New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5816842 | 50 (0.780) | 9 (0.150) | 8/244 | NT | 21.2% | intergenic (+28/+101) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
? | NC_002947 | = 5816927 | 19 (0.310) | intergenic (+113/+16) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
TCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTC > NC_002947/5816694‑5816973 | tCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCC > 2:362803‑M1/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTcgc < 2:64203/149‑1 (MQ=255) gTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 1:251790/1‑149 (MQ=255) gTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCCGGCCCCCCCCCGcccc > 2:154017/1‑148 (MQ=255) tATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 2:314148/149‑1 (MQ=255) aTCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTccc < 7:74057/146‑1 (MQ=255) aTCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTccc > 8:74057/1‑146 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 1:362803/148‑1 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 7:355349/1‑149 (MQ=255) gACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 3:54162/148‑1 (MQ=255) acCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAgc < 2:98500/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAg < 6:376643/146‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAg > 5:376643/1‑146 (MQ=255) ttGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGcgcg > 7:75090/1‑149 (MQ=255) aGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTc < 2:94877/148‑1 (MQ=255) aGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCg < 1:254529/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGct > 7:366164/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGATTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCcttcgcgggcacgcccgctcccacaggtatgtgagctgcg < 8:326829‑M1/149‑41 (MQ=255) gCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCtctc > 5:247185/1‑149 (MQ=255) tGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCcttcgcgggcacgcccgctcccacaggtatgtgagctgagcgcgagagc > 1:396875‑M1/1‑100 (MQ=255) tGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTAGCCCGGCGCTCTcgcgcg > 6:342396/1‑147 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGTGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCGCCCCCACGTAGCCCGGCCCTCgcgcgcgccg > 8:189422/1‑146 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGc < 6:188048/108‑1 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGc > 5:188048/1‑108 (MQ=255) aaGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGc < 3:349093/104‑1 (MQ=255) aaGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGc > 4:349093/1‑104 (MQ=255) aCTAGGTGGGGGCAAAGCGGGTGCTGCCGAAATAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTTATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCcttcgcgggcacgcccgctcccacaggtatgttagctgcgcgcgagagcgacgcgctac < 2:396875‑M1/149‑60 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCtttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacct > 6:382994‑M1/1‑88 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAc > 3:287674/1‑147 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 8:355349/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCtttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgg < 3:93544‑M1/149‑66 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 4:287674/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTACCCCAGGTAGCCCGTCGCTCTCCCGCGCAGCTCCCAGACCAGTgg > 3:321668/1‑149 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACT‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGa < 2:273729/149‑1 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCtctc < 8:315895/124‑1 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg > 7:70381/1‑147 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 8:70381/147‑1 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAg > 6:130446/1‑149 (MQ=255) ggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCtttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagc < 5:382994‑M1/149‑70 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGc < 5:130446/148‑1 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAg < 8:385048/107‑1 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAg > 7:385048/1‑107 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCTGCAAAGGCCCtttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtggga < 4:28726‑M1/149‑68 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCTGCAAAGGCCCtttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtggga < 4:203662‑M1/149‑68 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgc < 6:247185/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgc < 5:15514/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGAAAGAGCAGCAGCGGAGTCTGGCCAAGCTTTAAGCTTATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCTTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg < 2:251790/149‑1 (MQ=255) tgcCTAACGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTTATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACGTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGa < 6:9790/149‑1 (MQ=38) gcCGAAAGAGCAGCAGCGGAGTCTGGCCAAGCGTTACGCTGATCGGCGCTCTCCGGTCCC‑‑‑‑‑‑GGCCCctttgcgggcgcgcccgctcccaccggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaa < 1:234702‑M1/149‑85 (MQ=255) agcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCtt < 8:386604/149‑1 (MQ=255) cagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcaca < 3:308554/111‑1 (MQ=255) cagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcaca > 4:308554/1‑111 (MQ=255) cTGAGTCTGGCCAAGCGTGAAGCTGATCGGCGCTATCCGGGACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCTGGCACGCCCGCGCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGta < 3:355144/149‑1 (MQ=38) gAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGtact < 5:342396/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCgg > 5:282271/1‑111 (MQ=255) gCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCgg < 6:282271/111‑1 (MQ=255) aGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTg < 7:189422/149‑1 (MQ=255) gCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 3:90602/149‑1 (MQ=255) tCGGCTCTATCCTGTACC‑‑‑‑‑‑CGCCCCTTCGCGGGCACGCACGCTCCCTCCGGTTGCTCGTGGCTCTCGCGCGCAGCCCTCATACCTGTCGGAGCGGGCTCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCt < 6:382162/149‑1 (MQ=255) gcTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTc < 8:75090/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGtac < 7:295296/106‑1 (MQ=255) gCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgcg < 6:331121/51‑1 (MQ=255) gCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgcg > 5:331121/1‑51 (MQ=255) | TCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACC‑‑‑‑‑‑GGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTC > NC_002947/5816694‑5816973 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |