New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5860423 = | 58 (0.910) | 4 (0.070) | 4/240 | NT | 6.8% | coding (1306/1725 nt) | PP_5136 | ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 5860462 = | 54 (0.890) | coding (1267/1725 nt) | PP_5136 | ABC transporter permease |
GCTTTCAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGAAGATCACGA > NC_002947/5860314‑5860608 | gcTTTCAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGcc < 7:243977/149‑1 (MQ=255) tttCAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGt > 2:379943/1‑149 (MQ=255) tCAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGtt > 7:357853/1‑148 (MQ=255) ccaacgcctgctcaaccatgcgctgcgcctgctcagcttcatccccatggccgtgccgggcctggtactgggcctgggctacgtattcttcttcaacctgaacgGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCa > 7:221036‑M1/105‑149 (MQ=255) cAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGCAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTc < 6:214231/148‑1 (MQ=255) aGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAg < 6:212108/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTg > 1:262247/1‑146 (MQ=255) gcggcgGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTgaagaa < 7:112925/149‑1 (MQ=255) gcggcgGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTgaagaa < 8:357853/149‑1 (MQ=255) cTCGAAGTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGt < 8:196319/149‑1 (MQ=255) tCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCCGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGGAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACg > 6:204922/1‑147 (MQ=255) tCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACg > 1:347503/1‑147 (MQ=255) gAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACCTGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgc > 2:360889/1‑149 (MQ=255) gAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgc > 2:354915/1‑149 (MQ=255) gAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgc > 8:212502/1‑149 (MQ=255) aaCTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACg < 7:30631/144‑1 (MQ=255) aaCTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACg > 8:30631/1‑144 (MQ=255) cTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgcc > 8:213180/1‑147 (MQ=255) tCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACCTGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGACTACGTAgccccg > 8:393475/1‑147 (MQ=255) gCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgcccaggc > 6:14979/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAgcccaggc > 3:61003/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTAcc < 3:391979/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTTGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGc < 3:37738/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAg < 1:173740/147‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGc > 8:46047/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGcc > 3:369744/1‑149 (MQ=255) gcAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCGGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGccc > 5:355748/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCgg < 1:272157/149‑1 (MQ=255) gggCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCgg > 8:10675/1‑148 (MQ=255) ggtggtCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACgg < 7:10675/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTAcc < 7:344116/130‑1 (MQ=255) cgcgGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTAcc > 8:344116/1‑130 (MQ=255) cgcgGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATgg > 5:164157/1‑149 (MQ=255) ggTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACg < 8:391166/139‑1 (MQ=255) ggTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGCGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACg > 7:391166/1‑139 (MQ=255) tGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCt > 3:371349/1‑149 (MQ=255) cgcgGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCt < 1:294022/147‑1 (MQ=255) ggtggtCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCa < 1:379943/149‑1 (MQ=255) gtggtCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAg > 7:338489/1‑149 (MQ=255) tGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATg > 5:401248/1‑149 (MQ=255) gggCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGc < 7:356563/134‑1 (MQ=255) gggCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGc > 8:356563/1‑134 (MQ=255) ggCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATgg < 5:373722/148‑1 (MQ=255) gCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAg > 3:31911/1‑126 (MQ=255) gCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAg < 4:31911/126‑1 (MQ=255) gCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCCGGCCCGGCGCGGCGAGGGGGATGCAGCGGAGCGGGCGGCGCGCGTGGTTGAGCGGGc > 2:300624/1‑149 (MQ=255) caccacCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCACAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGtt > 2:337337/1‑149 (MQ=255) accaccAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCACAGTACCAGGCCCGGCACCGCAATGGGGATGAACCTGAGCAGGCGCAGCCCATCGTTGAGCAGGCGTTg > 8:326244/1‑149 (MQ=255) tgaacggcaacccgctgcatgtgctgtacggcggcatggggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTgg > 7:221036‑M2/46‑149 (MQ=255) caccaGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGc > 3:227803/1‑149 (MQ=255) caGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCt > 3:278238/1‑149 (MQ=255) aGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTg < 4:61003/149‑1 (MQ=255) GCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTgg > 7:213180‑M1/1‑149 (MQ=255) cccgctgcatgtgctgtacggcggcatggggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGa < 4:36887‑M2/72‑1 (MQ=255) cccgctgcatgtgctgtacggcggcatggggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGa > 3:36887‑M2/36‑107 (MQ=255) cgctgcatgtgctgtacggcggcatggggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGtcttc < 8:221036‑M2/116‑1 (MQ=255) cgccgTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCAt > 2:390555/1‑148 (MQ=255) cgccgTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATc < 4:278238/149‑1 (MQ=255) ccgTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAg < 8:338489/149‑1 (MQ=255) tACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTa < 5:204922/149‑1 (MQ=255) cAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCGGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGATGCTGAGCAGGCGCAGCGCATTGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAg < 6:355748/148‑1 (MQ=255) cAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAgg < 4:371349/149‑1 (MQ=255) cacaTGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCAc > 4:125596/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAg > 1:335461/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGt > 1:289636/1‑148 (MQ=255) cAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTtctc > 4:147987/1‑129 (MQ=255) cAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTg < 4:369744/148‑1 (MQ=255) cAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGa < 6:401248/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGTTGCCGGTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTtctc < 3:147987/129‑1 (MQ=255) aGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGaa < 7:46047/149‑1 (MQ=255) gggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTg > 5:145000‑M2/8‑144 (MQ=255) gggttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGAAGAt < 2:347503‑M2/142‑1 (MQ=255) gttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTa > 8:94092‑M2/6‑132 (MQ=255) gttgcCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTa < 7:94092‑M2/127‑1 (MQ=255) cCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGAAGATCACGa < 6:164157‑M2/147‑1 (MQ=255) | GCTTTCAGCGACAGCGCGGCGGCCTCGAACTCGCCGTCGAGCTGGCGCAGGGCGGTGGTCGCGGTCATCTGCGCGGTGGTCAGGTAATGGGCAATGGTGCACACCACCAGCAACCCCATGCCGCCGTACAGCACATGCAGCGGGTTGCCGTTCAGGTTGAAGAAGAATACGTAGCCCAGGCCCAGTACCAGGCCCGGCACGGCCATGGGGATGAAGCTGAGCAGGCGCAGCGCATGGTTGAGCAGGCGTTGGCCCTGGGTCTTCTCCATCAGGTAGGCACCAGTGAAGATCACGA > NC_002947/5860314‑5860608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |