New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACTGGC > NC_002947/521927‑522222 | gTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGc < 1:110679/149‑1 (MQ=255) gTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGc < 6:84960/149‑1 (MQ=255) ccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGc > 2:380556‑M1/94‑149 (MQ=255) 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cgacCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCa < 5:67751/149‑1 (MQ=255) cTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACa > 7:126255/1‑149 (MQ=255) gCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAg < 8:247017/147‑1 (MQ=255) gCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGc < 4:349256/148‑1 (MQ=255) ccatccatCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGc > 3:22294/1‑147 (MQ=255) 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tCCATGGTCATGGTGTGGGACAGGGCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGTGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGatt < 2:2669/149‑3 (MQ=255) cacagcatgaccatggacatggcccgcgtgctgggCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATgg < 2:88992‑M2/114‑1 (MQ=255) cATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATgg > 2:79343/1‑149 (MQ=255) tCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTc > 4:320713/1‑148 (MQ=255) cATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTAGCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGGGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCga < 2:20037/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCGGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCga < 4:295862/148‑1 (MQ=255) cTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGAtt < 3:217161/149‑1 (MQ=255) tgtgGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGAtt > 7:314073/1‑148 (MQ=255) tgtgGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTg > 6:215494/1‑149 (MQ=255) tgtgGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTg < 3:320713/149‑1 (MQ=255) tgGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCt < 6:395757/149‑1 (MQ=255) ggACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGa < 5:62664/149‑1 (MQ=255) gACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGAc > 7:387931/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTg < 7:184916/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAACGGTTTCGAGATTGCTGACTTTg < 7:66315/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGc < 7:194224/108‑1 (MQ=255) gCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGc > 8:194224/1‑108 (MQ=255) gCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGc > 4:133244/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTCGGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGc < 1:308850/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCt < 5:244585/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCt > 6:217351/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGttt > 6:435435/1‑111 (MQ=255) gcgcgcTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCtgtg < 5:392697/149‑1 (MQ=255) gggCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACTg > 7:409567‑M2/4‑149 (MQ=255) ggCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACt < 1:79343‑M2/145‑1 (MQ=255) gCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACTGGc < 8:356848‑M2/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACTGGc > 7:213029/1‑148 (MQ=255) | GTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGC‑ACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTT‑GGCGGTTTTGGTCAGGCGAATGGTTTCGAGATTGCTGACTTTGCTGTGCAGACTGGC > NC_002947/521927‑522222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |