| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2581886 = | 65 (1.020) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 5.7% | coding (238/801 nt) | PP_2263 | sugar ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 2581943 = | 71 (1.160) | coding (295/801 nt) | PP_2263 | sugar ABC transporter permease | |||||
CTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTGGCGGT > NC_002947/2581795‑2582088 | cTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCAcc < 6:163193/149‑1 (MQ=255) gaacagcccgatcgacgagtacaactggaagaacggcagcaggaacaccgccggtggcgccatgcggttggtcagcagccagaagaacagGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCt > 6:231356‑M1/91‑149 (MQ=255) aacagcccgatcgacgagtacaactggaagaacggcagcaggaacaccgccggtggcgccatgcggttggtcagcagccagaagaacagGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTg > 3:36670‑M1/90‑149 (MQ=255) aCCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTg > 8:127399/1‑149 (MQ=255) ccGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGt > 6:112688/1‑149 (MQ=255) aTCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTtcttct < 4:26987/148‑1 (MQ=255) tCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTgg > 2:170743/1‑149 (MQ=255) ttCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgct > 6:273336/1‑149 (MQ=255) ttCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgct > 8:29423/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGACCACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTgg < 6:375053/145‑1 (MQ=255) cACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgctg‑c > 2:142588/1‑149 (MQ=255) cACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgc < 7:39290/146‑1 (MQ=255) aCCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgctg‑ct > 2:171576/1‑149 (MQ=255) ccGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGAGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgctg‑ct > 6:97444/1‑148 (MQ=255) cctcTGGTACAGCGGCTAAATCCACTCGCTGTAATATGTGTGCCTGCACCAGCTGATTTCCCTGCTCGTGGCGGTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTATCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAAcc < 2:154620/146‑1 (MQ=255) cAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAAcc < 2:148490/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAAcc > 5:15610/1‑149 (MQ=255) cTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCa < 4:290769/149‑1 (MQ=255) 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aCTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTc < 2:220757/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTtcttct < 8:54151/110‑1 (MQ=255) cTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTtcttct > 7:54151/1‑110 (MQ=255) gCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCctgc > 3:122790/1‑149 (MQ=255) gCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCctgc > 1:11957/1‑149 (MQ=255) tACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGcc < 4:171813/149‑1 (MQ=255) cTATGTGTGCCTGAACCCGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGt > 5:57450/1‑149 (MQ=255) cTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGt > 7:390135/1‑149 (MQ=255) cTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCCGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTATCTCGCCGACCGCCACCTGAACTTCTGGCTG‑CTCACCAACCCCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCAGt > 5:63604/1‑149 (MQ=255) tATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGtt > 5:369052/1‑149 (MQ=255) tgtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttc < 4:175913/148‑1 (MQ=255) tgtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGtt < 2:11957/147‑1 (MQ=255) tgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttcttc < 6:260491/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttcttc < 5:127817/149‑1 (MQ=255) gtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttcttc > 5:296198/1‑148 (MQ=255) gtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttcttc > 8:183726/1‑148 (MQ=255) 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< 2:52619/142‑1 (MQ=255) gcTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGc > 1:52619/1‑142 (MQ=255) ccGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGc > 2:411543/1‑145 (MQ=255) ccGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGc < 1:411543/145‑1 (MQ=255) ccGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCt < 3:227177/147‑1 (MQ=255) ccGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTg < 1:142588/148‑1 (MQ=255) cGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCg < 6:285078/127‑1 (MQ=255) cGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCg > 5:285078/1‑127 (MQ=255) gCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGtt > 2:61930/1‑148 (MQ=255) ggCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCGAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTa < 8:141878/147‑1 (MQ=255) aCCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTg < 8:390135/149‑1 (MQ=255) cgccacCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTGGc > 5:363013‑M2/7‑149 (MQ=255) ccacCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTGGCgg > 4:42547‑M2/5‑149 (MQ=255) cacCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTGGCGgt < 6:223216‑M2/146‑1 (MQ=255) cCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGt < 3:138647‑M2/127‑1 (MQ=255) cCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGt > 4:138647‑M2/2‑128 (MQ=255) | CTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTG‑CTGACCAACCGCATGGCGCCACCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGATACCCACATTGCCGTGGCGCTGGCCCATTGCCTGTTCAACGTACCGCTGGCGGT > NC_002947/2581795‑2582088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |