New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5051331 = | 74 (1.160) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 5.6% | intergenic (‑271/+103) | PP_5687/PP_4452 | MFS transporter/NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 5051401 = | 64 (1.050) | intergenic (‑341/+33) | PP_5687/PP_4452 | MFS transporter/NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein |
AATTCTGGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGGCAGCAGTAGGGCCGACATTG > NC_002947/5051253‑5051549 | tccgagtctatggaagggctactggcgcgtgtagctgcagcgtaagctgatacctgatgtaatgcagggcgatagtctGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCa > 7:55931‑M1/79‑149 (MQ=255) ttCTTGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATTCACGTGATCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGa < 2:327655/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAg > 4:168985/1‑148 (MQ=255) cgagtctatggaagggctactggcgcgtgtagctgcagcgtaagctgatacctgatgtaatgcagggcgatagtctGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGa > 5:236889‑M1/77‑149 (MQ=255) tGGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACt > 2:168021/1‑148 (MQ=255) tGGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTa > 7:5354/1‑149 (MQ=255) gCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATc < 3:168985/149‑1 (MQ=255) ttATCCACCCATGTAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTTATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAGTTATCTGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGcc < 6:341648/149‑1 (MQ=255) ttATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGcc > 1:277171/1‑149 (MQ=255) ttATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGcc < 2:277171/149‑1 (MQ=255) tCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCt < 1:168021/148‑1 (MQ=255) aCCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCAt > 6:232085/1‑149 (MQ=255) ccATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTa > 5:15127/1‑149 (MQ=255) cATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACAGCAGATCCGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCAATTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCCATA‑CCCGCTAAGACTATCGCACTGCATTaa > 5:298007/1‑148 (MQ=255) aTGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACa < 4:71000/149‑1 (MQ=255) gAATAAAATAAAAATATTCACGTTCTCTATAAGCTAATCTGATGGCTCCACCGCCGAGCGGAGGTAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCa < 6:298007/149‑1 (MQ=255) gAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCa < 8:128636/149‑1 (MQ=255) aataaaataaAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATTGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCa < 3:224131/148‑1 (MQ=255) aataaaataaAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAg < 8:5354/149‑1 (MQ=255) ataaaataaaAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGGCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAg < 2:89450/148‑1 (MQ=255) aataaaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCa > 8:390789/1‑120 (MQ=255) aataaaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCa < 7:390789/120‑1 (MQ=255) aataaaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTAt > 2:267927/1‑148 (MQ=255) taaaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTa > 5:1693/1‑136 (MQ=255) taaaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTa < 6:1693/136‑1 (MQ=255) aaaataTGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCt < 5:6512/149‑1 (MQ=255) gCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTg > 3:286988/1‑149 (MQ=255) aCGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTg > 4:286235/1‑147 (MQ=255) ctctATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTac < 3:286235/149‑1 (MQ=255) tctATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTaca > 4:156103/1‑149 (MQ=255) taAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACAcgc < 1:325875/148‑1 (MQ=255) gCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTAt > 4:228610/1‑122 (MQ=255) gCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTAt < 3:228610/122‑1 (MQ=255) tGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACCCGCGCCAGTAGccc > 8:259500/1‑149 (MQ=255) aTGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAg > 6:152138/1‑116 (MQ=255) aTGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAg < 5:152138/116‑1 (MQ=255) aTGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGccc < 5:232085/147‑1 (MQ=255) tCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCa > 5:420309/1‑147 (MQ=255) tCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATa < 4:286988/149‑1 (MQ=255) ccACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCa > 3:294359/1‑146 (MQ=255) cACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGa > 1:119829/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAgg < 3:308222/102‑1 (MQ=255) aCCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAgg > 4:308222/1‑102 (MQ=255) aCCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGa > 2:197089/1‑148 (MQ=255) cgccgAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTc < 1:267927/149‑1 (MQ=255) tctgagcggggagtggctgatgtccatggcagatatttatgacatggaatcgccactgatatttcctccgctcAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCg > 5:236889‑M2/74‑149 (MQ=255) tgagcggggagtggctgatgtccatggcagatatttatgacatggaatcgccactgatatttcctccgctcAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGa > 7:55931‑M2/72‑149 (MQ=255) GAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAg < 7:290068‑M1/149‑1 (MQ=255) tatCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGt < 2:119829/149‑1 (MQ=255) aGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTccc < 6:420309/148‑1 (MQ=255) gTGGCGATTCCATGTCATAAATATCAGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCGTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCt > 8:272984/1‑148 (MQ=255) atgtccatggcagatatttatgacatggaatcgccactgatatttcctccgctcAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTccc < 6:236889‑M2/94‑1 (MQ=255) gCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCTAc < 4:294359/149‑1 (MQ=255) gtCCATGGCAGATATTTATGACATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAAc > 3:125989/2‑145 (MQ=255) tCCATGGCAGATATTTATGACATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGAt < 4:125989/149‑1 (MQ=255) ccATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGAt < 7:259500/148‑1 (MQ=255) cATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTCTCCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAAc > 1:273531/1‑143 (MQ=255) cATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAAc > 4:72492/1‑142 (MQ=255) cATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAAc < 3:72492/142‑1 (MQ=255) tGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGtt > 6:114941/1‑149 (MQ=255) tAAATATCTGCCATGGACATCAGGCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGt > 7:362702/1‑149 (MQ=255) aaaTATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGt > 6:140123/1‑148 (MQ=255) aaaTATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGAATATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCAGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGATCAGTCCCTCAACCAGAACGTTTTcct > 6:123215/1‑146 (MQ=255) atgacatggaatcgccactgatatttcctccgctcAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGt < 8:55931‑M2/113‑1 (MQ=255) aaTATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTa < 6:15127/149‑1 (MQ=255) ccATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCCGATCGTTTTCGTTAGAGAGAcc > 6:324288/1‑149 (MQ=255) ccATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGtt < 2:102353/140‑1 (MQ=255) ccATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGtt > 1:102353/1‑140 (MQ=255) tGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGtt < 7:153542/131‑1 (MQ=255) tGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGtt > 8:153542/1‑131 (MQ=255) gcgatctaGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTc < 1:376967/141‑1 (MQ=255) gACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTg < 2:273531/149‑1 (MQ=255) aCATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTgg > 4:56866/1‑149 (MQ=255) cAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGgca > 7:128591/1‑147 (MQ=255) cAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGgca < 8:128591/147‑1 (MQ=255) gCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTc > 2:376967/1‑140 (MQ=255) ctcAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGGCAGCAGTAGGGCCGACa < 8:362702‑M2/146‑1 (MQ=255) aGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGGCAGCAGTAGGGCCGACATTg > 4:82308/1‑149 (MQ=255) | AATTCTGGCATTATCCACCCATGGAATAAAATAAAAATATGCACGTGCTCTATAAGCTAATCTGATGGATCCACCGCCGAGCGGAGGAAATATCAGTGGCGATTCCATGTCATAAATATCTGCCATGGACATCAGCCACTC‑CCCGCTCAGACTATCGCCCTGCATTACATCAGGTATCAGCTTACGCTGCAGCTACACGCGCCAGTAGCCCTTCCATAGACTCGGACTCAAGGTTCAGTCCCTCAACCAGATCGTTTTCGTTAGAGAAACCGTCTGGCAGCAGTAGGGCCGACATTG > NC_002947/5051253‑5051549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |