New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCGGCAAAGACGATGTTCGGGCTCTTGCCACCGGCTTCCAGCCAGATGCGTTTCATGTTCGACTCGCCCGCGTAAACCATCAGTTGCTTG > NC_002947/6028422‑6028714 | tATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTgg > 7:322677/1‑149 (MQ=255) aCCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTg > 6:173227/1‑147 (MQ=255) aCCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGaa < 5:89295/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAg < 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cTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGgggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagg < 5:111513‑M2/149‑90 (MQ=255) ttCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGgggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttc > 6:224188‑M2/1‑59 (MQ=255) ttCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGgggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttc < 5:224188‑M2/120‑62 (MQ=255) ttCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCgg < 3:347815/68‑1 (MQ=255) ttCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCgg > 4:347815/1‑68 (MQ=255) tCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCGGCAAAGACGATGTTCGGGCTCTTGCCACCGGCTTCCAGCCAGATGCGTTTCATGTTCGACTCGCCCGCGTAAACCATCAGtt < 2:388357/148‑1 (MQ=255) cGCCCcggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagggct > 1:384121‑M1/1‑5 (MQ=255) cGCCCcggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtg < 1:267443‑M1/130‑126 (MQ=255) cGCCCcggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtg > 2:267443‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCcggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagggctg < 8:352450‑M1/149‑146 (MQ=255) gCCCcggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccaatggtggtagaggccctgaagggctg > 3:137600‑M1/1‑4 (MQ=255) ccccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagggctgg < 3:31101‑M1/149‑147 (MQ=255) cccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagggctgg > 8:356917‑M1/1‑2 (MQ=255) cccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtg < 1:164136‑M1/127‑126 (MQ=255) cccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcct < 3:196379‑M1/117‑116 (MQ=255) cccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcct > 4:196379‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCGGCAAAGACGATGTTCGGGCTCTTGCCACCGGCTTCCAGCCAGATGCGTTTCATGTTCGACTCGCCCGCGTAAACCATCAGTTGCTTg > 8:202389/1‑149 (MQ=255) ccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggccctgaagggctgg > 5:173227‑M1/1‑1 (MQ=255) ccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggcc < 7:373669‑M1/135‑135 (MQ=255) ccggacctgcaagcagccgccgaggccgcagccagcgccatcgccttcaaccagggcgaagtgtgcactgcaggctcccgcctgctggtcgagcgttcgatcaaggacaagttcctgccgatggtggtagaggcc > 8:373669‑M1/1‑1 (MQ=255) | TATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTTGCAGGTCCGGGGCGTCGGCAAAGACGATGTTCGGGCTCTTGCCACCGGCTTCCAGCCAGATGCGTTTCATGTTCGACTCGCCCGCGTAAACCATCAGTTGCTTG > NC_002947/6028422‑6028714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |