| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 641238 | 59 (0.820) | 4 (0.060) | 4/260 | NT | 5.6% | coding (614/1089 nt) | bdhA | 2,3‑butanediol dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 641283 | 77 (1.110) | coding (569/1089 nt) | bdhA | 2,3‑butanediol dehydrogenase | |||||
CCAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTCGGCAGGGAAGCCCTGCGGCAGCCGGTAGAGCAGGTTGGCGGGCACGT > NC_002947/641137‑641427 | ccAGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCcg > 6:101368‑M2/1‑147 (MQ=255) aGGGCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCcggc > 1:172681‑M2/1‑145 (MQ=255) gggCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGcc > 6:250685/1‑149 (MQ=255) gggCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGcc < 1:83161/149‑1 (MQ=255) gCATCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGcccc < 7:241408/149‑1 (MQ=255) tCGCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAAc < 5:177482/149‑1 (MQ=255) gCACTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGTCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCa < 3:230980/149‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCc > 5:81430‑M2/1‑135 (MQ=255) aCTGGCTGGGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCc < 6:81430‑M2/136‑2 (MQ=255) tggGGTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACg > 3:25665/1‑149 (MQ=255) gggTCCAGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGt > 6:211853/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGttt > 4:100797/1‑149 (MQ=255) ggCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGccc < 3:100797/148‑1 (MQ=255) aGCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACCTCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGcc > 3:109031/1‑148 (MQ=255) gCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGccc > 5:218248/1‑148 (MQ=255) gCACCACGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGccc > 3:82147/1‑148 (MQ=255) accacGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAg > 4:46902/1‑149 (MQ=255) ccacGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAg > 8:169118/1‑148 (MQ=255) ccacGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGc < 2:146834/149‑1 (MQ=255) cacGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCGCAAg > 7:80547/1‑147 (MQ=255) cGTTGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCGACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAgg > 6:17660/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTg > 4:343785/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGTGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGcc > 4:383486/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTTGGCCTTGGCTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCtt > 5:167513/1‑149 (MQ=255) cttggccttggcTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTc < 2:66260/148‑1 (MQ=255) ttggcgttggcTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCATCACCTGCCGCCTTGGCTAACATGATGGTGCACAGGCCGAGGGTTCCGGCCCCAGCCTCTACAACGGTATGACCAAGCAGGCTGCGGGCCttttagct > 4:311062/1‑145 (MQ=255) ttggccttggcTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCttt < 3:311062/144‑1 (MQ=255) cttggcTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTACCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGt > 7:311037/1‑149 (MQ=255) ggcTTTGGGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGc < 5:211853/148‑1 (MQ=255) gcTTTGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCTGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCa > 5:123296/1‑148 (MQ=255) ttGCGCGCAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATAcc > 7:107578/1‑149 (MQ=255) gcgcAGAGGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCAGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCAcc > 5:397156/1‑149 (MQ=255) agagGACATCTCAAGGGCGATGACCTGTGCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGcc > 3:75531/1‑148 (MQ=255) 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tgtgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTc > 6:337445/1‑149 (MQ=255) tgtgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACAAGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTc > 1:245577/1‑149 (MQ=255) tgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCt < 2:231500/95‑1 (MQ=255) tgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTCgg > 3:101679/1‑149 (MQ=255) tgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTCgg < 4:101679/149‑1 (MQ=255) tgCCGCACCTGCAGCCTTGGCGCACATGATGGTGCACAGGCCGATGGTGCCGGCCCCAACCACTACAACGGTTTGCCCAAGCAGGCTGCCGGCCTTTTTCACCGCGTGCATACCCACCGCCAGCGGCTCGATCAGTGCCCCGGCTTCgg < 5:337445/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |