| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 117614 = | 69 (1.080) | 4 (0.070) | 4/238 | NT | 5.6% | coding (471/771 nt) | metQ | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 117641 = | 71 (1.180) | coding (444/771 nt) | metQ | methionine ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
GGTTCAGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACGCCCA > NC_002947/117493‑117783 | ggTTCAGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGTCGTCATCTACCTTGGTCAGCACACGCGGGATTGTTGCTGCTTCCAGCTCACTGAACTTCACGTTTTTCGTGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTc < 2:136164/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCtt < 3:280023/149‑1 (MQ=255) aGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCttg‑tt < 5:12918/149‑1 (MQ=255) aGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGGTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCttg‑tt < 3:257390/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCttg‑ttg > 5:98149/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTg < 8:45076/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCtt > 3:399446/1‑147 (MQ=255) cAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTc < 5:47564/133‑1 (MQ=255) cAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTc > 6:47564/1‑133 (MQ=255) aGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACATGGGTCAGCACAAGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCtt > 4:344323/1‑149 (MQ=255) gcgcGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCtt > 7:347616/1‑142 (MQ=255) gcgcGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCtt < 8:347616/142‑1 (MQ=255) gcgcGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCtt > 2:140614/1‑148 (MQ=255) 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cACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTg < 6:301494/139‑1 (MQ=255) cACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTc < 4:69883/148‑1 (MQ=255) aCGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCg < 3:344323/148‑1 (MQ=255) ggTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGaa > 4:144216/1‑148 (MQ=255) ggTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAAt < 3:144216/149‑1 (MQ=255) gTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATa < 1:262368/149‑1 (MQ=255) tCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATac < 6:12119/149‑1 (MQ=255) aCAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACg > 1:65453/1‑149 (MQ=255) aCAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACg > 5:82981/1‑149 (MQ=255) aggatgttCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACGcc > 7:67688‑M2/9‑149 (MQ=255) gatgttCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACGCCCa > 7:96508‑M2/7‑149 (MQ=255) | GGTTCAGCTTGGCTTCCAGCGCGTAGTTGGTGTTGATCAGGGCGGCATCTACCTGGGTCAGCACACGCGGGATGGTGGCGGCTTCCAGCTCACGGAACTTCACGTTTTTCGGGTTTTCGGCAACAT‑‑CCTTCACGGTCGACAGGATGTTCTTG‑TTGTCCTTGAGCTTGATCACGCCAGCCTTGTCCAGCAGCAGCAAGGCGCGGCCGCCGTTGGTGGCGTCGTTGGGGATGACCACGGTGGCGCCGGAGGACAGCTCGTCCAGTTTCTTGATCTTGGTCGAATACACGCCCA > NC_002947/117493‑117783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |