New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGGCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGG > NC_002947/521874‑522167 | cagtctgcacagcaaagtcagcaatctcgaaaccattcgcctgaccaaaaccgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgccc > 7:409567‑M1/147‑149 (MQ=255) ggCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCTGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCa < 3:388985/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCCCCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAAcc > 6:105086/1‑147 (MQ=255) agtctgcacagcaaagtcagcaatctcgaaaccattcgcctgaccaaaaccgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgcc < 1:79343‑M1/2‑1 (MQ=255) cAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAg > 1:9347/1‑148 (MQ=255) aGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑a < 5:85894/149‑1 (MQ=255) tgtAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑Acg < 2:337611/149‑1 (MQ=255) ttttGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGcc < 3:261661/149‑1 (MQ=255) tGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCAt < 8:146206/148‑1 (MQ=255) ccGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTc > 3:386155/1‑149 (MQ=255) ccGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTc > 2:345005/1‑149 (MQ=255) cgaggTTGGTGAAGCGCGCAGAGATGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTcc < 6:344628/146‑1 (MQ=255) ggTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATg < 2:9347/149‑1 (MQ=255) 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cTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCAc > 7:356848/1‑149 (MQ=255) tgtgtaGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACgg < 2:427775/143‑1 (MQ=255) tgCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACgg < 4:416458/148‑1 (MQ=255) tgCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACg < 4:22294/147‑1 (MQ=255) gAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTg > 1:171966/1‑148 (MQ=255) aaGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGaa < 1:84165/149‑1 (MQ=255) aaGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGaa < 2:346182/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTCCGTATCACCGCCTTGCTGATTTCACGGTTGAAg > 6:70092/1‑149 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCTGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGgtgt < 6:342079/149‑1 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACg < 8:352108/138‑1 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACg > 7:352108/1‑138 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGgtgt < 6:324499/149‑1 (MQ=255) tGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAg > 6:35408/1‑149 (MQ=255) tCCCAGC‑AAGCGGGCTATGTCCATTGTCATGCTGTGGGACAGGGCGGCGCGCTGGGCGGAAGGAGACAGCGAGCTCTTGATCACGCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTg > 5:193130‑M1/2‑148 (MQ=255) aCCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTgg > 6:197337/1‑149 (MQ=255) | CGGCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGG > NC_002947/521874‑522167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |