACCAGGTTGGAGTTGGCAATCAGCACGCGCGGTGCGTTGCTGTGGGTCTTGAACACACCGACCGGCTTGCCCGACTGCACCAGCAGGGTTTCGTC > NC_002947/5736925‑5737214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |