New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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AAATGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGCCG > NC_002947/1149375‑1149665 | aaaTGCGTTGTTGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGt > 7:53724/1‑149 (MQ=255) gagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccacctgcgtgcacgccgggtgcaggcacgcaTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTg > 5:86428‑M1/83‑148 (MQ=255) gagcacatcgagccgttcgtgtttcagaccgcgcgcaacctggcgctggaccacctgcgtgcacgccgggtgcaggcacgcaTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGc > 3:283166‑M1/83‑149 (MQ=255) gttgttGGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTg > 3:381331/1‑148 (MQ=255) gttgGCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑cc > 5:96898/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGt < 1:102507/136‑1 (MQ=255) gCGTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGt > 2:102507/1‑136 (MQ=255) gTTCGCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGt > 7:219492/1‑149 (MQ=255) gCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGCGATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCa > 1:318214/1‑149 (MQ=255) gCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCAc < 2:336019/149‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCAc > 7:77319/1‑149 (MQ=255) cTCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACg < 2:271139/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACg > 6:244848/1‑148 (MQ=255) aGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACg < 2:331011/146‑1 (MQ=255) aGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACg > 1:331011/1‑146 (MQ=255) aGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg < 8:219492/149‑1 (MQ=255) aGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg < 7:204954/149‑1 (MQ=255) aGTTGATTGAGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg < 6:96898/149‑1 (MQ=255) ttgattgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg > 3:88820/1‑147 (MQ=255) tgattgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAggt < 5:244848/148‑1 (MQ=255) ttgaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTc < 5:194849/149‑1 (MQ=255) gaGGCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGTACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTc < 6:299184/147‑1 (MQ=255) gCTGACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAgcg > 1:18655/1‑149 (MQ=255) gACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGc < 4:103431/133‑1 (MQ=255) gACGCTGAGGTGCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGc > 3:103431/1‑133 (MQ=255) gCTTGAGCAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTcc < 6:157416/131‑1 (MQ=255) cAACTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGa > 1:188259/1‑148 (MQ=255) aaCTGCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGaaa > 6:252566/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGTCCAGCATGCGTGCCTGCGAGAGCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGGGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAaca > 1:131706/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAacac > 4:357016/1‑148 (MQ=255) cTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTcc < 3:320682/118‑1 (MQ=255) cTCGGCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTcc > 4:320682/1‑118 (MQ=255) ggCGTGGGCGGC‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACg < 2:188259/149‑1 (MQ=255) ggcggc‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg > 5:273622/1‑102 (MQ=255) ggcggc‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAg < 6:273622/102‑1 (MQ=255) c‑ATCCTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGc < 8:53724/149‑1 (MQ=255) gcacgcatgctggtcgacgacgtgcccgacgaagtgctgcacagtgtcgccgcgccagccaccagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTc > 3:283166‑M2/68‑149 (MQ=255) cacgcatgctggtcgacgacgtgcccgacgaagtgctgcacagtgtcgccgcgccagccaccagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTc > 5:86428‑M2/67‑148 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgcgcg < 8:339643/116‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTgcgcg > 7:339643/1‑116 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGa < 5:252566/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGa > 5:41838/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGa > 3:353066/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGAt > 6:303351/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGAt > 5:272083/1‑149 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATgg > 8:221452/1‑149 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATg < 8:77319/148‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATg < 4:381331/148‑1 (MQ=255) gctgctGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATg < 4:285030/148‑1 (MQ=255) TGCTGGTGGCTGGCGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCACGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGc < 3:281239‑M1/149‑1 (MQ=255) tggcGCGGCGACACTGTGCAGCACTTCGTCGGGCTCGTCGTCGACCAGCATGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGAGCTCGATGGGCCGCTCGCCCa > 6:284207/1‑149 (MQ=255) 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ccagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCg > 2:78359‑M2/7‑149 (MQ=255) ccagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGCTCCAGGGCCAGGTTGCGCGCGGTCTACAACACGAACGGCTAGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCg > 7:267123‑M2/7‑149 (MQ=255) cagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGcagcag < 6:349765‑M2/136‑1 (MQ=255) cagcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGcagcag > 5:349765‑M2/6‑141 (MQ=255) agcaTGCGTGCCTGC‑A‑CCCGGCGTGCACGCAGGTGGTCCAGCGCCAGGTTGCGCGCGGTCTGAAACACGAACGGCTCGATGTGCTCGATGGGCCGCTCGCCCAGCGCGCGGGACACCCGCAGGTAGGTTTCCTGCAGCAGGTCTTCGGc < 6:272083‑M2/145‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |