| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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AAAACTCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTCGGCAG > NC_002947/641090‑641385 | aaaaCTCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCG > 1:66260‑M1/1‑149 (MQ=255) cacttCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGc < 1:157413/145‑1 (MQ=255) aagcTCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGc < 2:212423/146‑1 (MQ=255) aCTCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCAc < 7:137710/149‑1 (MQ=255) tCACATCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCt > 4:332727/1‑149 (MQ=255) acaTCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGc < 4:119832/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAg > 2:83161/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGc < 6:115448/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGc < 8:371731/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCCAGCCCAGCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGcc > 5:134665/1‑149 (MQ=255) cccagcccagCAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGgc < 8:53197/149‑1 (MQ=255) ccagcccagcAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCACCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCCCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCCCCTGCAGCCTTGgcg > 7:350430/1‑149 (MQ=255) cagcccagcAGTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGgcgc < 3:25006/149‑1 (MQ=255) gcagTCAGTGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACatgat > 6:177482/1‑149 (MQ=255) cagtcagtGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACatgatg < 6:134665/149‑1 (MQ=255) cagtcagtGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACatgatg > 8:241408/1‑149 (MQ=255) tcagtGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTg > 5:156356/1‑149 (MQ=255) gtGCGCGGATTTCCGCCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGca > 5:101368/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |