New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5303678 | 56 (0.880) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.4% | coding (95/3675 nt) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
? | NC_002947 | = 5303702 | 52 (0.870) | coding (71/3675 nt) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
CGCTCGCGCAGCTCTTTGGTGGCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGATACAAGGTTTCGCACCAGCCTT > NC_002947/5303555‑5303848 | cGCTCGCGCAGCTCTTTGGTGGCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTAc < 1:119956/148‑1 (MQ=255) cGCTCGCGCAGCTCTTTGGTGGCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTAc < 6:376708/148‑1 (MQ=255) gcAGCTCTTTGGTGGCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACcggcgctg > 2:233667‑M2/1‑141 (MQ=255) ggtggCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGAt > 6:417271/1‑147 (MQ=255) gtggCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAg > 4:366687/1‑149 (MQ=255) gcgTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGc > 1:396733/1‑148 (MQ=255) gTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTAc < 8:377622/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTAc < 6:261874/149‑1 (MQ=255) gTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTg > 2:66250/1‑149 (MQ=255) aGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAgg < 7:99080/149‑1 (MQ=255) ggTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTACAggg < 3:245163/149‑1 (MQ=255) gTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATc > 8:577/1‑129 (MQ=255) gTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATc < 7:577/129‑1 (MQ=255) tCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAggggg < 5:417271/149‑1 (MQ=255) gAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACt > 1:14857/1‑147 (MQ=255) ggATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGt < 7:185275/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGcc < 2:254810/145‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCaga < 1:66250/148‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCaga < 8:30469/148‑1 (MQ=255) gcagcaGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCGGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACgg > 5:288103/1‑149 (MQ=255) agcagcTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTc < 3:366687/149‑1 (MQ=255) gcagcTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTcc < 2:396733/149‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCa < 6:219860/134‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCa > 5:219860/1‑134 (MQ=255) tCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGt > 4:59386/1‑149 (MQ=255) cgcgTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGt > 4:145080/1‑148 (MQ=255) cgTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCAt < 2:14857/149‑1 (MQ=255) gTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAggggg < 8:208298/116‑1 (MQ=255) gTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAggggg > 7:208298/1‑116 (MQ=255) cTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTtctc < 3:59386/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGAGAATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTtctc > 1:291615/1‑149 (MQ=255) ttCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCgg < 2:291615/149‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCgg < 2:20248/148‑1 (MQ=255) ccACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGACGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCAGTACCCGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTg > 8:92898/1‑149 (MQ=255) ggATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGc > 1:206627/1‑148 (MQ=255) gATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGcc > 7:157022/1‑148 (MQ=255) cAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCt < 5:240887/142‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCt > 6:240887/1‑142 (MQ=255) gcAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCgg < 2:206627/149‑1 (MQ=255) tACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACcggcgctgtacctgcgcctgatcctcggtcacggtggcgaacagggcttcgaacgcgagctgctgccaccgcagatcctcgtggtgaccttcaccgacgccgccaccaaagagct < 1:139592‑M2/149‑116 (MQ=255) cAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACcggcgctgtacctgcgcctgatcctcggtcacggtggcgaacagggcttcgaacgcgagctgctgccaccgcagatcctcgtggtgaccttcaccgacgcc > 6:229553‑M2/1‑32 (MQ=255) cAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACcggcgctgtacctgcgcctgatcctcggtcacggtggcgaacagggcttcgaacgcgagctgctgccaccgcagatcctcgtggtgaccttcaccgacgcc < 5:229553‑M2/133‑102 (MQ=255) aGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCACCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCTGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGACTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGGGGTAaacaac > 4:303771/1‑149 (MQ=255) gcgcCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACg < 8:157022/149‑1 (MQ=255) gcGA‑AATTTTGAAGCTCTTGCCCGTACCTGCGCTGGCCTCGTTGAGCTGGCTACCGTGCCGGGTGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTTCCCTAGGTCTGCCAAGGGTCGTTAAACAACGGGc < 2:367923/148‑1 (MQ=255) gA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCg > 8:355380/1‑134 (MQ=255) gA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCg < 7:355380/134‑1 (MQ=255) gA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGa < 1:189476/149‑1 (MQ=255) gA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGa > 1:390074/1‑149 (MQ=255) gTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGATACaa < 3:145080/148‑1 (MQ=255) tGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCACTGCCAGAGGAAGTTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGATGCCCAAGGTCTGCCAAGGGCCGGTAAACAACGGGCGAGACAAgg > 5:416549/1‑149 (MQ=255) gAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGt < 8:103167/113‑1 (MQ=255) gAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCGGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGt > 7:103167/1‑113 (MQ=255) gTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCgg > 8:10589/1‑97 (MQ=255) gTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCgg < 7:10589/97‑1 (MQ=255) gCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGATACAAGGTTTCGCACCa > 4:215120/1‑149 (MQ=255) cccGTACCGGCGCTTGCCGCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAATCTCAGTGCCAGAGGATGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGATACAAGGTTTCGCACCa < 6:416549/148‑1 (MQ=255) ccGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGTGATACAAGGTTTCGCACCAGc > 7:265605/1‑149 (MQ=255) tACcggcgctgtacctgcgcctgatcctcggtcacggtggcgaacagggcttcgaacgcgagctgctgccaccgcagatcctcgtggtgaccttcaccgacgccgccaccaaagagctgcgcgagcgtatccgcgcccgcctggctgaa > 2:139592‑M2/1‑3 (MQ=255) | CGCTCGCGCAGCTCTTTGGTGGCGGCGTCGGTGAAGGTCACCACGAGGATCTGCGGTGGCAGCAGCTCGCGTTCGAAGCCCTGTTCGCCACCGTGACCGAGGATCAGGCGCAGGTACAGCGCCGA‑AATGGTGAAGGTCTTGCCCGTACCGGCGCTGGCCTCGATCAGCTGGCTACCGTGCAGGGGGAAACTCAGTGCCAGAGGACGGTCCTGGGTCATGCGCCTTTCTCCGGGTTGCCCAAGGTCTGCCAAGGGGCGGTAAACAACGGGCGATACAAGGTTTCGCACCAGCCTT > NC_002947/5303555‑5303848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |