New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2505327 = | 43 (0.670) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 7.5% | coding (1114/1146 nt) | yliI | aldose sugar dehydrogenase |
? | NC_002947 | 2505368 = | 33 (0.550) | intergenic (+9/‑33) | yliI/PP_2199 | aldose sugar dehydrogenase/hypothetical protein |
ACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTT > NC_002947/2505220‑2505514 | gcctgggcagggtcagcaacgtagccccgagtgctcagggcgtgctggtagcgggtttggggggcgagggccatgccgcattctcaccgactgtcaccctcggtgcaGGCGCGCTACTCAAGGGCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCt > 7:269160‑M1/108‑149 (MQ=255) gCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAggg < 6:134003/149‑1 (MQ=255) cACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAggg < 3:271707/148‑1 (MQ=255) cACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGGGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAggg < 1:218916/149‑1 (MQ=255) aCGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCATCGAGGGt > 4:184618/1‑148 (MQ=255) gAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGa > 8:292649/1‑148 (MQ=255) aaGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACa < 5:212739/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCgg < 3:117489/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGt < 8:86710/138‑1 (MQ=255) gTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGt > 7:86710/1‑138 (MQ=255) gTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCg < 7:292649/149‑1 (MQ=255) gTATCCGTGATGTGCGGCTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGAcc < 6:44504/149‑1 (MQ=255) gTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCaaa > 6:33884/1‑149 (MQ=255) tGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAAc < 4:153754/149‑1 (MQ=255) tGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAAc < 6:359501/149‑1 (MQ=255) tGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAAc > 5:359501/1‑149 (MQ=255) gggCCAGATGGTTACCTTTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCaa < 8:122755/149‑1 (MQ=255) gggCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCa < 1:167568/148‑1 (MQ=255) cTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCATCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCgg < 3:184618/149‑1 (MQ=255) cTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGATGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCgg > 6:118626/1‑149 (MQ=255) gtatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCgggg > 7:121117/1‑149 (MQ=255) tGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTg > 5:244039/1‑149 (MQ=255) ccGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTg < 5:33884/149‑1 (MQ=255) cGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa > 5:51765/1‑149 (MQ=255) cGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa < 8:121117/149‑1 (MQ=255) cGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa > 7:130171/1‑149 (MQ=255) cGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGa > 5:45772/1‑149 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGa < 2:354283/61‑1 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGa > 5:100417/1‑118 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGa < 6:100417/118‑1 (MQ=255) gATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAg > 3:303858/1‑149 (MQ=255) aggcgcgcgtcagtcggccaggccgcccttgagtagcgcgccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGTGAGAATGCGGCATGGCCCTCGCCCCCCAAACCCGCTACCAGCACGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGc > 7:269160‑M2/43‑149 (MQ=255) gcgcgcgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGccc > 7:101483‑M2/41‑149 (MQ=255) cgcgcgtcagtcggccaggccgaccttgagtagcgcgccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCcg > 8:7300‑M2/40‑149 (MQ=255) cAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCgtcgtc > 6:3894/1‑147 (MQ=255) gTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGTTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGcc < 5:118626/149‑1 (MQ=255) gTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGcc < 4:303858/149‑1 (MQ=255) cTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAg < 2:354223/117‑1 (MQ=255) cTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAg > 1:354223/1‑117 (MQ=255) tGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCACTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc > 6:280649/1‑149 (MQ=255) aCGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc < 8:130171/147‑1 (MQ=255) cgccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTccc < 7:7300‑M2/145‑1 (MQ=255) cgccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTccc < 5:3894‑M2/145‑1 (MQ=255) ccTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCtt > 4:16110‑M2/3‑149 (MQ=255) | ACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCT‑GGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTT > NC_002947/2505220‑2505514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |