| New junction evidence | |||||||||||
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GGCAGAGATTTTCGCAGATATTGTCGCATCTGGTATTAAGCCGGTGGGTAAGCTCAGCGTTTCGCAAAAGGATGGGAAGCTCATCCTTGATGATAAAAATAGCTCGTTACGATTGGTGA‑TGAAGCGTAACGTTGATGAGCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAGCTGGAGAAGATG > NC_002947/748091‑748385 | ggCAGAGATTTTCGCAGATATTGTCGCATCTGGTATTAAGCCGGTGGGTAAGCTCAGCGTTTCGCAAAAGGATGGGAAGCTCATCCTTGATGATAAAAATAGCTCGTTACGATTGGTGA‑TGAAGCGTAACGTTGATGAGCGAAGTTTG > 3:197754‑M2/1‑148 (MQ=255) gCAGAGATTTTCGCAGATATTGTCGCATCTGGTATTAAGCCGGTGGGTAAGCTCAGCGTTTCGCAAAAGGATGGGAAGCTCATCCTTGATGATAAAAATAGCTCGTTACGATTGGTGA‑TGAAGCGTAACGTTGATGAGCGAAGTTTGt < 7:43197‑M2/148‑2 (MQ=255) cAGAGATTTTCGCAGATATTGTCGCATCTGGTATTAAGCCGGTGGGTAAGCTCAGCGTTTCGCAAAAGGATGGGAAGCTCATCCTTGATGATAAAAATAGCTCGTTACGATTGGTGA‑TGAAGCGTAACGTTGATGAGCGAAGTTTGtaa > 8:162155‑M2/1‑146 (MQ=255) 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gCGAAGTTTGtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatg < 7:87591‑M2/97‑88 (MQ=255) cGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCt > 3:13295/1‑141 (MQ=255) cGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCt < 4:13295/141‑1 (MQ=255) gAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAGCTg > 1:81755/1‑146 (MQ=255) tGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATg > 6:76289/1‑132 (MQ=255) tGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATg < 5:76289/132‑1 (MQ=255) gtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgtggactttcgaa > 4:372652‑M2/1‑1 (MQ=255) gtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccgacagcaaagtcgaaaaagtctacctctaccccaagcccgtggactttcga < 8:166633‑M2/148‑148 (MQ=255) ggACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAGCTGGAGAAGATg < 4:376163/148‑1 (MQ=255) | GGCAGAGATTTTCGCAGATATTGTCGCATCTGGTATTAAGCCGGTGGGTAAGCTCAGCGTTTCGCAAAAGGATGGGAAGCTCATCCTTGATGATAAAAATAGCTCGTTACGATTGGTGA‑TGAAGCGTAACGTTGATGAGCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTAT‑GATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAGCTGGAGAAGATG > NC_002947/748091‑748385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |