New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5221051 = | 74 (1.160) | 4 (0.060) | 3/250 | NT | 5.4% | coding (177/888 nt) | PP_4601 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5221098 = | 66 (1.050) | coding (224/888 nt) | PP_4601 | LysR family transcriptional regulator |
CACCCAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTTCAGCTCAGC > NC_002947/5220955‑5221246 | cACCCAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACg > 3:77398/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCTGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACgg > 7:210161/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACAGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACgg > 2:346244/1‑149 (MQ=255) cccAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGc > 1:254623/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGcc < 6:409012/149‑1 (MQ=255) gCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGc < 5:126823/149‑1 (MQ=255) ccGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCa < 3:275839/149‑1 (MQ=255) gACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCTGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAgg < 8:210161/149‑1 (MQ=255) gCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGcc > 8:89030/1‑148 (MQ=255) cTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGa < 8:236517/149‑1 (MQ=255) cATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGcc > 4:153017/1‑134 (MQ=255) cATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGcc < 3:153017/134‑1 (MQ=255) cggcaccgtgcccaggcgcaggctgccgaccacctggccacggcaactggcagcctcggcctgcaggccgtcatGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCa > 6:274362‑M1/75‑122 (MQ=255) cggcaccgtgcccaggcgcaggctgccgaccacctggccacggcaactggcagcctcggcctgcaggccgtcatGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCa < 5:274362‑M1/48‑1 (MQ=255) cTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTg > 1:388594/1‑149 (MQ=255) aCCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGc < 1:267284/149‑1 (MQ=255) ccTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGtt < 3:79202/140‑1 (MQ=255) ccTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGtt > 4:79202/1‑140 (MQ=255) tGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAg > 1:363874/1‑149 (MQ=255) gAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAg < 3:202278/147‑1 (MQ=255) gACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAggtggt < 3:277019/149‑1 (MQ=255) gAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCgg < 2:254623/149‑1 (MQ=255) cTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAg > 3:99145/1‑149 (MQ=255) gACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGACGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCt > 3:50616/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTg < 5:50836/128‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTg > 6:50836/1‑128 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTgc > 3:43781/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTggg < 3:355551/149‑1 (MQ=255) gTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCa < 4:77398/148‑1 (MQ=255) gTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCAc > 6:258226/1‑149 (MQ=255) gTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCAc > 7:158050/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACg > 2:275057/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACg < 4:43781/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGt > 8:265727/1‑149 (MQ=255) gCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTCCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGc > 7:304576/1‑149 (MQ=255) cAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGc < 8:158050/149‑1 (MQ=255) cgcTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAg < 8:301095/149‑1 (MQ=255) cgcTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAg > 7:301095/1‑149 (MQ=255) gcTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGt > 3:11443/1‑149 (MQ=255) gcTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGt < 8:166547/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGttt > 7:295019/1‑148 (MQ=255) cGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTc > 8:211025/1‑148 (MQ=255) gAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCaa < 8:295019/149‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCaa < 2:388594/149‑1 (MQ=255) aaGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAAc > 4:3806/1‑149 (MQ=255) ggTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAAccc > 1:298780/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCAc > 7:219240/1‑149 (MQ=255) cGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCAcc > 7:12356/1‑149 (MQ=255) tgggcggcgagcagggtacgggcccaggccaggatgcgctcgccggccATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCg < 5:274362‑M2/74‑1 (MQ=255) tgggcggcgagcagggtacgggcccaggccaggatgcgctcgccggccATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCg > 6:274362‑M2/49‑122 (MQ=255) ggcggcgagcagggtacgggcccaggccaggatgcgctcgccggccATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCAGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACctgct > 4:313141‑M2/47‑149 (MQ=255) ggcggcgagcagggaacgggcccaggccaggatgagctagacggccATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCACGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCAAGTTTCAACCACATGCACctgct > 1:23788‑M2/47‑149 (MQ=255) GCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACctgct < 4:408166‑M1/149‑1 (MQ=255) cGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCtgctgctgc < 3:371073/149‑1 (MQ=255) aGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGccc < 1:275057/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGcccc > 6:195740/1‑149 (MQ=255) gcgcATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGcccc > 1:6982/1‑149 (MQ=255) tggcctggGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGa > 7:90777/1‑148 (MQ=255) gcctggGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGaa < 4:50616/147‑1 (MQ=255) gggCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATAc > 1:272935/1‑149 (MQ=255) tACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGaaaa > 8:254133/1‑138 (MQ=255) tACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGaaaa < 7:254133/138‑1 (MQ=255) cccTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTgcgc > 5:118903/1‑131 (MQ=255) cccTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTgcgc < 6:118903/131‑1 (MQ=255) cccTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTg > 5:78641/1‑149 (MQ=255) cccTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCATGCGCGAAAAATACACCGAACTg > 7:284593/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGc < 2:6982/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATAccc < 1:377032/140‑1 (MQ=255) cTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATAccc > 2:377032/1‑140 (MQ=255) tGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGaa > 7:389937/1‑143 (MQ=255) tGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGaa < 8:389937/143‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCAc > 6:274868/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCAc < 2:298780/147‑1 (MQ=255) gccgccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATAccc > 4:319883/1‑134 (MQ=255) gccgccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATAccc < 3:319883/134‑1 (MQ=255) gccgccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtca < 5:195740/149‑1 (MQ=255) gccgcaCATGCCGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGGCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtca < 8:367130/149‑1 (MQ=255) ccgccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcag < 7:89030/149‑1 (MQ=255) ccgccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcag < 8:90777/149‑1 (MQ=255) gccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcagct < 4:99145/149‑1 (MQ=255) gccCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcagct < 5:258226/149‑1 (MQ=255) cccATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcagctc < 4:174115/149‑1 (MQ=255) aTGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTtcagctcagc < 5:274868/149‑1 (MQ=255) | CACCCAGCCGACGCTGTCCATGCGCCTGCGCAACCTGGAAGACGAACTGGACCTGGTGCTGGTCAAGCGGGGCCAGCGCTTCGAAGGTTTCACCGAGGCCGGCGAGCGCATCCTGGCCTGGGCCCGTACCCTGCTCGCCGCCCATGACGGCCTGCAGGCCGAGGCTGCCAGTTGCCGTGGCCAGGTGGTCGGCAGCCTGCGCCTGGGCACGGTGCCGCTGGCCAGTTTCAACCCCATGCACCTGCTGCTGCCCCTGCGCGAAAAATACCCCGAACTGCACTTTCAGCTCAGC > NC_002947/5220955‑5221246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |