New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2048794 = | 71 (1.110) | 6 (0.110) | 4/220 | NT | 9.9% | intergenic (+33/+106) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2048885 = | 48 (0.870) | intergenic (+124/+15) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGC > NC_002947/2048737‑2049028 | gcgGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAggg < 4:357734/149‑1 (MQ=255) gcgGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAggg < 2:326289/149‑1 (MQ=255) gcgGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGGTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAggg < 4:324322/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACAACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCCCAAGGGATCTGCAGc > 3:291797/1‑149 (MQ=255) ccGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCg > 4:11624/1‑149 (MQ=255) cGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgt > 6:318898/1‑149 (MQ=255) cGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGGGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgt < 4:37916/149‑1 (MQ=255) gATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGATGCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgt > 1:317879/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCACTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCCACCCCCGCGGTGCCTTCTTCGCCGGCTCGCCCGCGCCCACAACGGATATGCAGCgg > 1:53985/1‑146 (MQ=37) ggtgtGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcag < 8:175726/148‑1 (MQ=255) gtggGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagtc < 5:117690/149‑1 (MQ=255) gtggGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagtc < 3:11624/149‑1 (MQ=255) ggCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGAGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagt > 1:47769/1‑145 (MQ=255) gCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGa < 4:255462/148‑1 (MQ=255) gCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGAt < 2:47769/149‑1 (MQ=255) gCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCCGGCTCGCCCGCACCCACAAGGGAACTGCAGCGTCAGTCAGAt > 4:85/1‑149 (MQ=255) aaaCCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcgg < 2:1150/149‑1 (MQ=255) gACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAc > 2:32880/1‑149 (MQ=255) gTTTTCCCGGCGCTTGCGCATTCCTTGTGGGC‑GGGGGCGGGCCCGCTAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggc < 1:409446/137‑1 (MQ=37) ttttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCt < 4:235221/147‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAg > 5:86550/1‑149 (MQ=255) ggCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAggc < 4:348656/149‑2 (MQ=255) cgcTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTaa < 5:413038/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGc > 2:352727/1‑148 (MQ=255) tCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCga < 6:80637/142‑1 (MQ=255) tCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCga > 5:80637/1‑142 (MQ=255) CTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAACGCTCAACCACGTAAGCGATGATTgcca < 4:139175‑M1/149‑2 (MQ=255) TTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCCACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACACGGGCTCTGCAGCGGCCGTCCGATGGCGGCCCCCCGCTCAGCCAGGTAAGCGATGATTGCCtt < 1:159183‑M1/149‑1 (MQ=255) TTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCACCCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCCCAAGGGCTCTGGAGCGGCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGCTTGCCtt < 5:61045‑M1/149‑1 (MQ=255) TTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCga > 3:19313‑M1/1‑139 (MQ=255) TTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCga < 4:19313‑M1/139‑1 (MQ=255) GTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CAGGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTg > 7:328249‑M1/1‑148 (MQ=255) GTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCtt > 5:318898‑M1/1‑147 (MQ=255) GTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTg > 5:238058‑M1/1‑148 (MQ=255) GTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTg > 7:334235‑M1/1‑148 (MQ=255) TGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGa > 3:139175‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGAc < 2:293604‑M1/149‑1 (MQ=255) gggccgGGGCGGTCCCGCGAAACAGGGGCGCAGCCCGTGCAAACCACCGGGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGa > 1:409564‑M1/7‑149 (MQ=255) A‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCa > 3:85‑M1/1‑149 (MQ=255) A‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCa > 6:86550‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAg > 3:203293‑M1/1‑121 (MQ=255) GGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAg < 4:203293‑M1/121‑1 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACAt < 2:341831‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACAt < 8:379303‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATATGTAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGGGCATACAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGCATCATACa < 5:48184‑M1/148‑1 (MQ=255) gtgagcccgcgaagcaggcaccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACAt > 8:283475‑M2/78‑149 (MQ=255) CGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATc > 2:53985‑M1/1‑149 (MQ=255) cgagcccgcgaagcaggcaccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATc > 2:62854‑M2/77‑149 (MQ=255) ccGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCa < 3:330511/138‑1 (MQ=255) ccGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCa > 4:330511/1‑138 (MQ=255) ccGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGt > 7:49254/1‑149 (MQ=255) gcgAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGAt < 7:91432/90‑1 (MQ=255) gcgAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGAt > 8:91432/1‑90 (MQ=255) gcgaagcaggcaccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCa > 3:301524‑M2/70‑149 (MQ=255) acGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc > 8:204115/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGc > 3:160228/1‑149 (MQ=255) caccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGc < 7:283475‑M2/90‑1 (MQ=255) cAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTAAGATGGCGGCAAACCGCTCATACAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttc > 2:147448/1‑149 (MQ=255) gCCCGTGCCAACCACCGGGGTGCGTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTATGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttctt < 4:291797/149‑1 (MQ=255) cccGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttctt > 7:237792/1‑148 (MQ=255) cccGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttctt < 8:237792/148‑1 (MQ=255) ccGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCttcttc > 7:192572/1‑148 (MQ=255) cGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCaa < 7:379303/149‑1 (MQ=255) gTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAAt < 8:49254/149‑1 (MQ=255) gTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAAt < 2:317879/149‑1 (MQ=255) ccAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATgc < 2:169833/148‑1 (MQ=255) accaccGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAg > 7:391031/1‑149 (MQ=255) accaccGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAg > 7:199312/1‑149 (MQ=255) accaccGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAg < 4:280584/149‑1 (MQ=255) accaccGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAg < 1:352727/149‑1 (MQ=255) caccGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGc < 6:61045/149‑1 (MQ=255) ggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCAt < 4:301524‑M2/109‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCa < 8:391031/149‑1 (MQ=255) tGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACt > 4:237442/1‑149 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACttt > 2:267161/1‑148 (MQ=255) tgcttcgcgggcacccccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCCGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTCGACTCATACATCCAGGTCACATTGCAGGAGACATCAAAGCACAGGCAAGGCACTTTCa > 6:246996‑M2/31‑149 (MQ=255) gcgGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGgc < 1:293604/149‑1 (MQ=255) gcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCt > 1:10871‑M2/17‑149 (MQ=255) ccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTc > 5:119717‑M2/15‑149 (MQ=255) gctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCt < 1:62854‑M2/137‑1 (MQ=255) tcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGTCTTCTTCAAAGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTg > 2:337967‑M2/11‑148 (MQ=255) tcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTg > 4:114867‑M2/11‑148 (MQ=255) ccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCa < 2:10871‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAg < 3:237442‑M2/141‑1 (MQ=255) acaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCAGGCTTCTTCAATGCGAAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTACTCCAggg > 8:73045‑M2/7‑149 (MQ=255) caaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGc > 5:307966‑M2/6‑149 (MQ=255) | GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAA‑CACGGGCGCAGCCCGTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGC > NC_002947/2048737‑2049028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |