| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GGGCCGGGTTGGCTGAAAGTGCCGCTGTACCCGCACCCATTGCGTGGGCAGAAGATCTGGAACGTGCTGGGCTGGTTCCTGGCCATTGGCTTGTTGTCCACCGCCTCGGCGTGGATTTTTGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGTGAGTTG > NC_002947/302214‑302507 | gggCCGGGTTGGCTGAAAGTGCCGCTGTACCCGCACCCATTGCGTGGGCAGAAGATCTGGAACGTGCTGGGCTGGTTCCTGGCCATTGGCTTGTTGTCCACCGCCTCGGCGTGGATTTTTGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAAc < 2:253783/148‑1 (MQ=255) ggCCGGGTTGGCTGAAAGTGCCGCTGTACCCGCACCCATTGCGTGGGCAGAAGATCTGGAACGTGCTGGGCTGGTTCCTGGCCATTGGCTTGTTGTCCACCGCCTCGGCGTGGATTTTTGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGc > 3:363590/1‑149 (MQ=255) ttcagcaaggacagcgacagacgcaggcgcgtcagaggcgtgcgcaagtcgtgggaaaccccggccagcatcaactcacgctcgcgcccggcctgctcgacatcctcggccatctggttgaacgccttgtacacctcggtcatctCGCt < 7:74400‑M1/4‑1 (MQ=255) ccGGGTTGGCTGAAAGTGCCGCTGTACCCGCACCCATTGCGTGGGCAGAAGATCTGGAACGTGCTGGGCTGGTTCCTGGCCATTGGCTTGTTGTCCACCGCCTCGGCGTGGATTTTTGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCtt 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6:71262/148‑1 (MQ=255) ttGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTc > 1:63847/1‑149 (MQ=255) gTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTc > 5:318714/1‑147 (MQ=255) gTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCg < 7:289451/148‑1 (MQ=255) cGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGc < 4:109149/148‑1 (MQ=255) cGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGc < 8:215005/148‑1 (MQ=255) cGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCa < 2:272981/149‑1 (MQ=255) aGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGc < 2:4075/148‑1 (MQ=255) cAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGgc > 3:190615/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCggg < 4:21515/147‑1 (MQ=255) cAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGgcgc > 6:306011/1‑147 (MQ=255) cAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGa < 7:40141/149‑1 (MQ=255) cAGCCGATCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCGAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATTCCGCCTGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCTAGCAGGCCGGGCGCGa < 2:429628/149‑1 (MQ=255) cGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGt > 6:423441/1‑149 (MQ=255) cTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGt > 2:99269/1‑147 (MQ=255) cTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGt > 3:165144/1‑147 (MQ=255) cTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGt > 3:326302/1‑147 (MQ=255) cTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGTGa < 4:326302/149‑1 (MQ=255) cTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGCTGTACAAGGCGTTAAACAAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGGGAGCGt > 6:70631/1‑147 (MQ=255) aaaCGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGTGAGtt < 1:50394/149‑1 (MQ=255) aaCGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGTGAGTTg < 8:266884/149‑1 (MQ=255) | GGGCCGGGTTGGCTGAAAGTGCCGCTGTACCCGCACCCATTGCGTGGGCAGAAGATCTGGAACGTGCTGGGCTGGTTCCTGGCCATTGGCTTGTTGTCCACCGCCTCGGCGTGGATTTTTGTACGTCAGCTCAACCAGCCGCTCAAACGCTTGGTGTTCGCCGCCCGCCAGCTTGGCCAGGGGCGCAGTGTGCGCCTGCCGATCAGCGATACCCCCAGCGAGATGACCGAGGTGTACAAGGCGTTCAACCAGATGGCCGAGGATGTCGAGCAGGCCGGGCGCGAGCGTGAGTTG > NC_002947/302214‑302507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |